پروتئین های متصل شونده به فلز نقش مهمی در پایداری ساختمان، سیگنالینگ، انتقال، کنترل متابولیسم و هموستازی فلزات ایفا می کنند. پپتیدها و قطعات پروتئینی با اندازه های مختلف، در زنجیره های جانبی خود دارای چندین گروه عملکردی هستند که برای اتصال به فلز مناسب هستند .از سوی دیگر برخی فلزات سنگین مانند روی و مس ریز مغذی های ضروری برای یکسری از فرایندهای فیزیولوژیکی هستند. مقادیر زیاد این فلزات و دیگر یو...

زمینه و هدف: بیماری های پریونی گروهی از اختلالات تحلیل برنده دستگاه عصبی بوده که منجر به مرگ بیمار می شوند. این بیماری ها تبدیل پروتئین پریون سلولی طبیعی (prpc) به ایزوفرم غیرطبیعی آن با صفحات بتای فراوان (prpsc)، تشکیل و تجمع رشته های آمیلوییدی با مکانیسمی ناشناخته در سلول های عصبی را به دنبال دارند. هدف از این مطالعه، بررسی تأثیر افزایش یا کاهش موضعی درجه حرارت بر این فرآیند تبدیل می باشد. مو...

تیتانیم دی اکسید به علت پایداری شیمیایی، فراوان بودن، غیر سمی بودن و مقرون به صرفه بودن، به عنوان یکی از رایج ترین کاتالیزورهای نوری شناخته می شود. روتیل یکی از فازهای تیتانیم دی اکسید است می باشد. هدف این مطالعه، پیش بینی خواص ساختاری، ترموفیزیکی، ترمودینامیکی و دینامیکی روتیل با استفاده از شبیه سازی دینامیک مولکولی می باشد. برهمکنش بین یون های تیتانیم و اکسیژن در شبیه سازی های روتیل با استفاد...

با توجه به مطالعات انجام شده در این پایان نامه نتایج زیر را بدست می آوریم: انرژی برهم کنش متوسط اسیدهای آمینه در فاز گازی به دلیل اثر برهم کنش های واندروالس با افزایش جرم مولکولی اسیدهای آمینه افزایش می یابد. انرژی برهم کنش متوسط سامانه های آبی با توجه به ممانعت فضایی اسیدهای آمینه برای آلانین در مقایسه با سرین و گلایسین بیشترین مقدار را دارد. با افزایش دما انرژی برهم کنش متوسط سامانه ی آب-bnnt...

nd2-xgdxzr2o7 وnd2-xhoxzr2o7 موادی هستند که می توانند به عنوان الکترولیت در پیل های سوختی اکسید جامد مورد استفاده قرار گیرند. دما و غلظت دوپنت دو پارامتر مهم در هدایت یونی این الکترولیت ها محسوب می شوند. بنابراین، الکترولیت های nd2-xgdxzr2o7 و nd2-xhoxzr2o7در محدوده وسیعی از دما ( 1273 کلوین تا 1873 کلوین) و غلظت دوپنت توسط شبیه سازی دینامیک مولکولی مورد مطالعه قرار گرفتند. نتایج شبیه سازی از ت...

نانولوله های کربنی به دلیل ساختار های ویژه نانومتریک و منحصر به فردشان که در آن اتمهای کربن بصورت منظم و یکنواخت آرایش یافته اند، دارای کاربردهای زیادی در پزشکی و نانو مدیسین از جمله انتقال دارو، انتقال ژن، درمان و انهدام سلولهای سرطانی دارند. اما داشتن سطوح هیدروفوبیکی و توکسیک بودن آنها برای سیستم های زنده کاربرد نانولوله های کربنی را با چالش اساسی مواجه کرده است. در این پایان نامه اتصال و حل...

در این پایان نامه از شبیه سازی دینامیک مولکولی برای محاسبه خواص مکانیکی الاستیک شش مدل ساختاری گرافن (زیگزاگ)، گرافن (آرمچیر)، تیتانیا (روتایل)، تیتانیا (آناتاز)، نانوکامپوزیت گرافن- تیتانیا (روتایل) و نانوکامپوزیت گرافن- تیتانیا (آناتاز) استفاده شده است. مدول یانگ، مدول حجمی، مدول برشی، ضریب پواسن، ضرایب لامه و قابلیت تراکم پذیری برای هر شش ساختار با سه میدان نیروی کامپس، درایدینگ و یونیورسال ...

بحران آب یکی از مهم¬ترین چالش¬ها در زمان حاضر بوده و آلوده¬کننده¬های گوناگون که ناشی از فعالیت¬های انسانی بوده مانند فلزات سنگین وارد منابع آبی شده و مشکل کمبود آب را تشدید می کنند. اکثر این آلوده¬کننده¬ها را نمی¬توان به وسیله روش¬های قدیمی تصفیه آب به¬طور مؤثر جدا نمود، بنابراین برای جداسازی آنها بایستی از تکنولوژی¬های جدید مانند فرآیند فیلتراسیون غشایی استفاده شود. نانولوله¬های کربنی به دلیل ...

درختواره ها طبقه نسبتا جدیدی از مواداند که دارای ساختار مولکولی و ابعاد واحد در مقایسه با پلیمرهای خطی هستند. درشت مولکول های درختواره می توانند شامل چند نوع گروه عاملی باشند که به طور موفقیت آمیز با روش های واگرا یا همگرا سنتز می شوند. گروه های عاملی موجود در سطح آنها باعث می شود تا این ترکیبات آب دوست شده و در آب بسیار محلول باشند. قطر درختواره با افزایش نسل تا یک نانومتر افزایش می یابد، در ح...

درک سازوکار رفتار نانوکامپوزیت های پایه پلیمری، نیازمند بررسی در سطح مولکولی است. این نوع بررسی با استفاده از فنون تجربی، چالش برانگیز است. شبی هسازی دینامیک مولکولی به عنوان یکی از معمول ترین روش های محاسباتی، م یتواند نقش مهمی در کمک به توجیه و تفسیر نتایج تجربی بازی کند. در کار حاضر، برخی از خواص شیمی فیزیکی نانوکامپوزیت های پایه پلیمری حاوی نانولوله های کربنی، بورونیتریدی و استخلاف دار، پلی...