ارزیابی تنوع ژنتیکی در ارقام برنج با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره

نویسندگان

دینا کبریایی

محمدحسین رضادوست

مجتبی کردرستمی

حبیب الله سمیع زاده لاهیجی

چکیده

به­منظور مطالعه تنوع ژنتیکی ژرم پلاسم، 74 ژنوتیپ برنج انتخاب شده و با استفاده از 56 جفت آغازگر ssr مورد تجزیه قرار گرفتند. تمامی آغازگرها مناطقی از ژنوم برنج را تکثیر نمودند که در مجموع 399 آلل چندشکل با میانگین 13/7 آلل به ازای هر جایگاه ریزماهواره در ژنوتیپ ها تکثیر شد. نشانگرهای rm16، rm3355 و rm8006 با 10 آلل بیشترین تعداد آلل را دارا بودند. میزان اطلاعات چندشکلی برای نشانگرهای مورد بررسی از 56/0 تا 87/0 با میانگین 79/0 متغیر بود. تجزیه خوشه ای براساس ضریب تشابه جاکارد با استفاده از روش upgma، تمامی ژنوتیپ ها را در چهار گروه قرار داد و درصد صحت گروه بندی افراد براساس تابع تشخیص 6/98 درصد بود.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

استفاده از نشانگرهای ریزماهواره . Pistacia khinjuk Stocks برای ارزیابی تنوع ژنتیکی ارقام تجاری پسته ایرانی

Microsatellite DNA markers isolated from wild species khinjuk (Pistacia khinjuk Stocks.) were used to evaluate the genetic diversity available in Iranian pistachio cultivars. Out of the 27 SSR primers tested initially, 25 could amplify the DNA in different pistachio cultivars, of which 19 primer pairs produced clear bands. Based on the amplification profiles of the genotypes by the remaining pr...

متن کامل

بررسی تنوع ژنتیکی ارقام برنج ایرانی با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره پیوسته با ژن های مقاومت به خشکی

چکیدهاین تحقیق به منظور بررسی تنوع ژنتیکی مجموعه ای از 20 رقم برنج ایرانی، با استفاده از 19 نشانگر ریز ماهواره پیوسته با ژنهای کنترل¬کننده تحمل به خشکی، انجام گرفت. همچنین شاخص مقاومت به خشکی به عنوان یک صفت تکمیلی مهم در مرحله رسیدگی دانه در 20 رقم و دو محیط (تحت تنش و بدون تنش) ، مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج تجزیه واریانس مرکب نشان داد که بین ژنوتیپ¬ها از لحاظ صفت شاخص مقاومت به خشکی، اختلاف...

متن کامل

بررسی تنوع ژنتیکی ارقام برنج ایرانی با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره پیوسته با ژن های مقاومت به خشکی

چکیدهاین تحقیق به منظور بررسی تنوع ژنتیکی مجموعه ای از 20 رقم برنج ایرانی، با استفاده از 19 نشانگر ریز ماهواره پیوسته با ژنهای کنترل¬کننده تحمل به خشکی، انجام گرفت. همچنین شاخص مقاومت به خشکی به عنوان یک صفت تکمیلی مهم در مرحله رسیدگی دانه در 20 رقم و دو محیط (تحت تنش و بدون تنش) ، مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج تجزیه واریانس مرکب نشان داد که بین ژنوتیپ¬ها از لحاظ صفت شاخص مقاومت به خشکی، اختلاف...

متن کامل

استفاده از نشانگرهای ریزماهواره . Pistacia khinjuk Stocks برای ارزیابی تنوع ژنتیکی ارقام تجاری پسته ایرانی

Microsatellite DNA markers isolated from wild species khinjuk (Pistacia khinjuk Stocks.) were used to evaluate the genetic diversity available in Iranian pistachio cultivars. Out of the 27 SSR primers tested initially, 25 could amplify the DNA in different pistachio cultivars, of which 19 primer pairs produced clear bands. Based on the amplification profiles of the genotypes by the remaining pr...

متن کامل

بررسی تنوع مرفولوژیک و ژنتیکی ارقام برنج با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره مرتبط با صفات تحمل به خشکی

در این مطالعه، تنوع مرفولوژیک و ژنتیکی 32 ژنوتیپ برنج با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره پیوسته با QTLهای کنترل کننده صفات تحمل به خشکی مورد ارزیابی قرار گرفتند. تعداد کل نوارهای تولید شده به وسیله هر یک از نشانگرها در محدوده 3 نوار در مکان RM317 تا 8 نوار در مکان­های RM3، RM228 و RM231 متغیر بود. نشانگر RM317 از نظر تعداد آلل موثر، تنوع ژنی نی، شاخص اطلاعات شانون و محتوای اطلاعات چند شکل (PIC)...

متن کامل

تنوع ژنتیکی کلون‌های زیتون ارقام زرد و روغنی با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره

به منظور بررسی تنوع ژنتیکی کلون‌های ارقام زرد و روغنی زیتون، ابتدا صفات مورفولوژیک 29 کلون از این دو رقم شامل شانزده صفت کمی و نوزده صفت کیفی مورد بررسی قرار گرفت، سپس از نشانگرهای ریزماهواره جهت بررسی دقیق‌تر این کلون‌ها و تعیین میزان چندشکلی آن‌ها استفاده شد. با استفاده از 18 نشانگر، در مجموع 52 آلل تکثیر شد که 46 آلل چند شکل بودند. متوسط تعداد آلل در هر لوکوس 944/2 و بیشترین و کمترین میزان ه...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید


عنوان ژورنال:
دوفصلنامه فن آوری زیستی در کشاورزی(علمی-پژوهشی)

ناشر: دانشگاه بوعلی سینا

ISSN 1735-7446

دوره 4

شماره 2 2014

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023