خسرو خواجه
Theses
تولید آنزیم آلفا–آمیلاز مقاوم به ph اسیدی با سویه جدید bacillus sp. kr-8104 به روش تخمیر حالت جامد در یک بیوراکتور بستر آکنده و بررسی اثر متغیرهای عملیاتی
آنزیم های α-آمیلاز کاربرد وسیعی در صنایع غذایی، داروسازی، نساجی و شوینده دارند. α-آمیلازهای تولیدشده توسط منابع میکروبی مختلف دارای خواص آنزیمی متفاوتی می باشند. آنزیم α-آمیلاز تولید شده توسط سویه bacillus sp.kr-8104 وابسته به یون کلسیم نمی باشد و همچنین بیشترین فعالیت آن درمحدود
کلونینگ، ترادف، بیان و تعیین خصوصیات بیوشیمیایی آلفا آمیلاز حاصل از باسیلوس kra2
در مطالعات قبلی، آنزیمی به نام kra2-آمیلاز مستقل از کلسیم، از سویهbacillus sp. kra2 جداسازی شد. توالی نوکلئوتیدی ژن آنزیم kra2-آمیلاز و توالی اسید آمینه ای آن نشان داد که این آنزیم، به صورت پیش ساز آنزیمی سنتز می شود که دارای یک پپتید راهنما (33 اسید آمینه) و یک پروپپتید 11 اسید
کاربرد آنزیم ها در حفاظت و مرمت آثار تاریخی؛ نمونه عملی؛ استفاده از آنزیم آلفا-آمیلاز بر روی چسب نشاسته ای
آنزیم، فرآیند های آنزیمی و کاربرد آن در علوم مختلف، زیرمجموعه علوم زیستی یا بیوساینس می باشند. پس از مباحث میکروبیولوژی، بیولوژی، در سال های اخیر رشته نانوبیوتکنولوژی نیز به این مجموعه رشته ها در حوزه علوم زیستی اضافه گشته است. موارد کاربرد آنزیم ها بیشتر مرتبط با مبحث بیوشیمی می
مقایسه فعالیت-پایداری گلیکوزیل هیدرولازهای بومی ایران و بررسی افزایش کارایی به روش جهش زایی هدفدار
در این پروژه، مطالعاتی جهت بررسی فعالیت و پایداری حرارتی بر روی دو نوع آنزیم گلیکوزیل هیدرولاز به انجام رسید. ابتدا ژن کد کننده آنزیم آلفا-آمیلاز حاصل از باکتری بومی باسیلوس مگاتریوم who جداسازی شد. سپس به منظور تبیین نقش اسیدهای آمینه متصل شونده به کلسیم در پایداری حرارتی این آن
کلونینگ، بیان و تعیین خصوصیات آنزیم متیل گلی اکسال سنتاز از گونه thermus sp. gh5 و بررسی رفتار آلوستریکی آنزیم با جهش زایی هدفمند
آنزیم متیل گلی اکسال سنتاز (mgs) از گروه لیازها بوده و یک آنزیم متابولیسمی می باشد. این آنزیم با تبدیل دی هیدروکسی استون فسفات به متیل گلی اکسال گلیکولیز را از مسیر خویش منحرف می سازد. در این تحقیق ژن رمزدهی کننده mgs از گونه thermus sp. gh5 (tmgs) کلون، تعیین ترادف و بیان گردیده
افزایش کارایی متالوپروتئاز وابسته به روی(svp) در حضور حلال های آلی با استفاده از روش جهش زایی هدفمند
حلال های آلی با کندن مولکول های آب از سطح پروتئین باعث تخریب نیروهای غیر کووالان و کاهش فعالیت و پایداری آنزیم می شوند. این آنزیم از یک باکتری هالوفیل ایرانی که از دریاچه نمک جداسازی شده است، بدست آمده است. بر اساس نتایج تکامل جهت دار و کریستالوگرافی در حضور حلال های آلی، جهش یاف
بررسی مسیرهای بیوشیمیایی قارچ فوزاریوم اکسیسپروم به منظور افزایش بازدهی تولید نانوذرات نقره
چکیده برخی سامانه های زیستی مانند باکتری ها، مخمرها و قارچ ها توانائی تولید انواع نانوذرات را دارند. استفاده از ریزسازواره هایی مانند قارچ فوزاریوم اکسیسپروم که نانوذرات را در خارج از سلول ، به صورت پایدار، با توزیع اندازه ی ذرات مناسب، عاری از آلودگی شیمیایی و ایمن از لحاظ زیست
افزایش پایداری حرارتی و مقاومت در برابر هضم خودبه خودی(autodigestion) در آنزیم پروتئاز وابسته به روی(+zn2)به روش جهش زایی هدفدار
چکیده: پایدار سازی پروتئین نسبت به حرارت توام با بهبود فعالیت، با در نظر گرفتن رابطه ی بین فعالیت و عملکرد تا حدی مشکل به نظر می رسد. zn-متالو پروتئازها از اعضای خانواده ی پروتئازهای همولوگ هستند که نسبت به مقاومت دربرابر حرارت وهضم خودبه خودی با یکدیگر متفاوت هستند. موتاسیون های
تخلیص و تعیین ویژگیهای آنزیم های آمیلولیتیک سویه های بومی زانتوموناس جدا شده از خاک
گونه های زانتوموناس کمپستریس به کمک غربالگری از خاک کرج، ایران جدا سازی شدند. این گونه های جدا شده به وسیله روش نیمه کمی از نظر توانایی تولید آمیلاز مقایسه شدند که سرانجام گونه زانتوموناس کمپستریس sam0302 انتخاب شد. آمیلاز به کمک روش رسوبدهی با آمونیوم سولفات و کروماتوگرافی تعویض
استفاده از اکورین بعنوان آنزیم گزارشگر نوین: مطالعات جهش زایی و آنالیز سینتیک آن در شناسایی ترکیبات نیتروآروماتیک
اکورین فوتوپروتئینی است که اولین بار از نوعی عروس دریایی بنام aequoera victoria کشف شد، که قادر است از خود نور آبی رنگ ساطع نماید. بدلیل حساسیت بالای اکورین به غلظت کلسیم و با توجه به اینکه در این پروتئین، درصد سیگنال نسبت به نویز پس زمینه، بسیار بالا است ، از این فوتوپروتئین در
بررسی پروتئومیکس باکتری گرمادوست thermus sp gh5 از زیست بوم ایران در برابر شوکهای سرمایی
چکیده گرمادوست ها موجوداتی هستند که در دمای بالاتر از 45 درجه رشد می کنند و از نظر احتیاجات حیاتی به ترکیبات گوگردی احیاء و محیط های گرم نیاز دارند. اکثر ارگانیزم های گرمادوست از خاک ها و آب های حاوی عنصر گوگردی جداسازی شده اند که در اثر فعالیت های طبیعی زمین گرم هستند. این ارگان
کلونینگ،تعیین ترادف? بیان و بررسی خصوصیات بیوشیمیایی آنزیم لاکاز جداشده از یک سویه باسیلوسی
لاکازها (1.10.3.2 ;ec پارا دی فنول دی اکسیژن اکسیدوردوکتاز) بدلیل قابلیت اکسیداسیون طیف گسترده ای از ترکیبات فنولی کاربردهای زیادی در صنایع بیوتکنولوژی دارد. در این تحقیق ژن لاکاز از bacillus sp. hr03 بوسیله پرایمرهای کلونینگ تکثیر و سپس محصولات pcr در ناقل بیانی (pet21a) کلون و
بررسی مکانیسم اثر اسمولیت های ترهالوز و سوربیتول بر روی فعالیت و ساختارآنزیم لیپاز سودوموناس سپاسیا
لیپاز ها خانواده ای از آنزیم های هیدرولاز می باشند، که عمل هیدرولیز تری گلیسریدها به دی-گلیسریدها، مونوگلیسرید ها و گلیسرول را کاتالیز می کنند. این آنزیم ها در بسیاری از صنایع تولید مواد غذایی، چرمسازی، تولید مواد شوینده، تولید مواد شیمیایی، تصفیه فاضلاب، پزشکی و داروسازی کاربرد
بررسی خصوصیات سبنتیکی و ترمودینامیکی آنزیم سودوموناس فلوئورسانس لیپاز تحت تاثیر اسمولیت های پرولین، سوربیتول و اوره
چکیده لیپازها به عنوان یک گروه آنزیمی مهم باعث هیدورلیز و سنتز استرها می شوند. لیپاز سودوموناس فلوئورسانس یک نوع گرمادوست از لیپازها است که وزن مولکولی آن در حدود 33 کیلودالتون می باشد. در این پایان نامه در ابتدا مطالعات انجام گرفته به تاثیر پرولین و سوربیتول بر روی تغییرات فعالی
تولید آنتی بادی مونوکلونال موشی بر ضد آلفاآمیلازحاصل از باکتری بومی bacillus sp.kr8104
آنزیم آلفا آمیلاز از سویه باکتریایی bacillus sp.kr8104 از 422 اسید آمینه تشکیل شده و 48 کیلو دالتون جرم دارد. این آنزیم یک آنزیم ترشحی میباشد که توسط این سویه به فضای خارج سلولی ترشح میشود. این آنزیم دارای دو فرم بالغ و نابالغ می باشد. آیا آنزیم آمیلاز به صورت نابالغ توسط باکتری
بررسی نقش اسیدآمینه های موجود در سطح مشترک آکاربز-آلفاآمیلاز از گونه باسیلوس kr- 8104 در مهارآنزیم و اتصال آکاربز
چکیده: آکاربز یک داروی ضد دیابت است که هیدرولیز نشاسته توسط آلفا-آمیلاز را مهار می کند. بررسی مکانیسم مهار و اسیدهای آمینه درگیر در این مهار می تواند کمک شایانی به طراحی داروهای موثرتر مشتق از آکاربز کند. bacillus subtilis مقایسه توالی اسی دهای آمینه و ساختار کریستالوگرافی آنزیم
بررسی نقش پروپپتید انتهای کربوکسیل در ترشح bka (bacillus sp. kr8104 ?-amylase)
سویه bacillus sp. kr8104 آلفا-آمیلازی غیر وابسته به کلسیم تحت نام bka تولید و با کارایی بالا به محیط کشت خود ترشح میکند. کریستالوگرافی آنزیم خالصشده از محیط کشت پروتئینی با سه دمین عمومی آلفا-آمیلازها متشکل از 422 آمینو اسید را نشان میدهد. ژن این آنزیم پروتئینی با 659 آمینو اس
بررسی شاخص سطح انرژی (atp/adp ratio) و فعالیت کمپلکس i میتوکندریایی در بیماران مبتلا به als و کلونینگ و بررسی تغییرات توالی ژن sod1 در فرد سالم و فرد مبتلا به als
als (amyotrophic lateral sclerosis) یک بیماری از بین برنده نورون ها است که نشانه های بالینی آن ضعف پیشرونده عضلانی ، آتروفی ، و اسپاسم است که منعکس کننده انحطاط و مرگ نورون های حرکتی درقشر ، ساقه مغز و طناب نخاعی می باشد. علل مرگ نورون های حرکتی در als هنوز ناشناخته است اما اختلا
بررسی فعالیت آنزیم لاکاز وحشی و جهش یافته آن در جهت زیست پالایی ترکیبات فنلی
لاکازها (بنزن دیول اکسیژن اکسیدوردوکتاز ها، ec 1.10.3.2 ) در خانواده اکسیدازهای چند مسی هستند و در بسیاری از فرآیندهای زیست فناوری از قبیل حذف پلی فنل ها در نوشیدنی ها، رنگزدایی ، آنالیز دارو، ساخت ترکیبات شیمیایی و زیست پالایی ترکیبات فنلی استفاده می شود. فعالیت آنزیم لاکاز جدا
مطالعه ترمودینامیکی و سینتیکی آنزیم لیزوزیم در حضور نانومیله های طلا
ویژگی برجسته نانوذرات فلزی نجیب، دارا بودن خواص ساختاری، الکترونی، مغناطیسی و کاتالیستی منحصر بفرد و نیز قابلیت تنظیم خواص نوری با ایجاد تغییر در اندازه، شکل، ترکیب، ساختار و ناهمواری های سطحی می باشد. به همین دلیل ساخت هدفمند نانوذرات با شکل قابل کنترل، توجه ویژه محققان امروز را
جداسازی و تخلیص آنزیم لیپاز باکتریایی از سودوموناس گونه ایرانی و مطالعه ساختاری و ترمودینامیکی و پایداری آنزیم در حضور برخی یونهای فلزی دوظرفیتی و حلالهای آلی
با توجه به کاربرد فراوان آنزیمهای لیپولیتیک بخصوص لیپاز باکتریایی در صنایع غذایی، دارویی و بهداشتی از یک طرف و قیمت بالای آن از طرف دیگر، جهت رفع مشکل تولید آنزیم لیپاز باکتریایی، تولید این آنزیم از یک منبع در دسترس و ارزان قیمت مورد بررسی قرار گرفته است. به همین منظور سوش جدید p
تهیه ایمونوتوکسین با استفاده از سایتوکین g-csf و سم گیاهی
ایمونوتوکسین ها عوامل فارماکولوژیکی با سموم پروتئینی متصل به یک لیگاند هدف مناسب هستند و به دو صورت شیمیایی و نوترکیب ساخته می شوند. در تحقیق حاضر زنجیره a از سم پروتئینی و گیاهی ریسین که ریبوزوم های یوکاریوتی را غیرفعال می کند توسط دو کراس لینکر مناسب برای تهیه ایمونوتوکسین ها ی
بررسی پایداری دمایی و فعالیت آنزیم لاکاز جهش یافته در ناحیه asn143 و بهینه سازی تاخوردگی مجدد آن
لاکازها (بنزن دیول اکسیژن اکسیدوردوکتاز ها، ec 1.10.3.2) عضوی از خانواده اکسیدازهای چند مسی هستند و به دلیل توانایی اکسید کردن گستره وسیعی از سوبسترا ها می توانند در بسیاری از فرآیندهای زیست فناوری مورد استفاده قرار گیرند. لاکازهای باکتریایی نسبت به لاکاز های قارچی مزیت دارند ولی
بهینه سازی تاخوردگی مجدد پروتئین آلفا آمیلاز حاصل از باکتری باسیلوس مگاتریوم و بررسی ویژگی آنزیم
دراین تحقیق مطالعاتی در مورد تاخوردگی مجدد پروتئین آلفا آمیلازbmw بدون سیگنال انجام شد و در نهایت شرایط تاخوردن پروتئین و فاکتورهای موثر بدست آمده از آزمایشات، توسط نرم افزارexpreimental design نوع 8 بهینه سازی شد. بهترین بازده تاخوردگی مجدد آنزیم با بافر تریس حاوی گلیسرول 20%، ک
مقایسه رفتار آلوستریکی متیل گلی اکسال سنتاز مزوفیل و همتای ترموفیل آن با بررسی نقش قطعه پپتیدی ده آمینواسیدی انتهای کربوکسیل آنزیم
آنزیم متیل گلی اکسال سنتاز (mgs) (4.2.3.3 ec) واکنش حذفی تبدیل دی هیدروکسی استون فسفات (dhap) را به متیل گلی اکسال انجام می دهد. این آنزیم دارای 6 زیر واحد است که در حضور و عدم حضور فسفات دارای رفتار سینتیکی متفاوتی است و در حضور فسفات، به عنوام مهار کننده آلوستریک، رفتار متعاون
بررسی پایداری ساختاری پروتئین کایمر الاستاز و ترمولیزین
پروتئاز های خنثی (nps) روی متالوپروتئازهایی با کاربردهای بیوتکنولوژی مثل سنتز پپتید و آسپارتام هستند، اما محدودیت اتولیز در حرارت های بالا را دارند. در این مطالعه ما یک ناحیه ی سطحی الاستاز از سودوموناس آئروجینوزا که به یک یون کلسیم متصل می شود را با ناحیه ی مشابهی در ترمولیزین ا
غربال گری باکتریایی به منظور جداسازی ژن گلیفوسیت اکسیدورداکتاز (gox) و انتقال به گیاه کلزا برای افزایش تحمل نسبت به گلیفوسیت
متحمل سازی گیاهان زراعی نسبت به علف کش گلیفوسیت از طریق دست ورزی های ژنتیکی یکی از کاراترین روش های موجود در کنترل علف های هرز مزارع محسوب می شود. گلیفوسیت با مهار آنزیم epsps (5-انول پیرویل شیکیمات-3-فسفات سنتاز) در مسیر شیکیمات مانع سنتز اسید های آمینه حلقوی و در نتیجه مرگ گیاه
نقش گونه فستوکای بلند (festuca arundinacea) در گیاه پالایی خاک آلوده به ترکیبات گازوئیلی (کل هیدروکربن های نفتی) و ارتباط آن با مراحل تکوین ریشه و اندازه گیری فعالیت آنزیم لاکاز
هیدروکربن های نفتی (tphs) از جمله گازوئیل، جزء آلاینده های معمول خاک بوده که می توانند حاوی ترکیبات سمی باشند. زیست پالایی روشی پذیرفته شده برای پاکسازی خاک های آغشته به ترکیبات نفتی می باشد که یکی از انواع آن، گیاه پالایی است. نکته مهم برای موفقیت آمیز بودن پالایش خاک های آلوده
مطالعه سیستم بیولومینسانس در گونه فانوس ماهی benthosema pterotum
در این پایان نامه برای نخستین بار سیستم بیولومینسانس گونه فانوس ماهی benthosema pterotum بررسی شد. آزمایشات ما نشان داد که در این گونه یک واکنش آنزیمی وابسته به لوسیفراز در نشر نور دخالت دارد. نتایج سنجش عصاره استخراجی بر روی سلانترازین hcp نشان داد که لوسیفراز سبب اکسایش سلانترا
جداسازی و تعیین خصوصیت سویه های باکتریایی بومی مقاوم به کروم (vi) در جهت زیست پالایی محیط های آلوده و بررسی مکانیسم مقاومت در آنها
این تحقیق با هدف جداسازی سویه های باکتریایی مقاوم به کروم و امکان سنجی استفاده از آنها در جهت پاکسازی محیط های آلوده به این فلز سرطانزا صورت گرفت. به این منظور نمونه گیری از معادن کروم سبزوار صورت پذیرفت. غربالگری این نمونه ها منجر به جداسازی 20 سویه ی مقاوم به کروم شد. برای شناس
جداسازی و تعیین خصوصیت باکتری بومی مقاوم به فلزات سنگین و حلال های آلی برای کاربردهای بیوتکنولوژی صنعتی
مناطق آلوده به پساب های صنعتی، محیط مناسبی جهت بررسی مکانیسم های منجر به تحمل یا مقاومت در برابر فلزات سنگین و حلال های آلی در سوش های باکتریایی می باشند. این پژوهش در سه بخش با هدف جداسازی و شناسایی سویه ی باکتریایی مقاوم به فلزات سنگین و حلال های آلی، بررسی مکانیسم های مقاومتی
بررسی پایداری و فعالیت آنزیم طبیعی وجهش یافته لاکاز در حضور حلال های آلی
لاکازها(بنزن دیول اکسیژن اکسیدوردوکتاز ها، ec 1.10.3.2 ) ازجمله پلی فنل اکسیداز ها هستند که توانایی اکسید نمودن تعداد زیادی از ترکیبات فنلیک و استخلاف های امین آنها را دارند . این آنزیم ها از جمله اکسیداز های چند مسی بوده که با استفاده از اکسیژن مولکولی سبب اکسید نمودن ترکیبات آر
جداسازی و تخلیص پروتیین دخیل در سیستم نوری گونه فانوس ماهی(benthosema pterotum) و کلونینگ، بیان، و تعیین خصوصیات بیوشیمیایی پروتئین نوترکیب
برای اولین بار یک لوسیفراز جدید از گونه benthosema pterotum ،از بندر جاسک در نزدیکی خلیج فارس جمع آوری شد، توسط روش کروماتوگرافی تعویض یونی و با استفاده از رزین q- سفارز تخلیص شد. وزن ملکولی پروتئین با استفاده از روش sds- page در حدود kda 27 و مقدار km برابر با m? 4/0 بود، هر دو
بررسی نقش توالی های v و vi در تعیین خانواده آنزیمی آلفا آمیلازهای حدواسط
آنزیم های آمیلاز حد واسط ( اغلب در زیر خانواده gh13-36 دسته بندی شده اند) که دارای توالی mpdln در ناحیه حفظ شده پنجم می باشند با مخلوطی از ویژگی های آنزیمی آلفا آمیلاز و زیر خانواده های آنزیمی الیگو-6،1-گلوکزیداز و نئوپلولاناز (مثل هیدرولیز سیکلودکسترین یا ترانس گلیکوزیلاسیون) شن
بررسی میزان بیان موثر و کارآیی آنزیم جهش یافته لاکاز در موقعییت asp 500
لاکازها (1.10.3.2 ec؛ پارا دی فنول دی اکسیژن اکسیدوردوکتاز) بدلیل قابلیت اکسیداسیون طیف گسترده¬ای از ترکیبات فنولی کاربردهای زیادی در صنایع بیوتکنولوژی دارند. محدود بودن دامنه اطلاعاتی در ارتباط با ساختار و عملکرد لاکازها، آنزیم اخیر را کاندیدای مناسبی جهت راهکارهای مهندسی پروتئی
نمایش سطحی آنزیم لاکاز باکتریایی در یک نانوسیستم القاشونده فنلی و ارزیابی کارایی حذف آاودگی
ترکیبات فنلی که به طور مرتب در نتیجه فعالیت های شهری و صنعتی تولید می شوند می توانند در اثر فعالیت آنزیمهایی مانند لاکازها به طور کامل سمزدایی شده یا به ترکیباتی با سمیت کمتر زیست پالایی شوند. هدف از تحقیق حاضر بیان القایی آنزیم لاکاز تنها در صورت مواجهه با ترکیبات آلاینده و سپس
بررسی نقش قطعات انتهایی c و n و حضور یک قطعه با ترادف his-his روی ساختار- فعالیت و پایداری آنزیم متیل گلی اکسال سنتاز
آنزیم متیل¬گلی¬اکسال¬سنتاز واکنش تبدیل دی¬هیدروکسی¬استون¬فسفات را به متیل¬گلی¬اکسال انجام می-دهد. این آنزیم هموهگزامر بوده و فسفات مهار¬کننده آلوستریک آن می¬باشد. این آنزیم اولین¬بار از باکتری اشرشیاکلی جداسازی و مطالعه شده است. بررسی ساختار کریستال mgs اشرشیاکلی نشان می¬دهد که پ
ارتباط بین تجمع فلزات سنگین با برخی از بیومارکرهای فیزیولوژیک مرتبط با ساخت پوسته و مروارید در صدف مرواریدساز محار، pinctada radiata، در طول سواحل ایرانی خلیج فارس
سواحل خلیج ¬فارس و اقیانوس هند به عنوان اولین مناطق صید صدف مرواریدساز در دنیا شناخته شده است. صدف مروارید¬ساز محار (pinctada radiata) به عنوان یک گونه بومی در منطقه است که در سال¬های اخیر کاهش جمعیت، اندازه و شکننده شدن پوسته آن گزارش شده است. از آنجا که فلزات سنگین با تاثیر بر
بررسی اثرات اصلاح سازی نانوداربست پلی اتر سولفون (pes) در روند تمایز سلول های بنیادی چند توانی القاء شده انسانی (hipscs) به سلول های عصبی و ارزیابی سلول های تمایز یافته
فرآیند ترمیم در سیستم عصبی، پیچیده بوده و چالشی بزرگ برای محققان می باشد. رویکرد مهندسی بافت با استفاده از ترکیب سلول های بنیادی و داربست های نانوفیبری علاقه ی جامعه ی تحقیق را برای کاربردهای بازسازی بافت عصبی به خود جلب کرده است. هدف از تحقیق حاضر، مطالعه ی پتانسیل تمایزی سلول ه
کلونینگ، بیان و بررسی خصوصیات بیوشیمیایی و ساختاری آنزیم لاکاز جداشده از باکتری باسیلوس آنتراسیس سویه ی qza2
لاکازها آنزیم های چند مسی متعلق به گروه اکسیداز های آبی اند. سوبستراهای مختلف (برای مثال فنول ها و ترکیبات آروماتیک یا آمین های آلیفاتیک) را اکسید کرده و اکسیژن مولکولی را به عنوان پذیرنده نهایی الکترون استفاده می کنند. در این پژوهش ژن لاکاز از باکتری bacillus .anthracis سویه qza
بررسی نقش پل نمکی بین آرژنین 80 و آسپارتیک اسید100 در رفتار آلوستری آنزیم ترموفیل متیل گلی اکسال سنتاز
آنزیم متیل گلی اکسال سنتاز ترموفیل اولین بار ازگونه ی باکتریای thermus sp.gh5 (tmgs) جدا سازی و تعیین ساختار شد. این آنزیم به طور اختصاصی تبدیل دی هیدروکسی استن فسفات به متیل گلی اکسال و ارتوفسفات را کاتالیز میکند و مسیر گلیکولیز را از جهت اصلی خود منحرف میسازد. tmgsبه صورت هموهگ
بررسی پایداری سینتیکی و ترمودینامیکی آنزیم لاکاز وحشی و جهش یافته
لاکازها (بنزن دیول اکسیژن اکسیدوردوکتاز¬ها، ec 1.10.3.2) عضوی از خانواده اکسیدازهای چند مسی هستند و به دلیل توانایی اکسید کردن گستره وسیعی از سوبسترا¬ها می¬توانند در بسیاری از فرآیندهای زیست ¬فناوری مورد استفاده قرار گیرند. لاکازهای باکتریایی نسبت به لاکاز¬های قارچی مزیت دارند ول
اثر متقابل اسیدهای چرب ضروری epa وdha و ویتامین e جیره بر عملکرد رشد و شاخص های فیزیولوژیک بچه ماهی نورس آزاد دریای خزر (salmo trutta caspius)
در این آزمایش اثر ترکیبی مقادیر مختلف اسیدهای چرب ضروری امگا 3 hufa (dha, c22:6n-3 و epa, c20:5n-3) و آلفا-توکوفرول جیره بر رشد، ترکیب اسیدهای چرب، پارامترهای هماتولوژی، ایمنی غیراختصاصی، وضعیت آنتی¬اکسیدانی و ساختار دستگاه گوارش بچه ماهی نورس آزاد دریای خزر (salmo trutta caspius
طراحی و ایجاد جهش های نقطه ای در ژن آلفا آمیلاز سوش bacillus amyloliquefaciens به منظور افزایش پایداری حرارتی و ارزیابی ویژگی های ساختاری و سینتیکی این جهش یافته ها
?- آمیلاز bacillus licheniformis (bla)، به عنوان همتای ترموفیل ?- آمیلازbacillus amyloliquefaciens (baa)، مدلی مناسب برای طراحی جهش های پایدار کننده در baa است. bla، علی رغم 80 درصد یکسانی در توالی اسید آمینه ای، ده باقیمانده هیستیدین بیش از baa دارد. با توجه به این تفاوت برجسته،
بررسی اثر اسیدآمینه های جایگاه اتصال کلسیم بر فعالیت و پایداری آنزیم آلفاآمیلاز-پلولاناز
در این تحقیق مطالعاتی برای بررسی و مطالعه اثر اسید آمینه های جایگاه اتصال کلسیم روی پایداری حرارتی آنزیم bmw آمیلاز-پلولاناز انجام شد. سه جهش براساس مقایسه توالی با آمیلاز های مقاوم به حرارت طراحی شد. بر اساس نتایج، جهش h58i افزایش 5/7 برابری در کارایی کاتالیتیک را نشان داد، ضمن
بررسی پایداری حرارتی آنزیم آلفا آمیلاز حاصل از باسیلوس 8104kr با استفاده از موتاسیون هدفمند
برای استفاده کارآمد از آلفا- آمیلازها این آنزیم ها باید در دماهای بالا پایدار بوده و فعالیت خود را حفظ کنند. یکی از دلایل غیر فعال شدن حرارتی برگشت ناپذیر آنزیم ها، ایجاد تغییرات کووالان نظیر دآمیداسیون اسید آمینه های آسپارژین و گلوتامین می باشد. اسیدهای آمینه آسپارژین در دماهای
بررسی اثر اسید آمینه های جایگاه اتصال کلسیم بر فعالیت و پایداری آنزیم آلفا آمیلاز- پلولاناز
در این تحقیق مطالعاتی برای بررسی و مطالعه اثر اسید آمینه های جایگاه اتصال کلسیم روی پایداری حرارتی آنزیم bmw آمیلاز-پلولاناز انجام شد. سه جهش براساس مقایسه توالی با آمیلاز های مقاوم به حرارت طراحی شد. بر اساس نتایج، جهش h58i افزایش 5/7 برابری در کارایی کاتالیتیک را نشان داد، ضمن
سنتز نانوساختار زیست-الگو و نانوذرات مغناطیسی و ارزیابی کارآیی برخی از آنها در تثبیت آنزیم
کاربردهای وسیع نانومواد نیازمند سنتز نانوساختارهایی با خواص ویژه (هندسه، خواص سطح، هدایت الکتریکی و همچنین خواص مغناطیسی) می باشد. این مواد می توانند به فرم های نانوذره، نانومیله و نانوپوشش و سایر اشکال ساخته شوند. در این رساله سه رویکرد ساخت نانوذرات و کاربرد آنها مد نظر قرار گر
بررسی اثر فاکتور b بر پایداری آنزیم لوسیفراز تغییر یافته به روش جهش زائی اشباعی و هدفدار
لوسیفراز پروتئینی است که دارای یک دمین بزرگ در انتهای آمین و یک دمین کوچک در انتهای کربوکسیل است. آنالیزهای b-factor نشان دهنده این است که دمین انتهای کربوکسیل لوسیفراز، انعطاف پذیرتر از دمین انتهای آمین می باشد. مطالعه بر روی پروتئین های ترموفیل نشان داده است که پایداری دمائی پر
طراحی و بهینه سازی زیست حسگر باکتریایی فلورسانت شناساگر تولوئن براساس اپران xyl
امروزه توسعه صنعت پتروشیمی و کاربرد گسترده آن به عنوان منبع انرژی منجر به ورورد غلظت بالایی از ترکیبات آروماتیکی مثل بنزن، تولوئن، اتیل بنزن و گزیلن (btex) به سفره آب های زیرزمینی شده است. ازآنجا که این ترکیبات در برابرتجزیه زیستی مقاوم هستند پایداری بسیار بالایی را در طبیعت از خ
کلونینگ، بیان و بررسی خصوصیات بیوشیمیایی و ساختاری آنزیم لاکاز جداشده از باکتری باسیلوس پامیلوس
لاکازها (1.10.3.2 ;ec پارادی فنولدی اکسیژن اکسیدوردوکتاز) بدلیل قابلیت اکسیداسیون طیف گسترده ای از ترکیبات فنولی کاربردهای زیادی در صنایع بیوتکنولوژی دارند. لاکازهاآنزیمهای چند مسی متعلق به گروه اکسیدازهای آبی هستند کهدی فنول ها و مواد وابسته را اکسیدکرده و اکسیژن مولکولی را به ع
تعیین ویژگی های مخمرهای محلی مولد زایلاناز، بهینه سازی تولید، بررسی ژن مولد از سویه برتر
چکیده آنزیم های تجزیه کننده زایلان توسط انواعی از باکتریهای هوازی و بی هوازی و قارچ ها تولید می شود که جهت تجزیه بافت های گیاهی و آزاد سازی زایلوز به عنوان منبع اصلی کربن در متابولیسم سلولی و یا برای عفونت زایی در سلول های گیاهی از طریق تجزیه همی سلولز به این آنزیم ها نیاز دارند.
ساخت و تعیین خصوصیت vhhمناسب علیه dr5
یکی از امید بخش ترین روش های درمان سرطان، القاء آپوپتوز در سلول های سرطانی است. به همین منظور، چندین آنتی بادی آگونیست علیه گیرنده مرگ 5 (dr5) تولید شده است، که تحت ارزیابی بالینی قرار دارند. اساسا، با فعال شدن dr5 در سلول های سرطانی القاء آپوپتوز در مسیرهای داخلی و خارجی آغاز می
طراحی نرم افزار پیش بینی نقاط کلیدی در پروتئین جهت ایجاد جهش های افزایش دهنده پایداری حرارتی
در این تحقیق نرم افزار تحت وب discover معرفی شده است که می تواند جفت های باقی مانده ای را که در صورت جهش به سیستئین، پیوند دی سولفید ایجاد می کنند و موجب بهبود پایداری پروتئین می شوند، پیش بینی کند. پیش بینی بر پایه شرایط ساختاری باقی مانده ها و تفاوت ویژگی های فیزیکی و شیمیایی ا
طراحی و ساخت سازه ژنی elp-intein-uricase جهت بررسی خالص سازی آنزیم اوریکاز در میزبان پروکاریوتی
برچسب¬های تخلیصی، ابزارهای ساده¬ای هستند که می توان از آنها برای جدا کردن طیف گسترده¬ای از پروتئین¬های نوترکیب استفاده کرد. از جمله برچسب¬های تخلیصی تازه کشف شده می توان به پلی پپتید شبه إلاستین (elp) اشاره کرد. این پلی پپتید از تکرار نسبتاً زیاد یک پنتاپپتید با اسید آمینه-های آب
طراحی، ساخت و بررسی زیست حسگری باکتریایی مبتنی بر پروتئین فلورسنت سبز با استفاده از اپرون tbua1ubva2c جهت تولوئن در دسترس زیستی
امروزه آلودگی آب یکی از بزرگترین مشکلات نوع بشر می باشد و از میان ترکیبات آلوده کننده آب ترکیبات btex (بنزن، تولوئن، اتیل بنزن و زایلن) ترکیباتی هستند که طیف گسترده ای از بیماری ها را به همراه دارند. زیست گزارشگرهای باکتریایی یکی از ابزاری هستند که توانایی سنجش کیفی و تا حدودی کم
بررسی کارایی روش رزونانس مغناطیسی سطحی (spr) در مقایسه با روش الایزا، برای سنجش psa سرمی در تشخیص سرطان پروستات
سرطان پروستات یکی از شایعترین انواع سرطان در مردان 50 سال به بالا می باشد که در صورت تشخیص به هنگام این نوع سرطان احتمال درمان این بیماری بسیار افزایش می یابد و شانی بقای بیمار به صورت چشمگیری افزایش خواهد داشت.امروزه جهت شناسایی این موع سرطان از روش قدیمی روتین الایزا برای انداز
بررسی فعالیت، پایداری و ساختار آنزیم لاکاز از باسیلوس hr03 در حلال های deep eutectic
حلالهای deep eutectic اخیرا بعنوان حلالهای سبز شناخته شده اند.ای حلالها می تواند محیط مناسبی برای واکنشهای آنزیمی باشد بنابراین در این مطالعه اثر این مایعات بر فعالیت، پایداری و ساختار آنزیم لاکاز بررسی شد.
اثر سازه های ضد تغذیه ای دانه گندم بر گسترش دستگاه گوارش و عملکرد جوجه های گوشتی
چکیده ندارد.
جداسازی، توالی یابی، کلونینگ و بیان ژن گلوگز ایزومراز از سویه بومی باکتری
چکیده ندارد.
غربالگری، جداسازی و تخلیص پلولاناز از باکتری های ترموفیل بوم ایران
چکیده ندارد.
ارتباط ساختار - فعالیت در آنزیم 5- انول پیروویل شیکیمات 3-فسفات سنتاز (epsps) باکتریایی طبیعی و جهش یافته؛ اثر گلایفوسیت و پروتئازها
چکیده ندارد.
بررسی جایگاه اثر پروتئاز بر آنزیم لوسیفراز و مطالعه پایداری آن در مقابل هضم پروتئولیتیک در حضور افزودنی های مختلف
چکیده ندارد.
ارتقاء فعالیت گوگردزدایی در باکتری gordonia sp.strain ripi.b4 به روش مولکولی، با تاکید بر حذف مهار سولفات
چکیده ندارد.
جداسازی، تعیین ویژگی و شناسایی مولکولی باکتریهای ساکن در خاکهای آلوده به نفت
چکیده ندارد.
مقایسه ساختاری و عملکردی لیزوزیم مونومر و دایمر
چکیده ندارد.
بررسی پروتئوم باکتری مقاوم به پرتو گاما از چشمه های آب گرم ایران
چکیده ندارد.
اثرایمونولوژیکی آلژینات pseudomonas aeruginosa و پروتئین ایمونومدولاتور سیر، بر پاسخ های th1 وth2
آلژینات تولید شده توسط سویه های موکوئیدی pseudomonas aeruginosa ، از عوامل مهم ایجاد عفونت های مزمن ریوی در بیماران مبتلا به فیبروز سیستیک ، می باشد. آلژینات پلی ساکارید خارج سلولی و متشکل از واحدهای d- مانورونیک اسید و l-گلورونیک اسید است. پاسخ ایمنی محافظت کننده نقش مهمی در کنت
تخلیص و بررسی خصوصیات سینتیکی آنزیم سلنات ردوکتاز جدا شده از باکتری سویه بومی و نقش آن در حذف عناصر سمی از محیط زیست
حضور یونهای فلزات سنگین در داخل آبها و پسابهای صنعتی بدلیل سمی بودن ، یک مشکل بزرگ برای محیط زیست محسوب می شود. این آلوده کننده ها می توانند در ارگانیسمهای موجود زنده تجمع کنند و در نتیجه باعث بروز انواع بیماریها برای انسانها می شوند. جمع آوری و دفع پساب چه از نقطه نظر بهداشتی و
بررسی اثر جهش زایی هدفمند اسیدآمینه های موجود در سطح مشترک آکاربز-آلفا-آمیلاز حاصل از گونه ی باسیلوس kr-8104 در اتصال آکاربز و مهار آنزیم
به منظور بررسی مهار آنزیم آلفا آمیلاز مزوفیل bacillus kr-8104 توسط آکاربز دو اسید آمینه ی سرین 105 و تایروزین 175 موجود در نزدیکی جایگاه فعال به اسید امینه های معادل در آلفاآمیلاز bacillus subtilis که مقاوم به آکاربز می باشد تغییر یافتند. در موتان tyr175phe حذف پیوند هیدروژنی تای
جداسازی، خالص سازی و مطالعه سنتیکی آلفا آمیلاز باکتری مزوفیل بومی مقاوم به پرتو گاما
آمیلازها (endo-1,4-alphaglucohydrolase, ec 3.2.1.1) قادرند پیوندهای گلیکوزیدی 4-1 ، α موجود در بخش درونی آمیلوز، آمیلوپکتین و سایر کربوهیدراتهای وابسته را هیدرولیز کنند. آلفا- آمیلازها از مهم ترین آنزیم های صنعتی بوده و کاربردهای فراوانی دارند. سویه های مختلف از نمونه های جمع آور
بررسی ساختارهای حدواسط در آنزیم آلفا آمیلاز از دو گونه b.licheniformis و b.subtilis به منظور تثبیت بر روی بسترهای هیروفوبیک
بستر سفارز-لیپید(سفارز 4b حاوی زنجیره آلکیل) به عنوان بستر هیدروفوب برای رونشینی جذبی بسیاری از پروتئین ها از طریق میانکنش هیدروفوب مورد استفاده قرار گرفته است. برخی از پروتئین ها به دلیل قابل دسترس بودن سطوح هیدروفوب ، بر روی این ماتریکس ها بخوبی تثبیت گردیدند. علاوه برآن ،
ساختار و عمل در دو آنزیم آلفا آمیلاز ازb.licheniformis و b.amyloiquefaciens
در این مطالعه ابتدا پایداری حرارتی آلفا آمیلازهای مزوفیل (حاصل از baa, bacillus amyloliquefaciens) و ترموفیل (حاصل از bla, bacillas licheniformis) و اثرات عوامل دناتوره کننده، حلال های آلی و پایدارکننده ها بررسی شد. آنزیم ترموفیل در حلال آبی مقاومت بیشتری در مقابل عوامل د