بررسی مقایسه ای خانواده ژنی آکواپورین ها با استفاده از روش های بیوانفورماتیکی و محاسباتی

آکواپورین ها خانواده پروتئین های کانالی غشاء مخصوص ورود آب می باشند که برای حیات ضروری اند. بدلیل اینکه آن ها انتقال سریع و اختصاصی آب و بعضی مولکول های دیگر را تسریع می کنند. آنها در همه موجودات زنده از باکتری ها تا انسان یافت می شوند. جهش های نقض عملکرد در آکواپورین های انسانی منجر به ایجاد بیماری هایی نظیر دیابت بی مزه کلیوی می گردند. هدف از این پژوهش مطالعه تکامل مولکولی ژن های خانواده آکواپورین ها بود. برای انجام این منظور ابتدا توالی های به blast دریافت گردید سپس ابزار بیوانفورماتیکی ncbi و پروتئین آکواپورین انسانی از پایگاه اطلاعاتی rna و dna msa منظور یافتن اعضای نزدیک خانواده ژنی مزبور به کار برده شد. در مرحله بعدی روش همردیف سازی چندگانه توالی یا جهت پیدا کردن موتیف های حفظ شده صورت گرفت و در مرحله بعد درخت های فیلوژنتیکی برای سهولت در پیدا کردن موتیف های و ارتباط تکاملی انجام گردید. بررسی اطلاعات بدست آمده پیشنهاد می کند که یک رابطه ویژه نزدیکی بین اعضای خانواده آکواپورین وجود دارد. بلوک های حفظ شده در سطح توالی های اسیدآمینه ای و نوکلئوتیدی نیز پیدا شد.