داده های آزمایشگاهی به خوبی نشان می دهند که جایگیری نوکلئوزوم در کروماتین از الگوی خاصی پیروی می کند. از طرفی برای در معرض قرار گرفتن اطلاعات dna, نیاز است که نوکلئوزوم پویا باشد. پویایی نوکلئوزوم در کروماتین این امکان را به ماشین های رونویسی و همانندسازی می دهد, که بتواند از اطلاعات ذخیره شده در dna استفاده کنند. یکی از سازوکارهای جابه جایی نوکلئوزوم لغزش آن در امتداد dna می باشد. ما تلاش کرد...

در هنگام رونویسی، rna پلیمراز شروع به نسخه برداری کرده و رشته ی rna می سازد. در این پایان نامه، رونویسی rnap را در حضور نوکلئوزوم مدل کرده و برهم کنش پلیمراز و نوکلئوزوم را شبیه سازی می کنیم. حضور نوکلئوزوم در مقابل پلیمراز و یا افتادن پلیمراز در پس روی، به شدت سرعت رونویسی را کاهش می دهد و گاهی رونویسی را متوقف می کند. نتایج حاصل از شبیه سازیِ ما نشان می دهد هنگامی که افت و خیز نوکلئوزوم بر رو...

سلول های یوکاریوتی به کمک پروتئین های هیستون بسته بندی شده و تشکیل نوکلئوزوم می دهند. نوکلئوزوم ها طی مراحل دیگری از بسته بندی در ساختاری به اسم کروماتین در درون هسته ی سلول جا داده می شوند. بنابراین ذره ی مرکزی نوکلئوزوم (ncp) زیر واحد تشکیل دهنده ی اولیه کروموزوم است. پروتئین های هشت تایی هیستون قسمت مرکزی نوکلئوزوم را تشکیل می دهند که از چهار جفت پروتئین h2b،h2a ، h4وh3 تشکیل شده است. dna با...

بسته بندی dnaی کروموزومی توسط نوکلئوزوم و سازمان یابی ژنوم، دسترسی فاکتورهای تنظیمی به dna را محدود می کند. این محدودیت باعث می شود که نوکلئوزوم ها و سایر ساختارهای کروماتینی به طور فعالی در تنظیم رونویسی ، جدایی کروموزوم ها، همانندسازی و تعمیر dna اهمیت پیدا کنند. سلول برای دسترسی به dnaی بسته بندی شده و سازمان دهی اجزاء نوکلئوزومی در نواحی کروموزومی، از مجموعه های تغییرشکل دهنده ی کروماتین اس...

در موجودات یوکاریوتی dna با پروتئین های هسته ای هیستون همراه شده و کروماتین را شکل می دهد. نوکلئوزوم، واحد سازنده ی کروماتین است که هر جفت باز در طول ژنوم تکرار می شود. فرآیندهای ژنتیکی حیاتی نظیر همانندسازی، رونویسی، نوترکیبی، و بیماری هایی نظیر سرطان و عفونت های ویروسی بستگی به دسترسی به محتوای dna کروماتینی دارند و تحت تاثیر ساختار نوکلئوزوم قرار می گیرند. پروتئین های هیستونی در دو گروه کلی:...

تعیین ساختار dna در برهم کنش با پروتئین ها می تواند به شناخت ساز و کارهای حیاتی در سیستم های سلولی که شامل dna هستند، کمک کند. در این بر هم کنش ها و تنش هایی که به مولکول ِdna وارد می شود، مولکول تغییر شکل می یابد. شکل کلی dna تغییر شکل یافته را می توان با یک مدل کشسانی مناسب توصیف کرد. در این پایان نامه می خواهیم با در نظر گرفتن خواص کشسانی و هندسی مولکول dna، ساختار آن را در شرایط مختلف و تح...

قرقره ای را در نظر بگیرید که دو دور نخ حولِ آن پیچیده شده و دو سرِ نخ از طرفینِ آن آویزان است. در ضمن فرض کنید قسمت های مجزایی از قرقره خاصیت چسبندگی دارند و نخ می تواند به آن قسمت ها بچسبد. حال اگر به این سیستم نیرو وارد کنیم، بسته به نحوه ی وارد کردنِ نیرو، ممکن است دو اتفاق برای نخ و قرقره بیفتد. اگر دو سرِ آزاد نخ را از دو طرف بکشیم، به قرقره گشتاور وارد شده و نخ حتماً از دور قرقره باز می شود. ان...

چکیده ندارد.

کمپلکس های پروتئینی که به عناصر dnaیی gaga متصل می شوند برای جا به جا یی نوکلئوزوم ها ضروری هستند ، سه تا چهار عنصر ga برای تخریب نوکلئوزوم های از پیش ساخته لازم است . در یک مطالعه ی قبلی پروموتر مرکزی ژن های کد کننده ی پروتئین انسانی که دارای تکرارهای طویل و استثنائی ga هستند شناخته شد . نقش تکرارهای ga در پروموتر مرکزی در ابتدا با بررسی پروموتر مرکزی ژن sox5 ، که درگیر در مراحل مختلف رشد و نم...

تمام سلول های موجود زنده چند سلولی توالی های ژنتیکی مشابهی دارند، اما با بیان ژن مخصوص خود برنامه ریزی می شوند. این امر به انواع سلول های مجزا با عملکردهای تخصصی مختلف منجر می شود. بیان ژن توسط مکانیزم های اپی ژنتیک مثل تغییرات هیستون کارگردانی می گردد. در سلول های یوکاریوتیک، توالی dna به طول 147 جفت باز به دور پروتئین های هیستونی هشت تایی پیچیده می شوند. این پروتئین های هیستونی دارای دُم هایی ...