در این پایان نامه به مطالعه تجربی و تئوری بررسی برهمکنش داروی ونکومایسین با dna پرداخته شد. ونکومایسین یک آنتی بیوتیک گلیکوپپتیدی است که با اثر بر روی ساخت دیواره سلولی، برای درمان عفونت های باکتریایی گرم مثبت استفاده می شود. تغییرات طیف حاصل از روش های اسپکتروسکوپی جذب و فلوئورسانس، نمایانگر برهمکنش ونکومایسین با dna می باشد. ثابت اتصال پیوندی(kb) با استفاده از تکنیک جذب 5^10*0.161 و ثابت تقوی...

درک سازوکار رفتار نانوکامپوزیت های پایه پلیمری، نیازمند بررسی در سطح مولکولی است. این نوع بررسی با استفاده از فنون تجربی، چالش برانگیز است. شبی هسازی دینامیک مولکولی به عنوان یکی از معمول ترین روش های محاسباتی، م یتواند نقش مهمی در کمک به توجیه و تفسیر نتایج تجربی بازی کند. در کار حاضر، برخی از خواص شیمی فیزیکی نانوکامپوزیت های پایه پلیمری حاوی نانولوله های کربنی، بورونیتریدی و استخلاف دار، پلی...

سیتوکروم p450، یک آنزیم هِموپروتئینی است که در دیواره ی سلولی قارچ ها باعث تبدیل لنسترول به اِرگسترول می شود.در این مطالعه این آنزیم هِموپروتئینی که عمده فعالیتش را از طریق گروه هِم خود انجام می دهد، از بانک اطلاعاتی پروتئین استخراج شده و با استفاده از نرم افزار گرومکس تحت شبیه سازی دینامیک مولکولی قرارگرفت. داکینگ (اتصال) پروتئین شبیه سازی شده با داروهای ضدقارچ توسط نرم افزار مولگرو نشان داد که طی...

اندوستاتین قطعه پروتئولیتیکی کلاژن xviii است که بطرز بسیار موثری از رگزایی و رشد تومورجلوگیری می کند اما هنوز مکانیسم عمل آن مشخص نشده است. مطالعات نشان دادند که قطعه انتهای آمینی اندوستاتین موشی و انسانی فعالیت های ضد توموری، ضد مهاجرت و ضد نفوذ پذیری مشابه با اندوستاتین کامل را نشان می دهند. این قطعه محتوی یک یون فلزی روی است. اتصال یون روی جهت پایداری گرمایی وترمودینامیکی و همچنین فعالیت ضد ...

همولیزین یک پروتئین خارج سلولی است که توسط بسیاری از باکتری های بیماری زا و غیر بیماری زا ترشح می شود. سطح فعالیت آنها غشای پلاسمایی گلبول های قرمز خون می باشد. همولیزین جزء سموم وابسته به کلسترول می باشد یعنی کلسترول را به عنوان گیرنده بر روی سطح سلول های خونی شناسایی کرده و از طریق آن به سلول هدف متصل می شود. در این تحقیق ما بر روی همولیزین گونه ایی از باسیلوس به نام باسیلوس پامیلوس safr0032 ...

نحوه استقرار و نفوذ مولکول های بنزن در حفرات زئولیت nay توسط شبیه سازی دینامیک مولکولی مورد بررسی قرار گرفت. شبیه سازی ها در هنگرد nvt با گام زمانی 1 فمتوثانیه طی دو مرحله انجام گرفتند. در مرحله اول پیکربندی هایی شامل 16، 32، 64 و 96 مولکول بنزن به همراه یک سلول واحد زئولیت جهت بررسی استقرار مولکول های بنزن در حفرات زئولیت، شبیه سازی شدند. در مرحله دوم چندین شبیه سازی برای یک پیکربندی ثابت محتو...

چکیده ترکیب یک فلز و یا یک شبه فلز با کربن، کاربید نامیده می شود. مطالعه کاربیدهای فلزهای قلیایی و قلیایی خاکی، به علت واکنش پذیری بالا و ناپایداری گرمایی این ترکیب ها در شرایط محیطی، از نظر آزمایشگاهی با مشکل هایی همراه است. از طرف دیگر, اخیراً سنتز نانوساختارهای کربنی و ترکیب های گوناگون آلی با استفاده از بنیان c22- مورد توجه قرار گرفته است. نتیجه های آزمایشگاهی نشان می دهند که از واکنش کاربی...

در این پایان نامه، با استفاده از تکنیک شبیه سازی دینامیک مولکولی، خواص گرمایی(رسانندگی گرمایی) آلومینیم در مقیاس ماکرو و نانوسیم آلومینیم مطالعه شده است. در شبیه سازی ها زبان برنامه نویسی فرترن استفاده شد و شبیه سازی ها در هر دو هنگرد npt و nvt انجام شده است. از پتانسیل بس ذره ای ساتن-چن برای محاسبه ی انرژی و نیرو استفاده شده است. برای کنترل دما و فشار، به ترتیب از ترموستات نوز-هوور و باروستات ...

خوداجتماعی مولکولی فرآیندی است که در آن مولکولها توسط برهمکنشهای غیرکوالانسی، مانند برهمکنشهای الکترواستاتیک، آبگریزی و پیوند هیدروژنی، گردهم می آیند و اجتماعات اَبَرمولکولی تشکیل می دهند. تشکیل مایسل، وزیکول و ساختارهای دولایه به وسیله ی مولکولهای دوگانه دوست و همچنین تشکیل دسته های پلی الکترولیتی که عامل آن برهمکنشهای الکترواستاتیک است، مثالهایی از این پدیده هستند. در این میان خوداجتماعی پپتیده...

چکیده: گاز طبیعی یکی از اعضای خانواده سوخت های فسیلی است که استفاده از آن ها برای تامین انرژی اخیرا افزایش یافته است. ارزش گاز طبیعی با کاهش مقداردی اکسید کربن افزایش می یابد. بناابراین جدا سازی کربن دی اکسید از متان یک عملیات رایج درصنعت گاز طبیعی است. از زمان کشف نانولوله های کربنی تعداد زیادی ااز مطالعات آزمایشگاهی به جذب گاز روی نانو لوله کربنی اختصاص یافت. در این مطالعه ما از یک نانولول...