بررسی انتقال الکترون در dna با استفاده از روش های مختلف الکتروشیمیایی

پایان نامه
چکیده

در این رساله، به منظور تشخیص جهش¬های تک نقطه ای تک باز در dna، دو بیوسنسور dna عامل دار شده با ردیاب الکتروفعال دی¬ هیدورکسی بنزوئیک اسید و فروسن کربوکسیلیک اسید در انتهای رشته dna از طریق پیوند کووالانسی و تشکیل فیلم تک لایه آرایش یافته dna روی الکترود طلا طراحی گردید. با دنبال کردن سیگنال دی هیدروکسی بنزوئیک اسید و فروسن کربوکسیلیک اسید ، با روشهای مختلف الکتروشیمیایی برای توالی¬های مختلف dna ، مشاهده شد که حضور جهش نقطه ای تک باز به علت ایجاد اختلال در مسیر انتقال بار از dna به ردیاب های کووالان شده به dna، موجب کاهش سیگنال الکتروشیمیایی آنها در مقایسه با توالی مکمل dna می¬شود. در ادامه به منظور بررسی تاثیر جهش نقطه¬ای در سرعت انتقال بار در dna دو رشته¬ای عامل¬دار شده با فروسن کربوکسیلیک اسید، مطالعات سینتیکی با استفاده از تکنیک میکروسکوپ الکتروشیمیایی روبشی (secm) صورت گرفت. حضور و نوع جهش نقطه¬ای تک باز با دنبال کردن جریان بازخورد فری سیانید روی فیلم dna عامل¬دار شده با فروسن کربوکسیلیک اسید قابل تشخیص است. داده های استخراجی از این مطالعات نشان میدهد حضور جهش نقطه¬ای منجر به کاهش ثابت سرعت انتقال الکترون در dna می¬شود و در نتیجه بیوسنسور طراحی شده قادر به تشخیص رشته مکمل dna از جهشهای نقطه¬ای پایدار ترمودینامیکی (ga و gt) و تشخیص جهش های نقطه¬ای پایدار ترمودینامیکی از جهش¬های ناپایدار نظیر (ca، ct) می¬باشد. در مطالعه سوم، به منظور تشخیص همزمان حالت¬های ممکن جهش های نقطه ای dna، از مزایای نانوتکنولوژی برای نیل به این هدف بهره جستیم. در این بخش از bsa به عنوان قالب زیستی (bio-template) مناسب برای سنتز نانوکلاستر های فلزی مختلفی از قبیلco، ru، mn،fe ،cd ،cu pb، و ni استفاده کردیم و موفق به سنتز این نانوکلاسترها شدیم. سنتز بسیاری از این نانوکلاسترهای فلزی برای اولین بار بود که در بستر bsa صورت می گرفت. برای شناسایی نانوکلاسترهای سنتزی از مجموعه وسیعی از روشهای شناسایی نظیر فلورسانی، جذب فرابنفش، جذب مادون قرمز، تفرق نور دینامیکی، اندازه¬گیری زتای پتانسیل، اسپکتروسکوپی رامان، سیرکولار دیکرویزم استفاده گردید که یافته¬های حاصل از مجموعه روش¬های شناسایی سنتز موفقیت آمیز نانوکلاسترهای فلزی را در قالب bsa تایید می¬کند. برای تشخیص همزمان هر یک از هشت حالت ممکن جهش های نقطه ای از نانو کلاسترهای فلزی سنتز شده به عنوان برچسب الکتروشیمیایی استفاده شد. بدین منظور، نانوکلاسترهای فلزی مس، نیکل، کادمیم و سرب به ترتیب به نوکلئوبازهای آدنین، سیتوزین، گوانین و تیمین کانجوگه می¬شود. سپس نوکلئوبازهای متصل شده به نانوکلاسترهای فلزی در قالب bsa به محلهای اتصال جهش نقطه¬ای تک باز کوپل می¬شود. آنالیز الکتروشیمیایی عاری سازی نانوکلاسترهای فلزی و ظاهر شدن پیک الکتروشیمیایی فلزات در پتانسیل مشخص و مجزا امکان تشخیص هر هشت جهش نقطه¬ای تک باز را فراهم می¬کند. کارایی تجزیه¬ای روش طراحی شده برای اندازه¬گیری غلظت جهش نقطه¬ای aa با کد الکتروشیمیایی سرب، به¬کار گرفته شد که داده¬های حاصل از منحنی کالیبراسیون، وابستگی میزان سیگنال سرب به غلظت جهش aa را با حد تشخیص کمتر از 100اتومولار را نشان می¬دهد.

منابع مشابه

اثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین

Background: Diabetes mellitus increases the risk of central nervous system (CNS) disorders such as stroke, seizures, dementia, and cognitive impairment. Berberine, a natural isoquinolne alkaloid, is reported to exhibit beneficial effect in various neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. Moreover astrocytes are proving critical for normal CNS function, and alterations in their activity...

متن کامل

اثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین

Background: Diabetes mellitus increases the risk of central nervous system (CNS) disorders such as stroke, seizures, dementia, and cognitive impairment. Berberine, a natural isoquinolne alkaloid, is reported to exhibit beneficial effect in various neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. Moreover astrocytes are proving critical for normal CNS function, and alterations in their activity...

متن کامل

ارزیابی روش های مختلف استخراج DNA از کیست ژیاردیا لامبلیا

Background and purpose: Giardia lamblia (G.lamblia) is one of flagellated protozoan pathogens. Giardiasis is the most common human parasite infection in the world, causing a lengthy course of diarrhea. The aim of the present study was to compare five different methods of DNA extraction from G.Lamblia cyst and determining the most efficient DNA extraction method. Materials and methods: This stu...

متن کامل

اندازه گیری هیدروکربن های آروماتیک چند حلقه ای در منابع آبی با استفاده از زیست حسگر الکتروشیمیایی (DNA)

Background and Objectives: Polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) are widespread environmental contaminants in aquatic environments. These contaminants are generated through oil spills, manufactory processes, and industrial wastes or naturally through the incomplete combustion of coal, oil, gas, and wood waste. Most of these compounds are noted as carcinogenic and mutagenic. Therefore, detecti...

متن کامل

مقایسه دو روش PCR مستقیم و PCR با استفاده از روش استخراج DNA در تعیین تیپ‌های مختلف کلستریدیوم پرفرینجنس

     واکنش زنجیره‌ای پلیمراز (PCR) یک روش مناسب برای شناسایی عوامل بیماری‌زا محسوب می‌شود و جداسازی DNA اولین گام در این مسیر است.  استخراج DNA یک مرحله وقت‌گیر در تحقیقات ژنتیک مولکولی به شمار می‌آید که در بعضی موارد از کل مراحل انجام PCR طولانی‌تر است.  هدف از انجام این تحقیق، استفاده از PCR مستقیم (بدون استخراج DNA) جهت تعیین تیپ‌های مختلف باکتری کلستریدیوم پرفرینجنس می‌باشد.  در ای...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس - دانشکده علوم پایه

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023