مسمومیت غذایی ناشی از کلستریدیوم بوتولینوم از مهمترین مسمومیتجهای غذایی است که در اثر مصرف مواد غذایی آلوده به ویژه فرآوردهجهای دریایی، انواع غذاهای کنسرو شده گیاهی و گوشتی و فرآورده های لبنی ایجاد می شود. بنابراین در این مطالعه تعداد 120 نمونه ماهی، 60 نمونه عسل، 80 نمونه کشک و 80 نمونه دوغ انتخاب شد. شناسایی بوتولیسم بر اساس جداسازی کلستریدیوم بوتولینوم و اگزوتوکسین های تولید شده صورت می گیرد. سروتیپ های e ,b ,a و f مهمترین تیپ های میکروارگانیسم بیماری زای انسانی است. هدف مطالعه حاضر بررسی مواد غذایی به عنوان پتانسیلی برای ایجاد مسمومیت غذایی و همچنین مقایسه روش های کشت، سنجش زیستی موش و pcr در شناسایی این میکروارگانیسم است. برای گروه های مختلف فنوتیپکی باکتری، محیط های tpgy و گوشت پخته جهت غنی سازی انتخاب گردید. روش mpcr برای تفریق تیپ های مختلف میکروارگانیسم به کار رفت. از پرایمرهای اختصاصی برای pcr استفاده شد و تحقیقات پیشین این روش را تکنیکی سریع و باارزش برای تشخیص تیپ های a(782جفت باز)، b (205 جفت باز) و e (389 جفت باز) معرفی کردند. از مجموع 340 نمونه با استفاده از روش mpcr، 10 مورد مثبت و از کشت فقط 4 مورد مثبت جداسازی شد که اختلاف معنی داری را نشان می دهد (p<0.05). نتایج این مطالعه نشان می دهد که روش مولکولی برای استفاده در آزمایشگاه های غذایی، جهت تشخیص کلستریدیوم بوتولینوم و سموم آن، روشی قابل اطمینان است.