مقدمه: جهت لقاح، پروتئین سطحی اسپرم به نام "IZUMO” به عنوان لیگاند برای میانکنش با JUNO (یا رسپتور ایزومو(IZUMO1R)) ضروری است. میانکنش:IZUMO1R/JUNOIZOMO1 یک مرحله حیاتی چسبندگی بین اسپرم و اووسیت در اتصال و فیوژن غشای پلاسمائی است البته جهت فیوژن سلولی کافی نمی‌باشد و پذیرنده‌های دیگری نیز در این اتصال نقش دارند. در این تحقیق G protein-coupled receptor 15 (GPR15) به عنوان شریک دیگر میانکنش اسپر...

طراحی یا اکتشاف، سنتز یا جداسازی، و در نهایت آزمایش در موجودات زنده سه مرحله اساسی تولید داروهای جدید را تشکیل میدهد. عموما انجام دو مرحله اول را شیمیدانان و مرحله سوم را بیوشیمیدانان و پزشکان بر عهده میگیرند. به منظور ورود به دو حیطه اول در پروژه اول سعی شد از طریق طراحی و سنتز کاتالیست جدید و کارآمد مایع یونی 1-بوتیل 3-متیل ایمیدازولیوم زیرکونیل کلرید گامی در جهت بهبودی سنتز یکی از خانوادههای...

توسعه و ایجاد یک مدل پیشگویانه برپایه ساختار با استفاده از روش رگرسیون خطی چندگانه براساس اجماع چندین روش داکینگ متفاوت (autodock vina, gold, flexx, surflex and glide) و توصیف کننده های حاصل از نتایج آن ها مورد مطالعه قرار گرفت. رابطه کمی ساختار-فعالیت میان فعالیت بازدارندگی 26 بازدارنده tmk استافیلوکوکوس اورئوس با توصیف کننده های داکینگ ایجاد گشت. برای اطمینان از توانایی پیشگویی مدل، مدل qsar ...

تابع نیروی دانش پایه نوعی از توابع نمره دهی می باشد که از آن در زمینه تشخیص فولد پروتئین ها با موفقیت قابل توجهی استفاده شده است. ما در این مطالعه کارایی نوعی تابع انرژی دانش پایه و تابع نیروی هم ارز آن را در تشخیص کمپلکس های درست پروتئین-پروتئین از کمپلکس های نادرست، با یکدیگر مقایسه کردیم. مقدار نیروی کل که از یک جزء کمپلکس (گیرنده/لیگاند) بر جزء دیگر وارد می شود به عنوان معیار پایداری کمپلکس...

سوپراکسیددیسموتاز (sods) یکی از مهمترین آنتی اکسیدانهائی است که از سلولها در مقابل آسیب های ناشی از استرس اکسیداتیو محافظت می کند. در این میان یافتن ترکیبات شیمیایی تازه ای که توانائی فعال سازی این آنزیم را داشته باشد از اهمیت زیادی برخوردار است. لذا در این پژوهش از رویکرد محاسباتی جهت یافتن محرک های جدید آنزیم sod استفاده گردیده است. در این بررسی برروی 15 ترکیب شیمیایی سنتز شده توسط soulére e...

فتوپروتئینهای وابسته به یون کلسیم از دو خانواده کتنوفور (شانه داران) و کلنترات (کیسه تنان) با وجود تشابه ساختاری بالا، میزان تشابه آمینواسیدی بسیار پایینی دارند. در فتوپروتئینهای کلنترات، حفره اتصال به کلنترازین شدیداً آبگریز و دور از دسترس حلال است و اگرچه هیچ آمینواسید بارداری دیده نمیشود، حضور یک باقیمانده دارای بار مثبت، یعنی آرژنین 39 (در نمیوپسین)، در این حفره در فتوپروتئینهای کتنوفور بسیا...

مطابق نظریه ی آمیلویید، علّت آسیب دیدن سلول های عصبی سیستم اعصاب مرکزی در بیماران آلزایمری، تجمّع و تشکیل توده های پروتیین آمیلوییدبتا است. بدین منوال، تجزیه ی صفحه های بتا در مرحله ی ابتدایی این فرایند به عنوان یک روش درمان مناسب برای این بیماری پیشنهاد می شود. دارویی که درین تحقیق مطابق همین هدف استفاده شده، پنج پپتید جداشده از پایانه ی کربوکسیل آمیلوییدبتا با توالی گلیسین، لوسین، متیونین، والی...

ویروس htlv-1 از خانواده رتروویروس ها می باشد و باعث ایجاد بیماری هایی نظیر لوسمی t-cell بزرگسالان (atl) ، تشنج گرمسیری فلج کننده (ham/tsp ) و اختلالات عصبی می گردد. پروتئین پروتئاز یکی از مهمترین آنزیم های ویروسی بشمار می رود و با مهار آن می توان از ادامه چرخه آلودگی این ویروس جلوگیری بعمل آورد. سری جدیدی از مهار کننده ها را ایجاد گردید و با استفاده از ابزارهای محاسباتی نحوه اتصال آن ها به پروت...

زمینه و هدف : ویروس htlv-1 جز خانواده رتروویروس ها می باشد ، این ویروس در انسان باعث ایجاد بیماری هایی نظیر لوسمی t-cell بزرگسالان (atl )، ham/tsp و ... می گردد . یکی از پروتئین های مهم در این ویروس پروتئاز است که برای بلوغ ویروس نیز ضروری می باشد .مهارکننده هایی که تاکنون برای پروتئاز ساخته شده اند ،فعالیت مناسبی را از خود نشان نداده اند .در این مطالعه سری جدیدی از مهار کننده ها ایجاد و با است...

مقدمه: از آن جا که داروهای سنتزی ضد فشار خون دارای اثرات جانبی است، استخراج پپتیدهای ضد فشار خون از منابع طبیعی فاقد اثرات جانبی مورد نیاز است. هدف از این تحقیق، شناسایی پپتید حاصل از هیدرولیز آنزیمی پروتئین های تخم شترمرغ و مطالعه ی اثرات مهار کنندگی آن بر آنزیم تبدیل کننده ی آنژیوتانسین - 1 بود. روش ها: هیدرولیز آنزیمی پروتئین های تخم شترمرغ با استفاده از آنزیم های پپسین و پانکراتین انجام شد....