مقاله

تفکیک سویه های کلینیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس با استفاده از پلی مورفیسم قطعه طولی محدود بر اساس ژن hsp۶۵

چکیده

زمینه و هدف: در سالهای اخیر، به کارگیری تکنیک pcr (polymerase chain reaction) و به دنبال آن آنالیز محصولpcr توسط آنزیمهای محدودالاثر (restriction fragment length polymorphism=rflp) برای افتراق مایکوباکتریومها تا سطح گونه، استفاده شده است. در حالی که جزئیات افتراقی گونههای غیرتوبرکلوزی مایکوباکتریومها توسط این تکنیک مشخص شده و حتی در تعدادی از آنها این روش برای پیگیری مولکولار اپیدمیولوژی اثبات شده است، تنها تعداد کمی از سویههای مایکوباکتریوم توبرکلوزیس مورد بررسی قرار گرفتهاند. مطالعه حاضر این متد افتراقی را برای سویههای جدا شده در مقیاس وسیعتر با هدف تعیین پلی مورفیسم احتمالی مورد ارزیابی قرار داد. روش بررسی: یکصد و پنجاه سویه کلینیکی از بیماران مراجعهکننده به مرکز سل اهواز جمعآوری شد. رنگآمیزی اسیدفست برای سویهها انجام گرفت، سپس سویهها به عنوان مایکوباکتریوم توبرکلوزیس توسط خصوصیات کشت و تستهای بیوشیمیایی دستهبندی شدند. تکنیک pcr-rflp با استفاده از dna ژنومی استخراج شده به دنبال pcr بر مبنای تکثیر قطعه bp439 از ژن hsp65 توسط پرایمرهای اختصاصی جنس مورد استفاده قرار گرفت. بعد از هضم محصولات pcr توسط آنزیمهای bsteii و haeiii آنالیز آنزیمی انجام گرفت. یافته ها: بر اساس نتایج بدست آمده، 145 سویه کلینیکی (6/96%) الگوهای یکسان شبیه به سویههای استاندارد مایکوباکتریوم توبرکلوزیس، برای haeiii فراگمنتهایی به طول 72/140/165 و برای bsteii به طول 82/120/250، نشان دادند. سه الگوی متفاوت در پنج سویه کلینیکی در الگوهای بدست آمده از هضم haeiii با فراگمنتهایی به طول 145/165 (سه سویه)، 80/100/180 (یک سویه) و 72/194 (یک سویه) مشاهده شد در حالی که الگوی بدست آمده از هضم bsteii این سویهها تنوع نداشت و شبیه به دیگر سویهها بود. نتیجهگیری: نتایج به دست آمده در این مطالعه نشان داد که در موارد نادر، پلیمورفیسمهایی در توالی ژن hsp65 سویه های کلینیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس ممکن است وجود داشته باشد.

اسناد مشابه