با توجه اهمیت و عملکردهای مهم mirnaها، شناسایی mirnaهای جدید و نقش آن ها ما را در درک بهتر فرایندهای داخل سلولی یاری می کند. بنابراین استفاده از روش هایی که قادر باشد ما را سریعتر به این مهم برساند ضروری است. رویکردهای کامپیوتری بر اساس ویژگی های ساختاری، حفظ شدگی در طول تکامل و همچنین میزان انرژی آزاد ساختارهای پیش بینی شده طراحی شده اند. در این رویکردها از چندین نرم افزار و سایت به موازات هم ...

listeria monocytogenes یک پاتوژن غذایی گرم مثبت، درون سلولی اختیاری و سریع الرشد فرصت طلب است که در بیماران مستعد از نظر ایمنی لیستریوزیس ایجاد می کند. میزان مرگ و میر لیستریوزیس بیش از 20% است. همچنین مننژیت، انسفالیت و مننگوانسفالیت و نیز سقط جنین در زنان باردار از عوارض عفونت با این باکتری است. acta و لیستریولیزین o (llo) دو فاکتور ویرولانس مهم این باکتری هستند. acta یکی از پروتئین های سطحی ...

سیستم ایمنی انسان شامل انواع متنوعی از سلول¬ها و مولکول¬ها می¬باشد که در ارتباط تنگاتنگ با سایر سیستم¬های بدن می¬باشند. مقادیر افزاینده¬ی داده¬های تولید شده در دوره¬ی پساژنومیک بررسی این سیستم را پیچیده¬تر گردانده است. بنابراین نیاز به استفاده از رویکردهای محاسباتی و کامپیوتری جهت پردازش و تفسیر داده¬ها محسوس¬تر می¬باشد. ایمونوانفورماتیک به عنوان زیرمجموعه¬ای از بیوانفورماتیک رویکردی جدید با ا...

آر.ان.ای­ های کوچک غیر کدکننده، نقش­ های مختلفی در رشد و توسعه گیاهان و حیوانات ایفا می­کنند. این آر.ان.ای‌های تنظیم­ گر، رشد و نمو را از طریق تنظیم سایر ژن­ها در سطوح رونویسی، پس از رونویسی و ترجمه هدایت می­کنند. فعالیت این ژن­ها از طریق تنظیم در سطح دی.ان.ای از طریق متیلاسیون، تبدیل یوکروماتین به هتروکروماتین و در سطوح دیگر از طریق برش آر.ان.ای­ های هدف، یا ممانعت از ترجمه آن­ها صورت می­ پذیر...

در پژوهش­های پیشین از بخش خالص شده پروتئوم باکتری xanthomonas campestris pv. campestris (xcc) که قابلیت محرک تولید اتیلن در گیاه آرابیدوپسیس را داشت، حدود 60 پروتئین مختلف شناسایی شدند که از بین آنها هشت پروتئین به عنوان پروتئین فرضی محافظت شده بودند. هدف از انجام این پژوهش توصیف این پروتئین­ها توسط ابزارهای بیوانفورماتیک مختلف می­باشد. همه پروتئین­های مورد بررسی دارای جرم مولکولی متوسطی بودند....

شیوع سیاه زخم طبیعی در انسان نادر است اما از آنجایی که این باکتری پتانسیل بالایی جهت استفاده به عنوان سلاح بیولوژیکی دارد تلاش ها برای تولید واکسن علیه این باکتری رو به افزایش است. ترکیب آنتی ژن ها با زیرواحد b کلرا توکسین ctb می تواند پاسخ آنتی بادی موکوزی قوی ایجاد نماید و به عنوان واکسن معرفی شود. در این مطالعه، ابتدا توالی های مربوطه از پایگاه داده ncbi اخذ و پس از بهینه سازی، از لینکری منا...

سیستم ایمنی انسان شامل انواع متنوعی از سلول¬ها و مولکول¬ها می¬باشد که در ارتباط تنگاتنگ با سایر سیستم¬های بدن می¬باشند. مقادیر افزاینده¬ی داده¬های تولید شده در دوره¬ی پساژنومیک بررسی این سیستم را پیچیده¬تر گردانده است. بنابراین نیاز به استفاده از رویکردهای محاسباتی و کامپیوتری جهت پردازش و تفسیر داده¬ها محسوس¬تر می¬باشد. ایمونوانفورماتیک به عنوان زیرمجموعه¬ای از بیوانفورماتیک رویکردی جدید با اب...

زمینه و هدف: تیروزیناز یک آنزیم کلیدی در تولید رنگ دانه است. اختلالات مربوط به افزایش رنگ دانه در نتیجه تولید بیش ازحد ملانین در پوست ایجاد می شود؛ بنابراین گسترش مهارکننده های این آنزیم در زمینه های پزشکی، آرایشی و کشاورزی حائز اهمیت است. هدف این پژوهش بررسی بیوانفورماتیکی مهار آنزیم تیروزیناز به وسیله ی تعدادی از مشتقات هیدروکسی نیترو دی فنیل اتر است. مواد و روش ها: این پژوهش به روش توصیفی –ت...

پروتئین های آرگونات از جمله پروتئین های دخیل در بحث خاموشی ژن می باشند که فعالیت اندونکلئولیتیکی برای بسیاری از آنها به اثبات رسیده است. هدف از این تحقیق شناسایی و بررسی پروتئین های آرگونات موجود در ژنوم 6 گیاه دارویی با استفاده از ابزارها و روش های بیوانفورماتیکی می باشد. توالی های اسید آمینه ی پروتئین های آرگونات گیاهان مورد بررسی با استفاده از توالی های پروتئین های آرگونات آرابیدوپسیس، از پا...

شوری خاک یکی از عوامل مهم محیطی است که منجر به کاهش عملکرد گیاهان زراعی می شود. شناخت مکانیسم های مقاومت گیاهان در برابر تنش ها می تواند به شناسایی ژن های مقاومت و کاربرد آن ها در اصلاح گیاهان و افزایش محدوده کشت گیاهان منجر شود. روش آنالیز expressed sequence tag (est) و داده های ریزآرایه راهی سریع و منطقی برای شناسایی ژن های نامزد جدید برای مقاومت به تنش ها می باشد. در این تحقیق تعداد 2 کتابخا...