مولکول rna دنباله ای از چهار نوکلئوتید g، c، a و u است که نقش مهمی را در فرآیندهای زیستی انجام می دهد. این نوکلئوتیدها به کمک پیوندهای هیدروژنی به یکدیگر متصل شده و در نتیجه هر مولکول rna در داخل سلول به شکل خاص (ساختار) درآمده و شکل این ساختار، عملکرد مولکول rna را مشخص می کند. پیش بینی ساختار rna یکی از مسائل مهم در علم بیوانفورماتیک می باشد که توجه ویژه ای در سال های اخیر به آن شده است. به د...

عملکرد مولکول rna اغلب وابسته به ساختار فضایی آن است. از این رو مسئله طراحی رشته نوکلئوتیدی یک rna که به ساختار خاصی تا بخورد برای زیست شناسان، پزشکان و داروسازان حائز اهمیت است. این مسئله به مسئله معکوس تاشدگی معروف بوده و بدین صورت تعریف می شود که برای یک ساختار دوم rna داده شده،هدف پیدا کردن دنباله نوکلئوتیدی است که ساختار دوم آن (با حداقل انرژی آزاد) مشابه با ساختار داده شده باشد. رویکردی...

ساختارهایrna بصورت پیکره حلزونی شکل از دنباله هایrna می باشد که به وسیله زنجیره هایی از نوکلئوتیدهای آدنین، گوانین، سیتوزین و اوراسیل توسط قوانین جفت پایه ای واتسن و کریک به صورت (a-u , u-g) و (g-c) پیوند هیدروژنی برقرار می کنند. پیش بینی ساختار rna یکی از مسائل مهم در علم بیوانفورماتیک می باشد، که توجه ویژه ای در سال های اخیر به ان شده است. در این پایان نامه روش های شمارش تعداد ساختارهایrna، ...

پروتئین ها نقش کلیدی در بسیاری از فعالیت های حیاتی موجودات زنده بر عهده دارند، با توجه به این اهمیت، تولید پروتئین و تغییر ساختار آن برای نیل به اهدافی از قبیل طراحی داروها، ارسال دارو به بافت هدف تولید جایگزین های زیستی برای از بین بردن ترکیبات شیمیایی خطرناک محیط و غیره، از اهداف مطالع? پروتئین ها در علوم انفورماتیک و مهندسی پروتئین می باشد. در راه رسیدن به این هدف آگاهی از عملکرد و طرز کار ی...

در این مطالعه، تأثیر ساختار دوم پروتئین بر روی قدرت اسیدی سه ساختار مختلف رندوم، مارپیچ آلفا و صفحات بتای اسیدهای آمینه باردار مثبت لیزین و هیستیدین در زنجیره پلی پپتیدی 8 گلایسین، بررسی شده است. برای این منظور، از نرم افزار محاسباتی گوسین 9 با روش های آغازین hf و نظریه تابعی چگالی b3lyp برای فاز گازی و از مدل حلال پوشی cpcm/uff برای فاز محلول و مجموعه پایه 6-31g(d)استفاده شده است. دو چرخه ترمو...

در این مقاله به سه مطلب درباره فلسفه علم فقه پرداخته شده است: در مطلب اول تلاش شده است تا با استقصایی نه چندان کامل، کاربردهای سه واژه «فلسفه» «علم» و «فقه» توضیح داده شود، سپس معنا و مراد از این سه واژه بیان شود و سرانجام تعریفی از فلسفه علم فقه ارائه گردد. در مطلب دوم پس از بیان ویژگی های ساختار مطلوب در یک علم، ساختار کلّی فلسفه علم فقه در یک مقدمه و چهارده محورِ اصلی پیشنهاد شده است. در مطلب ...

  تداخل ژنی یک وسیله مهم دفاعی در زیست شناسی مولکولی و به خصوص در ارگانیسم های رده پایین است که در آن قطعات مشخصی از RNA دو رشته ای در بیان یک ژن خاص مداخله می کنند. تداخل RNA اخیرا به عنوان یک تکنیک آزمایشی موفق به منظور تعیین عملکرد ژن ها از طریق تخریب ژن ها در مدل های موجودات به کار رفته است. اهمیت RNA دو رشته ای به عنوان یک هدف یا واسطه ساختار کلیدی است که تمام مسیر های خاموشی RNA را در تما...

مولکول پروتئین زنجیره خطی از اسید آمینه ها است. پیش بینی ساختارهای پروتئین از جمله مسائل چالش برانگیزی است که در طی 35 سال گذشته محققان بسیاری در سراسر دنیا در این زمینه تحقیق کرده اند. اکثر ساختار و عملکرد سلول ها توسط پروتئین ها تعیین می شوند. عملکرد یک پروتئین توسط ساختار آن تعیین می شود. اما به دست آوردن و تعیین ساختار پروتئین کاری مشکل می باشد. برای به دست آوردن ساختار پروتئین از روی دنبال...