پروتئین HMGB4 که در سال 2008 شناخته شد از اعضای خانواده پروتئینهای غیرهیستونی HMGB پستانداران است. پروتئینهای HMGB از طریق دو موتیف که به‌ترتیب HMG-box A وHMG-box B نامیده می‌شوند به DNA اتصال می‌یابند. پروتئینهای HMGB به DNA تغییر یافته با سیس‌پلاتین اتصال یافته و مانع دسترسی عوامل ترمیم برشی DNA به این نقاط می‌شوند. HMGB4 در مقایسه با HMGB1 عضو دیگر این خانواده با میل ترکیبی بالاتری به این نو...

سابقه و هدف: در این مطالعه به اثر اتصال یون فلزی روی بر تغییرات ساختاری و پایداری پروتئین آمیلوئید بتا، موثر در بروز بیماری آلزایمر در سطوح مولکولی پرداختیم. روش بررسی: این بررسی با کمک محاسبات شبیه سازی دینامیکی مولکولی و با استفاده از نرم افزار گرومکس نسخه 4.6.5 و میدان نیروی 03 Amber و مدل حلال آب SPC216 انجام گرفت. یافته‌ها: به کمک انحراف جذر مربع میانگین، صحت انجام شبیه سازی بررسی و ...

ادعای کوهن مبنی بر تغییر جهان به هنگام انقلاب های علمی، مسائل و ابهاماتی ایجاد می کند؛ مثلاً آیا تغییر در خود جهان رخ می دهد یا فقط در ذهن ما؟ آیا تغییر جهان با ثبات محرک های حسی سازگار است و آیا صرف تغییر ذهن (و نه خود جهان) با قیاس ناپذیری ادراکی قابل جمع است؟ کوهن با رویکردی کانتی ـ داروینی از شرایط پیشین دیدن جهان و تغییر جهان سخن می گوید. چنان که بحث خواهیم کرد این شرایط پیشینی همان ساختار ...

در پستانداران، بخش عمده ای از فراورده های بیان ژن را توالی های ریبونوکلئوتیدی غیر کدکننده ی پروتئین تشکیل می دهند. این توالی ها شامل مولکول های rnaی کوتاه و بلند، با اندازه هایی در بازه ی ده ها تا صدها نوکلئوتید هستند، که به مواردی از آن ها با طول بیش از 200 نوکلئوتید، rnaی بلند غیر کدکننده ی پروتئین یا lncrna گفته می شود. مولکول های lncrna که عملکردشان وابسته به ساختار مولکولی منحصر به فرد آن ...

باکتری clostridium novyi سیتو توکسینی به نام آلفا توکسین تولید می کند که با وزن مولکولی حدود 250-200 کیلو دالتون دارای فعالیت آنزیمی بوده و بر روی گیرنده های rho سلول های پستانداران تاثیر می گذارد و عامل خونریزی رگ ها و گرد شدن سلول ها در محیط کشت است. بررسی های ایمونولوژیکی نشان می دهد که قسمت کوچک از یک آنتی ژن می تواند سیستم ایمنی را علیه کل آنتی ژن تحریک کند به همین دلیل همسانه سازی (کلون) ...

در این مطالعه، ساختار ژن tlr4 به عنوان گیرندۀ اصلی در شناسایی لیپوپلی‏ساکارید باکتری‏های گرم منفی در دو سویه از طیور تجاری لاین آرین و بومی آذربایجان غربی بررسی و بیان آن در برخی از اندام‏های اصلی مطالعه شد. از ۱۲۰ قطعه پرنده خون‏گیری و dna کل آنها استخراج شد. با طراحی چهار جفت آغازگر اختصاصی، کل ژن tlr4 در چهار قطعه از پرندگان هر سویه توالی‏یابی شد. تأثیرات تغییرات اسیدآمینه‏ای بر عملکرد پروتئ...

مقدمه : تعیین ساختار سوم پروتئین ها با استفاده از روش کریستالوگرافی اشعۀ x ، روشی زمان بر بوده که نیازمند تسهیلات خاص و اپراتور های متخصص می باشد. تعیین ساختار سوم با استفاده از روش ‎ های بیوانفورماتیک برای مطالعات آزمایشگاهی و به ویژه اکتشاف داروها و ارتباطات تکاملی ارزشمند است. در مطالعۀ حاضر با استفاده از نرم افزارهای بیوانفورماتیکی و پایگاه های اطلاع رسانی، ساختارهای سوم انواع کانال های سدی...

زمینه و هدف: بیماری‌های اسهالی ناشی از باکتری‌های روده‌ای عامل مهم مرگ‌ومیر در کشورهای در حال توسعه به‌ویژه در کودکان زیر پنج سال است. واکسن‌ها می‌توانند راه‌حل مهمی برای پیشگیری از این بیماری‌ باشند. فاکتور کلونیزاسیون پیلی (TcpA)، پروتئین غشای خارجی W و توکسین‌کلرا مهم‌ترین عوامل بیماری‌زایی ویبریوکلرا هستند و ویژگی‌های ایمونوژنیک دارند. در این مطالعه، ایمونوژنی نوترکیب سه‌گانه متشکل از TcpA,...

پروتئین آلفا1- آنتی تریپسین عضو اصلی ابر خانواده مهار کننده های سرین پروتئاز ( سرپین) است. این پروتئین شامل 394 اسیدامینه است که از سه صفحه بتا و نه مارپیچ آلفا تشکیل شده است. نقش اصلی آن مهار فعالیت پروتئازها است. اطلاعات مربوط به ساختار این پروتئین از این جهت مهم است که می تواند زمینه ساز فهم علت عملکرد نادرست آنتی تریپسین و دیگر سرپین ها باشد. عوامل مختلف ژنتیکی و محیطی از قبیل دما و ph و دگ...

تحقیق حاضر بمنظور ارزیابی کارایی روش تغییر ph در دو حالت اسیدی و قلیایی جهت بازیافت پروتئین از ماهی کیلکای کامل و تخلیه شکمی شده و نیز مقایسه ویژگی های سوریمی تولیدی با روش متداول شستشو انجام پذیرفت. نتایج نشان داد که اگر چه هر دو روش اسیدی و قلیایی موجب کاهش میزان رنگدانه کل در پروتئین ایزوله بازیافتی از ماهی کامل و تخلیه شکمی شده گردید اما کارایی روش قلیایی به مراتب بیشتر بود و کمترین میزان ر...