مدل های مارکوف پنهان دسته ای از فرایندهای تصادفی هستند که در مسائل کاربردی بسیار متنوعی با موفقیت به کار رفته اند. در این پایان نامه، مباحث مربوط به مدل احتمالی مارکوف پنهان در رابطه با مسأله ژن یابی در توالی های dna ارائه گردیده است. ژن ها قسمت هایی از dna می باشند که توانایی سنتز پروتئین ها را دارند. بنابراین ژن یابی مرحله بسیار حساسی در تحلیل داده های توالی dna است.

در موجودات یوکاریوتی dna با پروتئین های هسته ای هیستون همراه شده و کروماتین را شکل می دهد. نوکلئوزوم، واحد سازنده ی کروماتین است که هر جفت باز در طول ژنوم تکرار می شود. فرآیندهای ژنتیکی حیاتی نظیر همانندسازی، رونویسی، نوترکیبی، و بیماری هایی نظیر سرطان و عفونت های ویروسی بستگی به دسترسی به محتوای dna کروماتینی دارند و تحت تاثیر ساختار نوکلئوزوم قرار می گیرند. پروتئین های هیستونی در دو گروه کلی:...

در این تحقیق، تثبیت و هیبریداسیون توالی تک رشته DNA ssDNA)) مربوط به ژن rfbE باکتری Escherichia coli O157:H7 به‌روش طیف‌بینی امپدانس الکتروشیمیایی مورد بررسی قرار گرفته است. این توالی به‌صورت تک‌لایه خودتجمعی، روی سطح الکترود طلا به‌مدت سه ساعت و در دمای محیط (C25) تثبیت شد. تک‌لایه مخلوط شامل مرکاپتوهگزانول و مرکاپتوپروپیونیک اسید به‌ عنوان یک طراحی رابط برای توسعه بیوسنسور مورد استفاده قر...

زمینه و هدف: نانوبیوسنسورها می توانند به­جای روش های تشخیص قدیمی باکتری اشریشیاکولی o157:h7 مورد استفاده قرارگیرند. در این تحقیق، یک نانوبیوسنسور برای تشخیص بخشی از ژن rfbe باکتری اشریشیا کولی o157:h7توسط تثبیت و هیبریداسیون توالی تک رشته dnassdna)) در سطح الکترود اصلاح شده با نانو ذرات طلا مورد بررسی قرارگرفته است. موادّ و روش­ها: روش طیف بینی امپدانس الکتروشیمیایی برای بررسی خواص حسگری الکترو...

16S rRNA یکی از اجزای بخش بزرگ ریبوزومی می باشد که بوسیله‌ی ژنوم میتوکندریایی کد می‌شود و به طور گسترده‌ای در مطالعات فیلوژنتیکی مربوط به گونه‌های نزدیک و به خصوص گونه های مربوط به Crassostrea مورد استفاده قرار می‌گیرد. پلی مورفیسم توالی نوکلئوتیدی مربوط به ژن 16S rRNA ژنوم میتوکندریایی اویستر خلیج فارس (Crassostrea sp.)، در 30 نمونه اویستر جمع آوری شده از بندر امام خمینی مورد بررسی قرار گرفت. ...

در این مطالعه به منظور تعیین ساختار ژنتیک جمعیت تاس ماهی ایرانی (acipenser persicus) دریای خزر دو روش توالی یابی قطعه d-loop و هضم آنزیمی (pcr-rflp) ژن nd5 در dna میتوکندریایی به کار گرفته شد. در مجموع تعداد 225 نمونه باله تاس ماهی ایرانی از مناطق مختلف دریای خزر جمع آوری گردید. توالی یابی با استفاده از روش استاندارد انجام پذیرفت. هضم آنزیمی ژن nd5 با استفاده از 25 آنزیم برشگر انجام گرفت و الگو...

زعفران به عنوان گرانترین ادویه جهان از کلاله‎های خشک گیاه crocus sativus به دست می‎آید و به طور عمده به عنوان رنگ و طعم دهنده در صنایع غذایی و به علت داشتن ترکیبات فعال در پزشکی کاربرد دارد. در این مطالعه تنوع ژنتیکی میان 28 ژنوتیپ زعفران که از مناطق مختلف ایران جمع آوری شده بود، با استفاده از نشانگر srap ارزیابی شد. 19 ترکیب آغازگری در مجموع 147 قطعه چندشکل با میانگین 74/7 قطعه و میانگین pic ب...

زیست شناسی مولکولی علمی است که شناختی از طبیعت همه موجودات زنده در سطح مولکول برای ما فراهم می کند، امروزه پیشرفت های زیادی در این زمینه ایجادشده است که بدون ارتباط با علوم دیگر، از جمله ریاضیات، هرگز ممکن نبوده است. به منظور استخراج کارآمد اطلاعات در این زمینه نیاز است که ابزارهای ریاضی توسعه یابند، اصول نظریه گراف که معمولاً در زمینه های مهندسی الکترونیک و شبکه های کامپیوتری کاربرد فراوان دا...

هدف از این بررسی ارزیابی ساختار ژنتیکی و جمعیتی تاسماهی ایرانی (acipenser persicus) سواحل جنوبی دریای خزر و رودخانه سفیدرود با ناحیه کنترلی میتوکندریایی (ژن d-loop) و روش توالی یابی dna ذخایر تاسماهیان سواحل جنوبی دریای خزر طی سال های 1391 – 1388 بود. روش کار شامل نمونه برداری توسط تور ترال کفی، استخراج dna، واکنش های زنجیره ای پلیمراز و توالی یابی محصول pcr بود. شاخص های تنوع مولکولی، شاخص توز...

تعیین توالی dna یکی از مهم‏ترین دستاوردهای بشر محسوب می‏شود. امروزه روش‏های متفاوتی به منظور تعیین توالی نوکلئوتیدها (آدنین، گوانین، سایتوزین و تیمین) در یک مولکول dna به‏کار گرفته می‏شود. آشنایی با دانش تعیین توالی dna از ارکان اجتناب ناپذیر پژوهش‏های مرتبط با علم زیست‏شناسی است و در گرایش‏های پژوهشی و کاربردی وسیعی مانند تشخیص بیماری‏ها، زیست فنآوری، زیست‏شناسی جنایی و زیست‏شناسی سیستماتیک اس...