یکی از مباحث مهم در انتخاب ژنومی، استفاده از روشی مناسب برای برآورد اثر نشانگرها و ارزیابی ژنومی است. اخیراً روش­های یادگیری ماشین1 که جزو روش­های ناپارامتری غیرخطی هستند وارد ارزیابی ژنومی شده­اند. یکی از این روش­ها الگوریتم جنگل تصادفی2 است که این تحقیق روی نحوه تنظیم این روش متمرکز شده است. پارامترهای مهم در الگوریتم جنگل تصادفی به ترتیب اهمیت، تعداد متغیر انتخاب شده در هر گره درخت3، تعداد در...

اصلاح برنج برای تحمل به خشکی نیازمند ارزیابی صحیح تنوع موجود در جمعیت های اصلاحی و تجزیه ژنتیکی شاخص های مرتبط با تحمل به خشکی است. در این مطالعه، 150 فامیل f5 حاصل از تلاقی بین ارقام سپیدرود (indica) و غریب (indica) به منظور مکان یابی چند صفتی نواحی ژنومی (qtls) کنترل کننده شاخص های تحمل به خشکی در دو شرایط نرمال و تنش مورد ارزیابی قرار گرفتند. نتایج حاصل از تجزیه بای پلات نشان داد که شاخص های...

در این تحقیق واکنش به تنش شوری و ساختار کروموزومی لاین های bc1f5 حاصل از تلاقی یک رقم گندم نان (2n = 6x = 42, aabbdd) ایرانی به نام روشن و یک آلوهگزاپلوئید مصنوعی به نام تریتی پایروم (2n = 6x = 42, aabbebeb) بررسی شد. گونه دیپلوئید تینوپایروم بسارابیکوم (2n = 2x = 14, ebeb) بومی مناطق دریای سیاه و مدیترانه می باشد که در حضور 350 میلی مولار نمک طعام چرخه زندگی خود را تکمیل می کند. در غلات مقاومت...

مقدمه: مایکوباکتریوم بویس عامل اصلی ایجاد سل در گاوها است. در مطالعۀ حاضر یافته های مربوط به جداسازی، تعیین هویت وتهیۀ الگوی ژنومی باکتری های عضوکمپلکس مایکوباکتریوم توبرکولوزیس (mtbc) از گاوهای توبرکولین مثبت استان قمباروشrflpبااستفادهازپروبpgrsبررسیشدهاست. ‏‏ مواد و روش‏‏ها: از دی 1391 تا بهمن 1392 عقده های لنفاوی اصلی سر و تنه لاشۀ 30 رأس گاو توبرکولین مثبت استان قم بر روی محیط لونشتاین ـ جا...

میکروب های موجود در اکوسیستم میکروبی شکمبه نشخوارکنندگان که کنسرسیوم پیچیده ای از گروه های مختلف میکروبی را تشکیل می دهند، به عنوان دستگاه های متابولیک انجام وظیفه می کنند. این میکروب ها نقش مهمی را در سلامت و عملکرد حیوان ایفا می کنند. کارایی نشخوارکنندگان در استفاده از خوراک های مختلف به علت وجود اکوسیستم به شدت متنوع میکروبی شکمبه می باشد. یکی از مهمترین اختلالات متابولیکی که در نشخوارکنندگا...

به منظور مطالعه صحت ارزش اصلاحی و پیشرفت ژنتیکی در صفات آستانه، ژنومی متشکل از 6 کروموزوم، هر یک به طول 100 سانتی مورگان شیبه سازی شد. برای ایجاد عدم تعادل پیوستگی کافی و تعادل رانش- جهش بعد از 50 نسل آمیزش تصادفی در یک جمعیت با اندازه موثر 100 نفر، تعداد افراد به 1000 نفر شامل 500 نر و 500 ماده افزایش یافت. سه مقدار وراثت پذیری (0/05، 0/30 و 0/80) و چهار تعداد متفاوت برای نشانگرها (100، 200، 4...

جنس­های تریتیکوم و هوردئوم، دو جنس­ از طایفه تریتیسه (triticeae) با گونه­های زراعی مهم می­باشند. ارزیابی روابط فیلوژنتیک گونه­های زراعی و خویشاوندان وحشی این جنس­ها برای استفاده بهینه از آن­ها در برنامه­های اصلاحی ضروری است. در این آزمایش روابط فیلوژنتیک چهار گونه از جنس تریتیکوم و سه گونه از جنس هوردئوم با استفاده از 150 جفت آغازگر ریزماهواره جو مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج نشان داد که در مجم...

صفات تولیدمثل بدلیل تاثیر زیاد بر سودآوری، در صنعت پرورش گاوهای شیرده جزء صفات عملکردی محسوب می‌شوند. به دلیل وراثت‌پذیری پایین این صفات، پیشرفت ژنتیکی آن‌ها به کندی صورت می‌گیرد. بنابراین، انتخاب ژنومی یک روش موثر برای افزایش پیشرفت ژنتیکی این صفات می‌باشد.صحت انتخاب ژنومی وابسته به عوامل زیادی از جمله، وراثت‌پذیری صفات، روش آماری محاسبه اثرات نشانگر تک نوکلئوتیدی SNP در جمعیت مرجع و تعداد افر...

برآورد دقیق اجزای واریانس ژنتیکی و غیرژنتیکی با اطلاعات شجره‌ای و ژنومی، از ملزومات پیش‌بینی صحیح ارزش‌های اصلاحی می‌باشد. از آنجایی که تراشه‌های چندشکلی تک‌نوکلئوتیدی (SNP) کل ژنوم را پوشش می‌دهند، نشانگرها تمامی جایگاه‌های صفات کمی را تحت پوشش قرار داده و به طور بالقوه تمام واریانس ژنتیکی را توجیه می‌کنند. در این پژوهش از SNPهای گوسفندان مرینوس استرالیایی استفاده شد. صفات طول و قطر تار پشم مو...

یافتن ژن ها در میان توالی های ژنومی و تحلیل و مقایسه ی آن ها جهت پیش بینی ساختار پروتئین یکی از مهمترین مباحث علم بیوانفورماتیک است. در این پایان نامه به تحلیل و مقایسه ی توالی های ژنومی و تشابه آمینواسیدها پرداخته شده است. برای این منظور فضای پلی نوکلئوتید فازی و برخی از ویژگی های ان معرفی شده است و سپس توای های ژنومی جهت پیدا کردن درجه تشابه و تفاوتشان تحلیل و مقایسه شده اند. سپس با استفاده ا...