راه اندازی روش real-time pcr به منظور شناسایی مستقیم حساسیت به کلاریترومایسین در هلیکوباکتر پیلوری
چکیده
سابقه و هدف: مقاومت هلیکوباکتر پیلوری به کلاریترومایسین تا حد قابل توجهی باعث کاهش اثرات درمانی داروی مذکور گردیده است. هدف از این پژوهش ارزیابی روش مستقیم real-time pcr و مقایسه آن با روش دیسک دیفیوژن برای شناسایی مقاومت به کلاریترومایسین در هلیکوباکتر پیلوری می باشد. مواد و روش ها: این پژوهش به صورت تجربی برروی 45 نمونه بیوپسی تهیه شده از بیماران دارای اختلالات گوارشی انجام شد. در تمامی نمونه های مورد بررسی وجود هلیکوباکتر پیلوری با کشت، rut و pcr معمولی تایید گردید. همچنین مقاومت به کلاریترومایسین با استفاده از روش clsi (clinical and laboratory standard institute) و real-time pcr با استفاده از پروب اختصاصی ناحیه پپتیدیل ترانسفراز ژن 23s rrna هلیکوباکتر پیلوری انجام شد. یافته ها: با استفاده از روش دیسک دیفیوژن، 20 نمونه حساس (44/44%) و 25 نمونه مقاوم (56/55%) به کلاریترومایسین شناسایی گردید. اما با استفاده از روش real-time pcr در 20 نمونه ژنوتیپ مقاوم (44/44%)، 5 نمونه ژنوتیپ مخلوط (11/11%) و در 20 نمونه ژنوتیپ حساس (44/44%) به کلاریترومایسین شناسایی گردید. همچنین نتایج نشان داد که حساسیت این تکنیک برابر 40 باکتری یا 80 کپی از ژن 23s rrna می باشد. نتیجه گیری: نتایج نشان داد که روش real-time pcr دارای حساسیت و دقت مناسبی برای شناسایی مقاومت به کلاریترومایسین در کمترین زمان ممکن است.