زمینه مطالعه: ردیابی ژن های مربوط به عوامل حدت که در یک سویه از اشریشیا کلی حضور دارند جهت تعیین پروفایل ژنوتیپی و همچنین قرارگیری سویه در پاتوتیپی خاص از اهمیت فوق العاده ای برخوردار است. هدف: هدف از انجام این مطالعه تعیین پاتوتیپ جدایه های مختلف e. coli جدا شده از گوساله ها و طیور بومی ایران با استفاده از تکنیک ریزآرایه می باشد. روش کار: در مطالعه حاضر تعداد 67 جدایه از اشریشیا کلی پـس از...

سالیان متمادی است که بشر می کوشد به راز بیماری ها پی برده و علت وجودی آن ها را دریابد .امکان بهره گیری از علم و فن آوری سایر علوم، دانشمندان عرصه بیولوژی را بر آن داشت که تحقیقات خود را متوجه کوچک ترین واحد زنده یک ارگانیسم، یعنی سلول نمایند. sechenaدر سال 1996 روشی را ارائه نمود که بر مبنای آن محققین قادر شدند به طور هم زمان ژن های موجود در دو بافت سالم و سرطانی را مطالعه نمایند. این تکنولوژی ...

چاره گانی  ح. 1394. کاربرد فن آوری ریزآرایه ها در نماتدشناسی گیاهی. دانش بیماری شناسی گیاهی 5(1):89-76. در طی یک واکنش سازگار، نماتدهای مولد غده ریشه (meloidogyne spp.) با تحریک تولید سلول های غول آسای چند هسته ای منجر به ایجاد تمایز در ریشه گیاه میزبان می گردند. رشد و تکثیر بیش از اندازه سلول های اطراف سلول های غول منجر به تولید غده روی ریشه گیاه میزبان می شود. مطالعات مختلف نشان داده که تغییر...

یک ریزآرایه ماتریکسی از ردیف های حاوی توالی نمونه هاست که روی یک سطح ثابت شده اند. این روش بر اساس قواعد جفت شدن بازها محیطی را برای جفت شدن نمونه های شناخته شده (پروب ها) با نمونه های ناشناخته (الگوها) فراهم می آورد. برخلاف روش های قدیمی تر که عمدتاً بر پایه بررسی یک ژن در هر آزمون عمل می کنند، ریزآرایه ها وسعت عمل بسیار گسترده ای دارند، به طوری که می توان کل ژنوم را روی یک تراشه ژنی بررسی کرد....

امروزه حجم عظیمی از مطالعات پزشکی در جهت شناسایی و درمان بیماری هایی است که از طریق ژن منتقل می شود. برای بررسی و نگهداری اطلاعات ژنتیکی، فناوری های مفیدی به وجود آمده است که یکی از ‎‎‎آن ها‏، فناوری ریزآرایه می باشد. تجزیه و تحلیل اطلاعات به دست آمده از ریزآرایه ها به کمک روش های داده کاوی انجام می شود. یکی از این روش ها خوشه بندی است که می تواند در یافتن گروه های واقعی و نهفته در داده ها موثر...

وجود داده های گمشده در داده های ریزآرایه، سبب کاهش دقت رسم شبکه های تنظیمی ژن، ایجاد اشتباه در خوشه بندی و تقسیم بندی تخصصی ژن ها و سایر تحلیل ها می شود. بنابراین تخمین داده-های گمشده مرحله مهمی در پیش پردازش داده های ریزآرایه، محسوب می شود. عملکرد الگوریتم-های تخمین در مجموعه داده های مختلف و با درصدهای متفاوت گمشدگی، متغیر است. همواره انتخاب مناسب ترین الگوریتم به منظور دستیابی به بیشترین دقت...

داده های ریزآرایه در تشخیص و طبقه بندی انواع بافت های سرطانی نقش بسزایی دارند. در پژوهش های سرطان همیشه تعداد نسبتا کم نمونه ها در ریزآرایه باعث ایجاد مشکلاتی در طراحی طبقه بندها شده است. بنابراین داده های ریزآرایه قبل از طبقه بندی از طریق تکنیک های انتخاب ژن پیش پردازش و ژن های فاقد اطلاعات آن ها دور ریخته می شود. اساسا یک روش انتخاب ژن مناسب می تواند بطور موثر کارایی دسته بندی بیماری ها (سرطا...

امروزه باتوجه به گسترش روزافزون اطلاعات و پیشرفت¬هایی که در زمینه¬های پزشکی صورت گرفته است، استفاده از روش¬هایی که بتوان سرعت انجام کار و دقت را افزایش و هزینه آزمایش¬ها را کاهش داد؛ امری غیرقابل اجتناب است. با استفاده از تکنولوژی ریزآرایه¬ها می¬توان میزان بیان چندین هزار ژن را اندازه گرفت. از چالش¬هایی که برای تجزیه و تحلیل داده¬های ریزآرایه با آن روبرو هستیم، تعداد زیاد ژن¬ها در این مجموعه دا...

پس از آن که در سال 1996 سشنا تکنولوژی ریزآرایه را کشف کرد، به یک باره حجم انبوهی از داده های مربوط به ژن انسان در اختیار محققین قرار گرفت. همین امر سرآغاز ایجاد شاخه ی جدیدی در علم بیوانفورماتیک برای تشخیص بیماری ها بویژه سرطان گشت. محققین توانستند با تحلیل داده های ریزآرایه و کلاس بندی ژن ها به نتایج مقبولی در زمینه ی تشخیص انواع مختلف سرطان برسند اما همچنان با چالش تعداد بسیار زیاد ویژگی های ...

سابقه و هدف: فناوری ریزآرایه برای بررسی همزمان بیان هزاران ژن در بازه وسیعی از ژنومیک، نظیر شناسایی ژنها، اکتشاف داروها و تشخیص‌‌های کلینیکی مورد استفاده قرار گرفته است. آزمایشهایی که بر اساس فناوری ریزآرایه انجام می‌شوند حجم بسیار زیادی از داده‌ها را فراهم می‌کنند که در مطالعات بیولوژیک بی‌نظیر بوده است. نرمال سازی، خوشه‌بندی، طبقه‌بندی و ... از جمله روشهای مورد استفاده در تحلیل آماری این نوع ...