هدف اصلی این تحقیق بهینه سازی روش relative quantitative real-time pcr مبتنی بر سایبرگرین جهت اندازه گیری نسبی بیان دو ژن p53 و vegf-c در نمونه های مبتلا به سرطان پستان و طبیعی در سگ بود. 8 نمونه بافت طبیعی و 11 نمونه بافت سرطانی پستان سگ قبل از درمان و بدون آلودگی جمع آوری شدند.rna ی کل بافت های پستانی، استخراج و قطعات ژنی p53، vegf-cو ? -actin توسط واکنش رونویسی معکوس cdna سنتز شد. داده های خام بصورت ct از دستگاه گرفته شد و با استفاده از نرم افزار sds v1.4 آنالیز شدند. ?ct های بدست آمده با استفاده از آزمون student t-test مورد تجزیه وتحلیل آماری قرار گرفتند. یافته های این مطالعه نشان دادند که هر سه ژن در بافت های طبیعی و سرطانی بیان می شوند و بیان ژن های vegf-c و p53 در بافت های سرطانی نسبت به بافت های طبیعی بیشتر بود (p < 0.01). لذا آزمون بررسی تفاوت میزان بیان ژن های p53 و vegf-cدر بافت های سرطانی نسبت به میانگین نمونه های طبیعی انجام شد و نتایج نشان دادند که بیان ژن vegf-c در 100 درصد نمونه ها افزایش داشته است. اما بیان ژن p53 به ترتیب در 9، 18 و 73 درصد نمونه های سرطانی نسبت به میانگین نمونه های طبیعی کاهش، بدون تغییر و افزایش داشته است. نتایج نشان دادند که این ژن ها به خوبی می توانند به عنوان مرجعی به منظور شناسایی و غربالگری بیماران سرطانی از افراد سالم حتی در مراحل اولیه بیماری مورد استفاده قرار گیرند.

در این مطالعه، بر اساس منطقه 16s rdna باکتری شکمبه ای هضم کننده سلولز، بوتیریویبریو فیبری سالونس، یک روش واکنش زنجیره ای پلیمراز رقابتی (cpcr) بهینه سازی شد. آغازگرهای اختصاصی این باکتری برای تکثیر یک قطعه 213 جفت نوکلئوتیدی از ناحیه 16s rdna (dna هدف) از منابع انتخاب گردید. برای تولید قطعه رقابتگر همولوگ با قطعه هدف، دو آغازگر داخلی، که هر کدام حامل حدود 30 نوکلئوتید در انتهای ?5 خود بودند (به صورتی که بتوانند تکثیر شوند و مکمل یکدیگر باشند) طراحی شدند و یک واکنش soe-pcr شامل سه واکنش مجزای pcr با استفاده از جفت آغازگرهای متفاوت انجام شد. قطعه حاصل از این واکنش ها در نهایت علاوه بر توالی نوکلئوتیدی قطعه هدف دارای 50 نوکلئوتید بیشتر می باشد. جهت افزایش بیشتر صحت pcr رقابتی و همچنین استفاده های آتی از این قطعه و سهولت تعیین دقیق تعداد نسخه های آن این قطعه در داخل یک ناقل پلاسمیدی (ta) و با استفاده از باکتری e. coli به عنوان میزبان، همسانه سازی شد و صحت توالی همسانه سازی شده بوسیله هضم آنزیمی پلاسمید نوترکیب مورد تأیید قرار گرفت. واکنش pcr رقابتی با استفاده از مقادیر مشخصی از dna پلاسمیدی به عنوان رقابتگر بهینه سازی شد و نتایج به دست آمده با استفاده از نرم افزار image j تجزیه و تحلیل شدند. نتایج نشان دادند روش استفاده شده به خوبی قابلیت تشخیص و تعیین کمی مقادیر باکتری بوتیریویبریو فیبری سالونس را در نمونه های گرفته شده از شکمبه را دارا می باشد.

بار روی کار آمدن حکومت صفویان در ایران فصل تازه ای در تحولات اجتماعی ایران آغاز شد که در آن مذهب بسیاری از ایرانیان دگر گونه شد . شاه اسماعیل صفوی ، موسس سلسله صفوی ، با پی افکندن این سلسله ، برای همیشه در تاریخ ایران ماندگار شد .اما از تشکیل این سلسله جالبتر نحوه تعامل میان ایلاتی که به پشتیبانی از خاندان صفوی بر خاستند و قزلباش نامیده می شدند ، می باشد. ارتباط عاطفی که میان سران خاندان صفوی و افراد ایلات قزلباش برقرار بود، نقش بسیار مهمی در پیروزیهای پی در پی صفویان داشت . با پیروزی خاندان صفوی و تشکیل حکومتی به نام این خاندان ، قزلباش نقش بسیار مهمی در اداره مسائل مختلف حکومتی ایفا کردند که در اوایل آن حکومت نمود بیشتری داشت. حضور ایلات قزلباش در ساختار حکومت صفوی در مواقع مختلف تاثیرهای متفاوتی را بر جایی گذاشت که البته شیوه تاثیر گذاری آنها یعنی تاثیر مثبت یا منفی داشتن در بسیاری از مواقع به شخصیت شاه بستگی داشت که درخشانترین و بهترین ارتباط میان شاه و زیر دستانش یعنی قزلباش به دوره نخست حکومت او یعنی از سال 907 تا 920 ه . ق بر می گردد. در مورد این ارتباط در زمان شاهان دیگر صفوی دارای فراز و نشیب هایی است.

در این مطالعه به منظور امکان سنجی تعیین جنسیت اسپرم گاو توسط تکنیک real-time pcr،تعداد کپی ژنsry که مسئول تولید صفات ثانویه جنسی درجنس نر و بر روی کروموزوم yقراردارد به عنوان شاخص برای شمارش تعداد کروموزوم yدر اسپرم وتعداد کپی ژن plp که مسئول تولید پروتئولیپید پروتئین و بر روی کروموزوم x می باشد، به عنوان شاخص برای شمارش تعداد کروموزوم x در اسپرم در نظر گرفته شدند. بدین منظور استخراج dnaبا یک روش اختصاصی از45نمونه اسپرم گاو انجام گرفت.به منظور تکثیر دوژن sryوplpدر سطح dna دوجفت پرایمر اختصاصی برای این دو ژن طراحی و بخوبی تکثیر را در سیستم pcrنشان دادند.به منظور مطالعه کمی و ساختن نمونه استاندارد و نهایتا ترسیم منحنی استاندارد ، محصولات pcr حاصل از تکثیر این دو ژن به روش t/a cloning در وکتور ptz57r/t کلون شدند. برای تایید اولیه کلونینگ، از تکنیک joint pcr استفاده شد ، برای تایید نهایی همسانه سازی، نمونه ها تعیین توالی شدند. سپس از هر پلاسمید نوترکیب پنج رقت ng/µl (106،105،104،103، 102 ) ساخته شدند.این رقت ها در واکنش real-time pcr هریک دارای یک ctمشخص بودند و بدین ترتیب منحنی استاندارد حاصل از این رقت ها و ctمرتبط با هر رقت و معادله خط مربوط به آن بدست آمد که با قرار دادن ctنمونه آزمایشی در این معادله تعداد کپی هریک از ژن های sryو plp که به ترتیب نمایانگر تعدادکروموزوم xوyمی باشند،محاسبه شدند. به منظور ارزیابی و اعتبار سنجی دقت روش، پارامترهای repeatability، reproducibility و accuracy محاسبه شدند. dnaاستخراج شده از نمونه های اسپرم مورد آزمایش قرار گرفتند که نتایج بدست آمده با دقت بالا و نزدیک به نتایج مورد انتظار بودند (1:1) میانگین تعداد کروموزوم شمارش شده برای غلظت های متفاوت dna موجود در واکنش های repeatability، که در دومرحله انجام شده بودند نیز تفاوت معنی داری نداشتند.نتایج حاصل از 10 تکرار از یک نمونه اسپرم در هر رقت با 2 تکرار برای شمارش کروموزوم x به منظور ارزیابی آزمون reproducibility مربوط به این روش مورد بررسی قرار گرفتند. میانگین تعداد کروموزوم برای غلظت های متفاوت dna موجود در این مرحله به لحاظ آماری وبا در نظر گرفتن احتمال خطای 5درصد تفاوت معنی داری داشتند.به منظور تایید عملکرد صحیح این روش ،آزمون accuracy نیز صورت پذیرفت بدین صورت که از 5 نمونه خون حاصل از 5 گاو نر استخراج dna به عمل آمد واز هرنمونه 4 رقت ساخته شد تا نتایج مورد انتظار یعنی 50% سلول های حاوی کروموزوم x باشند مورد بررسی قرار گیرد. از همین نمونه ها و رقت ها برای شمارش کروموزوم های y نیز استفاده شد. ضریب تغییرات رقت های مختلف مشابه بودند..نتایج بدست آمده در این مطالعه به خوبی نشان میدهد که روش real-time pcr قابلیت شمارش کروموزوم های جنسی و تعیین نسبت جنسی را در اسپرم دارامی باشد.در طی انجام این پروژه،توالی یابی ژن ها ی sryو plpنیزانجام گرفت که توالی ها با شماره دستیابی hq908797 برای ژن sryو با شماره دستیابی hq875721 برای ژن plpدر بانک اطلاعاتی ncbiثبت شدند.

تحقیق حاضر در خصوص نسخه خطی مربوط به دوره قاجاریه است که به صورت منظوم است. این نسخه بیانگر رویدادها و حوادث سالهای 1249 تا 1253 است. یعنی از مرگ عباس میرزا تا مرگ قائم مقام را در بر می گیرد. مولف نسخه سعی کرده رویدادهای تاریخی نه به صورت جزئی بلکه به صورت کلی بیان کند اما سعی شده که اتفاقات و رویدادهای مهم مربوط به سالهای مورد بحث را در برگیرد. از اتفاقاتی که می توان در آن سالها بیان کرد مرگ عباس میرزا و ولیعهدی محمد میرزا به کمک روسها می باشد و سپس مرگ فتحعلی شاه و آشفته شدن اوضاع سیاسی ایران و سر برآوردن مدعیان حکومت یکی پس از دیگری و سپس فائق آمدن محمد میرزا به کمک قائم مقام بر همه مدعیان و به تخت نشستن او را در این نسخه مشاهده می کنیم . اما متاسفانه مولف این نسخه ناشناس بوده و هیچ شناختی از نویسنده نداریم اما برجسته ترین نکته این نسخه را می توان به هم عصر بودن مولف و زمان رویدادها دانست.

در آزمایش اول تعداد 106581 رکورد روز آزمون ماهانه از 12677 گاو دوره اول تولید هلشتاین ایران که از 151 گله می باشند مورد استفاده قرار گرفت. اثرات عوامل موثر بر روی تولید شیر که با نرم افزاز sas مورد آنالیز قرار گرفت شامل اثرات گله، سال زایش، سن زایش، فصل تولید، سن و روزهای شیردهی بودند. آنالیز واریانس اثرات عوامل محیطی و کمکی موثر بر روی پارامترهای تولید شیر توسط رویه glm مورد بررسی قرار گرفت. مقدار بیشینه میانگین حداقل مربعات تولید شیر به ترتیب برحسب کیلوگرم در فصول بهار و زمستان مشاهده گردید (07/0±98/27 )و (07/0±92/27) و حداقل این مقادیر در فصول تابستان(07/0±42/27 ) و پاییز (07/0±23/27) بدست آمد. همچنین میانگین حداقل مربعات تولید شیر با زیاد شدن سن زایش در گاوهای دوره اول تولید افزایش می یافت. با توجه به معیارهای ضریب تعیین، جذر میانگین مربعات خطا بهترین مدل های سه، چهار و پنج پارامتری به ترتیب تابع وود، داجکسترا و گراسمن انتخاب گردید. در تابع ویلمینک با ضرایب ثابت مختلف، مدل های با ضرایب ثابت 05/0 و 065/0 به ترتیب بهترین برازش را در پیش بینی تولید شیر ارایه نمودند. در این مطالعه تابع وود به علت دارا بودن تعداد پارامتر کمتر و کمتر بودن مشکلات و محدودیت های محاسباتی به عنوان تابع مناسب برای برازش منحنی تولید شیر برگزیده شد. همچنین تابع ویلمینک برای پیش بینی منحنی تولید و درصد چربی شیر انتخاب گردید. در قسمت آنالیز های ژنتیکی (آزمایش دوم) 11 مدل برای برازش در قسمت های ثابت و تصادفی در قالب روش رگرسیون تصادفی مورد بررسی قرار گرفت. در این آزمایش درجات برازش یکسان ( به منظور فراهم آوردن فرصت تنوع برابر) برای اثرات ژنتیک افزایشی و محیط دایمی مورد استفاده قرار گرفت. با توجه به نتایج حاصله با کمک مقادیر ویژه و بردارهای ویژه مربوط به مقادیر ویژه و همچنین واریانس خطا در طول دوره شیردهی، درجه برازش 3 تابع چند جمله ای لژاندر برای اثرات ژنتیک افزایشی و محیط دایمی به همراه تابع علی-شفر برای برازش قسمت ثابت برای آنالیز ژنتیکی و محاسبه ارزش های ارثی دام ها انتخاب گردید. بیشترین مقدار واریانس اثرات افزایشی در نیمه شیرواری مشاهده گردید و واریانس خطا از ابتدا به انتهای دوره شیرواری کاهش یافت. بیشترین مقدار توارث پذیری(28/0) مربوط به اواسط دوره شیرواری است (180 تا 205 روزگی) و حداقل و حداکثر در مدل های مختلف که در ابتدا و اواسط شیرواری مشاهده گردیده است برابر 06/0 و 40/0 می باشد. در آزمایش سوم، تعداد 10 مدل متفاوت با درجات برازش غیر یکسان اثرات ژنتیک افزایشی و محیط دایم با کمک توابع لژاندر( درجات برازش 3 ،4 و 5) به همراه تابع علی- شفر برای آنالیز رکوردهای روز آزمون مورد استفاده قرار گرفت. در این حالت نیز فرض غیر یکنواخت بودن خطا در آنالیزها رعایت شده و ارزیابی مدل ها براساس مقادیر ویژه، بردار های ویژه مربوط به مقادیر ویژه و واریانس خطا در طول دوره شیردهی انجام گرفت. در این حالت مدل مناسب درجه برازش 3 و 4 به ترتیب برای اثرات ژنتیک افزایشی و محیط دایمی و تابع شفر برای برازش قسمت ثابت مدل پیشنهاد گردید. ارزیابی منحنی شیردهی با تابع علی- شفر نشان داده است که اوج تولید شیر در گاوهای شیری ایران حدود 90 روزگی است نه 60 روزگی. همچنین مقایسه مدل های مختلف ارزیابی دوام شیرواری بر مبنای ارزش ارثی حاصله توسط روش رگرسیون تصادفی نشان داد که شاخصی که تفاضل ارزش ارثی در روزهای 290 و 90 شیردهی را محاسبه می نماید به عنوان شاخص مناسب در ارزیابی دوام شیرواری می باشد. نزدیک تر بودن این شاخص به صفر در مقایسه با دیگر شاخص ها و حداقل بودن همبستگی بین این شاخص با ارزش ارثی 305 روزه باعث انتخاب شدن این مدل گردید. در نهایت در آزمایش چهارم 6 مدل ساده تر (غیر رگرسیون تصادفی) به همراه گروه های معاصر مختلف (گله- سال- فصل تولید و گله- سال- فصل زایش) بر روی رکورد های روز آزمون گاوهای شکم اول مورد بررسی قرار گرفت. نتایج نشان داد که لحاظ نمودن اثر گروه معاصر گله –سال- فصل تولید در تمام مدل ها باعث افزایش دقت تخمین ارزش ارثی و کاهش واریانس خطا در مقایسه با اثر گروه معاصر گله- سال- فصل زایش می شود. مدل تکرار پذیری با هر نوع اثر گروه معاصر مدلی مناسب برای ارزیابی ژنتیکی داده های روز آزمون تولید شیر نیست. مدل رگرسیون ثابت از مدل تکرار پذیری نتایج بهتری را نشان داده است. همچنین ارزیابی تولید شیر پیش بینی شده در روزهای 290 و 90 شیردهی با کمک تابع علی- شفر نشان داده است که توارث پذیری تولید شیر در این روزها تقریبا یکسان و حدود 19/0 بوده است اما واریانس خطا در انتهای شیرواری (290 روزگی) کمی بالاتر می باشد.

سرطان پستان مهم ترین نئوپلاسم و یکـی از عـوامل اصلـی مـرگ و میـر در زنـان می باشـد. تشخیص زودرس آن در کاهش ابتلا و مرگ میر ناشی از آن، نقشی مهمی بازی می کند به طوری که تشخیص زودرس، میزان بقا را تا 95% افزایش می دهد. چندین ژن موثر در ایجاد سرطان پستان شناسایی شده اند. هدف از مطالعه حاضر شناخت نقش جهش ژن brca1 در سرطان پستان تک گیر (sporadic) در سگ به عنوان یک مدل حیوانی می باشد. برای مشخص کردن موتاسیون ژن های brca1 از تکنیک pcr-sscp استفاده شد. تعداد 12 نمونه خون و بافت پستان از سگ های مبتلا به سرطان پستان ارجاع داده شده به کلینیک دامپزشکی دانشگاه فردوسی مشهد جراحی و جمع آوری شد. نمونه ها جهت بررسی مشخصات تومور، با تهیه لام از نمونه های بافتی، توسط پاتولوژیست تحت مطالعه قرار گرفتند. استخراج dna از نمونه ها به روش گوانیدین تیو سینات-سیلیکاژن صورت گرفت. واکنش زنجیره ای پلیمراز برای تکثیر قطعه 306 جفت بازی از اگزون 11 ژن brca1 با استفاده از جفت آغازگر اختصاصی به صورت استاندارد انجام شد. محصولات واکنش زنجیره ای پلیمراز به شیوه sscp برای بررسی تفاوت فرم فضایی رشته های منفرد بر روی ژل اکریل آمید سرد الکتروفورز و با نیترات نقره آمونیاکی رنگ آمیزی. شد. نتایج sscp جهشی در اگزون 11 در نمونه های مورد بررسی نشان نداد.

این تحقیق به منظور معرفی خصوصیات گوسفند تازه سنتز شده با نام ایران بلک و مقایسه آن با نژادهای بلوچی و آرمان انجام شد. در مرحله اول صفت بره زایی مورد ارزیابی قرار گرفت و اثر عوامل محیطی موثر بر صفت ذکر شده با رویه genmod نرم افزار sas مطالعه شد. برآورد پارامترهای ژنتیکی و روند ژنتیکی صفات بره زایی و متوسط وزن تولد بره های هر میش (صفتی برای مادر) در نژاد ایران بلک به صورت دو صفتی (خطی- آستانه ای) تکرارپذیر با روش بیزین و نمونه گیری گیبس با نرم افزار thrgibbs 1 f 90 انجام شد. در مرحله بعد برای مقایسه صفات رشد در سه نژاد مذکور، برآورد اثر عوامل محیطی بر آنها با رویه glm انجام شد و برآورد پارامترهای ژنتیکی و روند ژنتیکی صفات رشد در نژاد ایران بلک با نرم افزار wombat انجام شد.نژادهای ایران بلک و آرمان نسبت به نژاد بلوچی به طور معنی داری بره زایی بیشتری نشان دادند (01/0>p). با افزایش سن میش ها نرخ چندقلوزایی آنها کاهش نشان داد. وراثت پذیری دو صفت متوسط وزن بره های هر میش و بره زایی به ترتیب 148/0 و 266/0 و تکرارپذیری صفات ذکر شده نیز به ترتیب 674/0 و 381/0 برآورد گردید. همبستگی های فنوتیپی، محیطی و ژنتیکی بین دو صفت ذکر شده منفی و بزرگ و به ترتیب 484/0-، 369/0- و 968/0- به دست آمد. نژادهای ایران بلک و آرمان تفاوت چندانی از نظر صفات مربوط به رشد با نژادهای بلوچی نداشتند و نژاد آرمان نسبت به سه نژاد دیگر در اواخر دوره رشد افزایش وزن بیشتری کسب کرد. با استفاده از مدل مناسب برای هر کدام از صفات، وراثت پذیری مستقیم برآورد شده برای شش صفت ذکر شده(اوزان تولد، یک ماهگی، دو ماهگی، سه ماهگی، چهار ماهگی، شش ماهگی، نه ماهگی و یک سالگی) به ترتیب، (044/0±066/0)، (063/0±115/0)، (090/0±17/0)، (079/0±263/0)، (071/0±171/0) و (084/0±224/0) به دست آمد. همبستگی ژنتیکی و فنوتیپی صفات ذکر شده با یکدیگر نیز به ترتیب در دامنه 53/0 تا 97/0 و 31/0 تا 70/0 بود. روند ژنتیکی مستقیم صفات نیز به ترتیب 2، صفر، 10، 20-، 30-، 37- و 20- گرم در سال برآورد شد که به غیر از روند ژنتیکی وزن شش ماهگی بقیه روندها معنی دار نبود.

متاسفانه در سالهای اخیر تقلبات در تولید مواد غذایی افزایش چشمگیری داشته است و شناسایی بقایای بافتهای دامی در مواد خوراکی اهمیت روزافزونی یافته است. لذا تشخیص اختصاصی گونه ها و شناسایی گروه های حیوانی مورد استفاده در مواد غذایی امری ضروری می باشد. به دلیل حضور dna در همه سلول ها، می توان جهت تشخیص گونه حیوانی از آن استفاده کرد. یکی از بهترین راه های تشخیص تقلب در مواد غذایی استفاده از روشهای مولکولی مبتنی بر pcr می باشد. در این تحقیق از توالی 12s rrna از mtdna برای تشخیص تقلب استفاده شد. آغازگرهای اختصاصی طراحی شده جایگاه ژنی 12s rrna طیور در واکنش زنجیره ای پلیمراز به منظور تشخیص تقلب در 13 نمونه سوسیس و کالباس به کار گرفته شد. قطعه ی 91 جفت بازی که با استفاده از آغازگر طیور تکثیر شد را در داخل ناقل ptz57r/t همسانه سازی شد. پلاسمید نوترکیب، استخراج گردید و پس از تعیین غلظت، رقت سازی شد و به عنوان dna استاندارد مورد استفاده قرار گرفت. نتایج با استفاده از منحنی استاندارد حاصل از پلاسمید حاوی قطعه ی 91 جفت بازی از جایگاه ژنی 12s rrna ) % 98= (r2 تعیین کمیت شدند. کمی سازی در دامنه ی وسیع خطی( 50 تا 5000000 کپی ) جهت ارزیابی تعداد کپی های قطعه ی هدف در نمونه های سوسیس و کالباس مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج نشان داد که 100% نمونه های سوسیس وکالباس بر پایه گوشت گاو دارای مقادیر متفاوتی از آلودگی بافت طیور بودند. بنابراین تکنیک real-time pcr می تواند به عنوان روشی مرجع برای تشخیص کمی دقیق تر تقلبات معرفی گردد.

داده های مربوط به تجزیه کمی صفات پشم شامل 47672 رکورد وزن بیده ناشور مربوط به 13758 راس بره حاصل از 491 قوچ و 8109 میش است که در طی 28 سال (89-62) از گله های ایستگاه اصلاح نژاد عباس آباد جمع آوری گردیده و همچنین در طی سال های 1388 و 1389 از تعداد 926 راس دام نمونه پشم گرفته شد و صفات کیفی الیاف اندازه گیری شدند. اثر عوامل محیطی و ژنتیکی با استفاده از مدلهای مختلط دام بر روی 14 صفت کمی و کیفی الیاف پشم بررسی شدند. سال تولد وسن دام اثر معنی دار بر اکثر صفات کمی و کیفی پشم داشت. وزن بیده ناشور، وزن بیده تمیز و طول دسته الیاف در جنس نر بیش تر از ماده بود. سال و فصل پشم چینی تنها وزن بیده تمیز و ناشور را تحت تاثیر قرار داد. میانگین قطر الیاف دو گله ایستگاه عباس آباد با هم اختلاف معنی دار داشتند. میزان وراثت پذیری و تکرار پذیری وزن بیده ناشور به ترتیب 0/13 و 0/27 محاسبه گردید. وراثت پذیری صفات کیفی الیاف پشم شامل وزن بیده تمیز، عملکرد پشم، میانگین قطر الیاف، ضریب تنوع قطر، طول دسته الیاف، درصد الیاف حقیقی، درصد الیاف مدولا دار و درصد الیاف هتروتیپ به ترتیب 0/20، 0/23، 0/32، 0/24، 0/48، 0/65، 0/20 و 0/16 محاسبه شدند. نرخ رشد ژنتیکی وزن بیده از سال 1352 تا 1389 از طریق تابعیت میانگین ارزش های اصلاحی از سال تولد محاسبه گردید که افزایش 2/93 گرم بیده ناشور به ازای هر سال را نشان داد. بررسی میزان تنوع ژنتیکی و ساختار جمعیتی دو گله بلوچی ایستگاه عباس آباد با استفاده از 7 نشانگر ریز ماهواره ای و بر روی 503 راس دام انجام گرفت. میانگین و دامنه تغییرات آلل ها به ازای هر جایگاه به ترتیب 57/5 و 4 تا 7 آلل مشاهده گردید. متوسط هتروزیگوسیتی مشاهده شده تمام جایگاهها در هر دو گله کمتر از هتروزیگوسیتی مورد انتظار بود. آزمون تعادل هاردی-واینبرگ در کل جمعیت نشان داد که تمام جایگاه ها از تعادل خارج شده اند و انتخاب در طی سالهای مختلف فراوانی های ژنوتیپی را تغییر داده است. تجزیه واریانس بر پایه اطلاعات ژنتیکی نشان داد که بیش از 6/97 درصد اختلافات مربوط به داخل هر گله و تنها 4/2 درصد مربوط به اختلاف بین گله ای بود. میانگین محتوای اطلاعات چند شکلی برای تمام جایگاه ها در کل جمعیت برابر با 65/0 بود. نهایتا تایید تفرق qtl های موثر بر صفات کمی و کیفی الیاف پشم در نژاد بلوچی، در بخش هایی از کروموزومها ی 1، 5 و 25 بر روی 13 خانواده ناتنی پدری و با استفاده از 15 جایگاه انجام شد. آنالیز ناحیه کروموزومی مرتبط با صفات کمی (qtl) به روش مکان یابی درون فاصله ای مبتنی بر رگرسیون و با دو مدل تک qtl و دو qtl انجام گرفت. با آنالیز درونی خانواده ها چهارqtl برای صفات کمی و کیفی الیاف پشم بر روی کروموزوم 1 شناسایی گردید، که این qtl ها مرتبط با درصد اختلاط الیاف (درصد الیاف کمپ و هتروتیپ)، ضریب تنوع قطر الیاف در بیده پشم و وزن بیده ناشور بودند. آنالیز نشانگرهای کروموزوم 5 یک qtl در موقعیت cm89 مرتبط با وزن بیده تمیز را شناسایی کرد. و بر روی کروموزوم 25، تعداد هفت qtl شناسایی شد که مرتبط با صفات درصد اختلاط الیاف (درصد الیاف هتروتیپ، کمپ و حقیقی)، وزن بیده تمیز و ناشور، ضریب تنوع قطر الیاف و درصد الیاف با قطر 50-40 میکرومتر بودند.

در این مجموعه سعی بر آن است تا ، به چگونگی علم پزشکی در عهد صفویه پاسخ داده شود ونقش افکار علایق وتعصبات شاهان صفویه در رشد یا انحطاط پزشکی بیان گردد . طب صفویه دنباله رو طب اسلامی بوده ،وبر پایه ارکان اربعه ادامه یافته است . در دوره صفویه پزشکان نامداری چون بهاءالدوله نور بخشی و عماد الدین شیرازی زیسته اند که دارای ابتکارات ونو آوری بوده ونسبت به بیماری های تازه بوجود آمده در عصر خود مانند سفلیس و اعتیاد دست به تحقیق وتفحص زده اند . رسالات افیونه و آتشک از مهمترین رسالات تخصصی این دوره می باشد . دومین مورد چشمگیر در پزشکی این عصر تاثیر عقاید ، افکارو تعصبات شاهان صفوی می باشد که زمینه ساز رشد بسترهایی از پزشکی بر پایه نجوم ،پزشکی مذهبی ، آیین های شفا . در کنار پزشکی مدون می باشد. انواع شکلهای جدیدپزشکی باحمایت شاهان صفویه رشد بسیاری یافته و به عنوان رقیبی سر سخت برای پزشکی مدون گردیدند .عصر صفوی در دوران شروع شاهد جنگهای مداوم همسایگان سنی مذهب صفویان وتعدی وتجاوز دائم آنان به مرزها بودکه زمینه دوستی شاهان صفویه و روابط بسیار حسنه آنان را با سرزمین هند فراهم آورد ودرنتیجه، این روابط حسنه مهاجرت فراوان پزشکان ایرانی به هند و بسط وگسترش علم پزشکی و زبان فارسی در آن دیار می باشد . مهاجرت پزشکان ایرانی وتالیف کتتب متعدد به زبان فارسی منجر به علمی شدن زبان فارسی در آن عصر گردید .بعدها گسترش زبان فارسی در هند منجر به پیدایش زبان اردو گردید .به همین دلیل امروزه ، کتب مانده از این دوره قابل استفاده ترین کتب برای محققان پزشکی سنتی می باشد . رگه هایی از پزشکی اروپایی با ورود میسونرهای مذهبی وگروه کرملییها دراین عصر دیده می شود . در خاتممه می توان گفت پزشکی در دوره صفویه با وجود همه موانع ورقبا به آرامی رشد خود ادامه داد و توانست با پرورش تعداد زیادی پزشک وتالیفات وتحقیقات به زبان فارسی و نو آوریها دراین عرضه پزشکی ایران را زنده نگه دارد .

بیماری تب برفکی از مسری ترین بیماری دام ها بوده و از نظر اقتصادی مهم ترین بیماری گاو ، خوک و دیگر حیوانات زوج سم نشخوارکننده می باشد. این بیماری در تعداد زیادی کشورها به صورت بومی وجود دارد تحقیق پیش رو با هدف تعیین میزان بیان ژن های il-2 و il-12 در خوکچه هندی واکسینه شده با واکسن بیماری تب برفکی تیپ o صورت گرفت. با استفاده از آزمایش real time pcr میزان بیان این ژن ها سنجیده شد. برای آزمایش هشت خوکچه هندی به وزن 450 الی 500 گرم تهیه و در دو گروه تحت تیمار با واکسن و گروه شاهد قرار گرفتند. واکسن تب برفکی به مقدار 0.5 میلی لیتر در دو مرحله، روز صفر و واکسن یادآور چهارده روز بعد تزریق گردید. نمونه های خون در سه مرحله از تمام حیوانات گرفته شد و سپس استخراج rna انجام و cdna نمونه ها تهیه گردید. برای تعیین کمیت از rlative real time pcr برای هر سه ژن il-2، il-12 و –actin? انجام شد و نتایج به صورت ct از دستگاه دریافت گردید. آنالیز آماری با برنامه اکسل انجام شد. و نتایج نشان، که ژن il-2 افزایش معنی دار نداشته و اختلافات معنی داری نبود. ولی برای ژن il-12 میزان بیان افزایش داشته و اختلافات بین گروه واکسن خورده و گروه کنترل معنی دار می باشد.

ساخت حیوانات تراریخته با استفاده از اسپرم به عنوان حامل dna خارجی (smgt) یکی از روش های شناخته شده در بحث حیوانات تراریخته محسوب می شود. امروزه از تزریق درون سیتوپلاسمی اسپرم (icsi) در این روش، استفاده های قابل توجهی به عمل می آید. با توجه به سادگی و راندمان بالا در ساخت حیوانات تراریخته در روش smgt الحاق تصادفی ژن در این روش یکی از ایرادهای اساسی مرتبط با این تکنیک محسوب می شود. در این مطالعه سعی گردید کارائی سیستم phic31 integrase به عنوان یک روش انتقال هدفمند ژن، در بهبود روش smgt مورد ارزیابی قرار گیرد. بدین منظور ابتدا روش icsi با استفاده از اعمال پیش تیمار هپارین-گلوتاتیون بر روی اسپرم بهینه سازی گردید. در مرحله بعد پروتئین و mrna اینتگراز در شرایط آزمایشگاهی تولید و عملکرد محصولات تولید شده مورد ارزیابی قرار گرفت. تعداد 7 جایگاه قابل شناسائی توسط سیستم phic31 integrase بر روی ژنوم گاو در نظر گرفته شد. با طراحی پرایمرهای مناسب و واکنش pcr صحت این جایگاه ها در فیبروبلاست های تراریخته شده گاوی به وسیله سیستم phic31 integrase ، مورد بررسی قرار گرفت. راندمان سیستم phic31 integrase با استفاده از تزریق mrna به همراه اسپرم حاوی dna بررسی گردید. نتایج این مطالعه نشان داد، سیستم phic31 اینتگراز توانائی انتقال هدفمند ژن به داخل جنین های حاصل از smgt را داشت.

به دلیل پیچیدگی مکانیسم تاثیر عوامل ژنتیکی و غیر ژنتیکی مسئول بروز فنوتیپی صفت، منظور نمودن همه عوامل واقعی فوق در مدل کاربردی امکانپذیر نمی باشد. همچنین زمان بر و پر هزینه بودن تهیه جمعیت مناسب برای مطالعه، باعث گردیده است که از مطالعات شبیه سازی برای بررسی نحوه تاثیر برخی از شرایط بر روی نتایج مطالعات ژنومی استفاده شود. به دلیل زمان و هزینه بر بودن برخی از مطالعات شبیه سازی، مدلسازی و بسط مطالعه شبیه سازی با استفاده از شبکه عصبی مصنوعی (ann) از دیگر اهداف این تحقیق می باشد. در این تحقیق سه مطالعه شبیه سازی جهت بررسی تاثیر پارامترهای آزمایشی بر روی نتایج مطالعه ژنومی مورد بررسی قرار گرفت. در مطالعه شبیه سازی اول انحراف استاندارد qtl و اندازه جمعیت، فاصله مارکری میزان قدرت تشخیص qtl و صحت برآورد موقعیت و اثرات qtl را تحت تاثیر قرار داد. فواصل یک lod پشتیبان و بیزی کوچکتر بود و درصد بیشتری از آنها موقعیت qtl را در بر داشتند. در مطالعه شبیه سازی دوم مدل شبکه عصبی مصنوعی (ann) با r2 برابر 99/0 و rmse برابر 34/3 بهترین پیش بینی را نسبت به فرمولهای پیشنهاد شده ارائه داد. در مطالعه شبیه سازی سوم تاثیر برخی پارامترهای آزمایشی بر روی دقت ارزیابیهای ژنومی توسط روش glm و ann مدلسازی گردید. در کلیه مطالعات شبیه سازی نشان داده شد که مدلسازی ann بهتر از دیگر روشهای مدلسازی و فرمولهای پیشنهاد شده می باشد. کلیه مطالعات شبیه سازی با استفاده از بهترین مدل ann بسط یافته و مورد بررسی قرار گرفت. با مقایسه نتایج حاصل از مطالعات شبیه سازی اصلی و بسط یافته مشخص شد که در مطالعات بسط یافته روند تاثیر هر یک پارامترها مشابه با مطالعه اصلی می باشد و همچنین وضوح تاثیر سطوح مختلف پارامترهای آزمایشی و اثرات متقابل آنها در مطالعات بسط یافته بسیار بهتر می باشد.

قبایل کُرد در دول قراقویونلو و آق قویونلو نقش یک اهرم تعادل را داشتند.کُردان اکثریت مناطق تحت امر این دولت ها را تشکیل داده بوده و زندگی در وطن خویش را بر جهانگشایی ترجیح می دادند. در این میان هر امیر کردی تحت تاثیر جغرافیای قلمرو و نزدیکی یا دوری به مرکز دولت ها بصورت فردی با دول یاد شده ارتباط برقرار می کردولی در کل تلاش همگی آنها حفظ استقلال خود در قلمرو موروثی با اظهار مطاوعت از این دولت ها و لو به جبر یا اختیار بود .کُردان در این زمینه توانستند ارتباط حسنه ای را با قراقویونلوها و آق قویونلوها برقرار کنند بطوریکه در دیوانسالاری آنها جایگاه قابل توجهی بدست آوردند.کُردان همیشه در نزاع میان قراقویونلوها و آق قویونلوها اولی را ترجیح می دادند چون دولت یاد شده چشمداشت چندانی به قلمرو آنها نداشت.در واقع ازهمان دوره اظهار وجود قراقویونلوها به رهبری بیرام خواجه تا شکست حسنعلی در کنارآنان حضور پررنگی داشتند.آق قویونلوها سرکوب و تصرف اکثر امارت های کردی را پیشه خود ساختند ولی وجود ازدواجهای سیاسی میان آق قویونلوها با کُردان بولدوقانی(مرداسی)،زرقی و چمیشگزک خود موید اهمیت کُردان در سیاست های آنهاست سه گروه یاد شده کُردان تا به آخر متحدآق قویونلوها ماندند.مذهب در تعاملات میان کُردان با دولت های قراقویونلو و آق قویونلو تاثیر چندانی نداشت ولی در سیاست دولت نوظهور صفوی به رهبری شاه اسماعیل در اولویت اول بود و درپی آن بدون کمترین انعطاف و با خشونت تمام سعی در تثبیت مذهب تشیع در قلمرو کُردان داشت.این سیاست و به تبع آن دلایل زنجیروار دیگری مثل تعصب مذهبی کُردان،وجود شخص ادریس بدلیسی،خشونت های قزلباشان در قلمرو کُردان،وعده های سلطان سلیم عثمانی در اعطای خودمختاری به کُردان و مهمتر ازهمه تلاش امرای کرد برای بازپس گیری قلمرو خود از قزلباشان باعث شد که برای همیشه ایالت دیاربکر و کل مناطق آناتولی شرقی از قلمرو ایران اسلامی منتزع شود.

چکیده شیخ عبیدالله، فرزند سید طه، از بزرگ ترین رهبران فرقه نقشبندی در کردستان عثمانی و ایران در نیمه دوم قرن نوزدهم بود. او با استفاده از تحولات ایجاد شده در ساختار سیاسی ـ اقتصادی دولت عثمانی، توانست توان سیاسی، اقتصادی و نیز نفوذ معنوی خود را افزایش دهد. او پس از جنگ روسیه و عثمانی در سال های 1295-1294ه.ق به بزرگ ترین رهبر قدرتمند در کردستان عثمانی تبدیل شد. وی در شعبان و رمضان 1297 سران اقشار مختلف کُرد ایران و عثمانی را به مرکز قدرت خود؛ یعنی روستای نهری دعوت کرد و نیات خویش را در ایجاد حکومتی مستقل اعلام کرد. شیخ سرانجام در ابتدای شوال 1297 در دو جبهه وارد مناطق کردنشین آذربایجان شد و شهرهای اشنویه، ساوجبلاغ (مهاباد کنونی)، میاندوآب را تصرف کرد و توانست شهرهای مراغه، بناب و ارومیه را برای مدتی محاصره نماید. در مقابل، دولت ایران با اعزام نیروی فراوان و صرف هزینه گزاف شورش او را سرکوب نمود. هدف این تحقیق تصحیح نسخه ای خطی تحت عنوان «گزارش وقایع فتنه شیخ عبیدالله و اکراد» که شامل مجموعه اسنادی ارزشمند در باب روند شورش در ایران از اواخر رمضان 1297 تا پایان صفر 1298 است. اهمیت این مجموعه آن است که حدود 800 سند از فرامین، دستورالعمل ها و گزارش های شاه، وزراء، ولیعهد و دیگر کارگزاران آذربایجان و فرماندهان ارشد نیروهای اعزامی به مناطق کردنشین آذربایجان را شامل می شود. این اسناد رسمی و دولتی، نگاه دولتمردان ایران را در باب شورش مذکور و نحوه برخورد با آن را مشخص می کنند و برای شناخت شورش بسیار حائز اهمیت اند. سوال اصلی این تحقیق این است که شورش شیخ عبیدالله در ایران چه روندی پیمود و واکنش شاه و دولتمردان ایران در قبال آن چه بود؟ اسناد موجود در این مجموعه خطی نشان می دهند که شیخ عبیدالله نقشبندی با استفاده از توان بالقوه و نفوذ فراوان خود در راستای بسیج توده ها و ایجاد شبکه های گسترده از مریدان و خلیفه ها در دو سوی مرز ایران و عثمانی، اتحادی شکننده از اقشار مختلف کُرد ایجاد نمود و از این طریق درصدد برآمد حکومتی مستقل تأسیس نماید. شیخ به دنبال پیگیری اهدافش، نارضایتی تعدادی از سران کُرد منطقه مکری از عملکرد حاکم ساوجبلاغ را بهانه قرار داد و سمت و سوی شورش را به این منطقه کشانید. حکام ایرانی نیز تا مدت ها پس از شورش از اهداف اصلی شیخ برداشت صحیحی نداشتند و اقدام او را نوعی تجاوز سرحدی تعبیر می کردند. بسیج تعداد زیادی از نیروهای نظامی ایران به فرمان شاه، ناهمگونی نیروهای شیخ و رایزنی پیوسته وزارت امور خارجه ایران با دولت های عثمانی، روسیه و بریتانیا اقدامات او را با شکست رو به رو کرد.

ایمونوگلوبولین دارای دو شاخه سبک و سنگین است که در سالهای اخیر ایمونوگلوبولین y به عنوان یک آنتی بادی پلی کلونال کاربرد زیادی در تحقیقات پزشکی داشته است. شاخه سبک و سنگین ایمونوگلوبولینy در پرندگان شامل یک ناحیه متغیر و یک ناحیه ثابت می باشد. هدف از پژوهش اخیر، تجزیه و تحلیل ژنتیکی و فیلوژنتیکی توالی ناحیه متغییر و ثابت یا vjc شاخه سبک و ناحیه ثابت یا c شاخه سنگین از ایمونوگلوبولینy مرغ بومی آذربایجان غربی است. بدین منظور 8 قطعه مرغ بومی آذربایجان غربی جمع آوری گردید. پس از استخراج rna از بافت طحال و سنترcdna، تکثیر قطعات 771 و 1201 جفت بازی نواحی شاخه سبک و سنگین ایمونوگلوبولینy توسط آغازگرهای اختصاصی انجام گرفت. قطعات تکثیر شده پس از خالص سازی به صورت رفت و برگشت توالی یابی شدند. تجزیه و تحلیل نتایج، تنوع هاپلوتایپی پایین و 11 جایگاه چند شکلی موجود در توالی ها را نشان داد که از 11 جایگاه 6 جایگاه باعث تغییر در توالی اسید آمینه شدند. توالی های نهایی بدست آمده از زنجیره سبک و سنگین به ترتیب شامل نسبت گوانین+سیتوزین 33/57، 33/66درصد و آدنین+تیمین 67/42،67/33 درصد بودند. نتایج فیلوژنتیکی با استفاده از روش neighber-joining نشان داد، که مرغ بومی آذربایجان در خوشهgallus gallus قرار می گیرد و کمترین فاصله ژنتیکی ازنظر توالی ایمنوگلوبین y نسبت به سایر موجودات دارای ایمونوگلوبولین y با مرغ دارد. کلید واژه: ایمونوگلوبولینy ، بررسی توالی و ساختار، مرغ بومی آذربایجان غربی

چکیده با پیشرفت توالی یابی ژنوم و رمز گشایی ژنوم گونه های اهلی، استفاده از تنوع های موجود در ژنوم در برنامه های اصلاح نژاد دام سرعت بیشتری گرفت. در آزمایش اول این پژوهش، از نژاد های هلشتاین (1073 نمونه)، براوون سوئیس (775 نمونه)، مارکیجانا (410 نمونه)، پایمونتزا (479 نمونه) و پزاتاروسا (364 نمونه) نمونه خون تهیه شد و سپس با چیپ 50 کی گاوی ایلومینا برای 54001 جهش تک نوکلئوتیدی در سراسر ژنوم بر اساس دستورالعمل تعیین ژنوتیپ شد. بدلیل اهمیت کروموزوم 14 در مطالعات نقشه یابی جایگاه صفات کمی، جهش های تک نوکلئوتیدی آن بر اساس اسمبلی umd3.1 ژنوم گاو تفکیک شد و دو پارامتر r2 و d? برای ارزیابی وسعت و بزرگی عدم تعادل لینکاژی در جمعیت های مختلف محاسبه شد. فاصله جفت مارکر ها بر اساس منابع مختلف به 15 گروه برای پوشش کل کروموزوم 14 تقسیم شد. روند میانگین و میانه r2 و d? با افزایش فاصله جفت مارکر ها کاهشی بود و شیب این روند کاهشی در نژاد های گوشتی تند تر از شیری بود. وسعت عدم تعادل لینکاژی در نژاد های شیری بیشتر از نژاد های گوشتی بود، بطوری که کاهش بزرگی متوسط r2 از 4/0 به 2/0 (سطح پایه عدم تعادل لینکاژی) در نژاد های شیری در فاصله 500-400 کیلو جفت باز حاصل شد اما در نژاد های گوشتی این مقدار در کمتر از 100 کیلو جفت باز مشاهده شد. ترسیم پلات نقطه ای میزان r2 بر اساس فاصله نشان داد در نژاد هلشتاین به دلیل فشار انتخاب بیشتر، جفت مارکر هایی وجود داشت که با فاصله بزرگتر از 10 مگا جفت باز 6/0 < r2 داشتند. اگر سطح مفید عدم تعادل لینکاژی را 2/0 = r2 در نظر بگیریم بطور تقریبی برای براوون سوئیس و هلشتاین به ازاء هر، به ترتیب 80 و 60 کیلو جفت باز یک مارکر برای مطالعات ارتباطی مورد نیاز است و در نژاد های گوشتی به ازاء حداقل هر 50 کیلو جفت باز یک مارکر مورد نیاز است. با این سطح r2 بطور تقریبی حداقل 37500 و حداکثر 64000 مارکر برای مطالعات ارتباطی در جمعیت های مورد مطالعه مورد نیاز است. پایداری فاز عدم تعادل لینکاژی در جمعیت ها و فواصل مختلف با محاسبه همبستگی r بررسی شد. در کلیه فواصل کمترین همبستگی بین هلشتاین فریزین و براوون سوئیس و بیشترین آن بین دو نژاد پایمونتزا و پزاتاروسا مشاهده شد. اندازه موثر جمعیت روند کاهشی داشت بطور که در 2500 نسل قبل برای هلشتاین، براوون سوئیس، مارکیجانا، پزاتاروسا و پایمونتزا به ترتیب 1590، 1409، 1467، 1726 و 1955 برآورد شد که در نهایت در حدود 10 نسل قبل به ترتیب به 120، 95، 245، 245 و 495 راس کاهش یافت. تعداد و میانگین طول بلوک های هاپلوتیپی در نژاد های شیری بیشتر از گوشتی بود. در هلشتاین از 84 مگا جفت باز طول کروموزوم 14 تقریبا 5/8 مگاجفت باز آن (بیش از 10%) ساختار بلوکی داشت. در نژاد های گوشتی مساحت کروموزومی پوشیده شده با بلوک ها کمتر از نژاد های شیری بود. بطوری که مساحت بلوک ها در سه نژاد گوشتی معادل با 60% مساحت بلوک در نژاد هلشتاین بود. تشابه در محل فیزیکی بلوک ها بین نژاد های شیری و گوشتی مشاهده شد. در آزمایش دوم 473 راس گاو نر نژاد هلشتاین نمونه گیری شد و با چیپ 50 کی نوع دو برای 54628 جهش تک نوکلئوتیدی بر اساس دستورالعمل تعیین ژنوتیپ شد و با استفاده از نرم افزار پنسی.ان.وی تنوع تعداد کپی نواحی ژنوم (سی.ان.وی) مورد بررسی قرار گرفت. در کل ژنوم گاو تعداد 1451 سی.ان.وی با میانگین و میانه به ترتیب 7/213 و 5/124 کیلو جفت باز بدست آمد. از کل این تعداد 707 سی.ان.وی فقط در یک حیوان مشاهده شد (49%). طول تنوع از 24 کیلو جفت باز تا 5/4 مگا جفت باز متفاوت بود که 6/94 مگا جفت باز از ژنوم گاو را پوشش می داد (8/3%). در این مطالعه 388 ناحیه سی.ان.وی با میانگین و میانه به ترتیب 9/243 و 9/133 کیلو جفت باز شناسایی شد. که 64% از این نواحی فراوانی کمتر از 5/%0 (یک تکرار) داشتند. بدون احتساب سی.ان.وی ها با یک تکرار فقط 14% نواحی سی.ان.وی ها فراوانی بالاتر از 2% داشته اند. تعداد 200 پپتید و ژن در نواحی سی.ان.وی ها با فراوانی بالاتر از 2% یافت شد که بیشترین تعداد ژن ها بر روی ناحیه سی.ان.وی 2491556-1616618 کروموزوم 14 شناسایی شد (56 ژن). بطور کلی بر اساس نتایج این پژوهش به نظر می رسد تنوع های موجود در ژنوم پتانسیل بالایی برای بکارگیری در برنامه های اصلاح نژادی دارند.

فیتازها گروه ویژه‏ای از فسفاتازها می‏باشند که هیدرولیز مرحله به مرحله فسفات را از مولکول فیتات انجام می‏دهند، فیتات منبع اصلی ذخیره فسفات در دانه گیاهان می‏باشد. این دسته از آنزیم‏ها در بین گیاهان، آغازیان و حیوانات پراکندگی و گستردگی دارند ولی از این میان فیتازهای میکروبی امیدبخش بوده و مورد توجه می‏باشند. فیتاز تولید شده توسط اشرشیاکلی برای استفاده در صنعت مناسب می باشد. در این مطالعه به منظور همسانه سازی و بررسی امکان تولید فیتاز نوترکیب، ژن فیتاز با استفاده از آغازگر های لینکر دار طراحی شده از باکتری اشرشیاکلی ptcc1330، جداسازی شد. پس از انجام واکنش pcr، پلاسمید و وکتور با آنزیم های برشی (1 ecorو bamhi) مورد هضم قرار گرفتند. ژن فیتاز بطور مستقیم در وکتور pet-21a(+)، کلون شد. در نهایت، پس از انجام واکنش اتصال، پلاسمید حاصل به باکتری اشرشیاکلی bl21(de3) .منتقل شد. و جهت تایید صحت، مورد توالی یابی قرار گرفت. نتایج توالی یابی صحت انجام همسانه سازی را نشان داد. سپس سویه بیانی حاوی ژن هدف با استفاده از iptg در غلظت نهایی 1 میلی مولار تحریک شد. نتایج استخراج پروتئین در sds-page الکترو فورز شده و اندازه پروتئین فیتاز تولید شده45 kd تخمین زده شد. کلید واژه ها: فیتاز، اشرشیاکلی، بیان ژن

استفاده از متون، منابع و نسخ خطی به دلایل مختلفی نظیر عدم دسترسی، خطی بودن و مشکل خواندن این متون از عمده مسائل و مشکلاتی است که بسیاری از محققین و پژوهشگران و بخصوص مورخین با آن مواجه می باشند، از این روی تصحیح و بازآفرینی این منابع یکی از مهمترین روشهای عرضه و ارائه آنها به منظور استفاده محققین و پژوهشگران می باشد. در ارتباط با تصحیح متون خطی عصر صفوی تلاشهای زیاد و ارزشمندی صورت گرفته و بسیاری از نسخ خطی باقی مانده از این دوره توسط محققین و متخصصین این دوره تصحیح و به علاقمندان ارائه گردیده است، از همین دست آثار، نسخه خطی تکمله الاخبار است که توسط دکتر عبدالحسین نوایی، تصحیح گردیده است، البته همانگونه که می دانیم، این اثر ارزشمند، فقط در بردارنده بخش مربوط به صفویان این نسخه بوده و سایر قسمتهای آن که از آفرینش آدم شروع و به سال 979 منتهی می گردد، همچنان به صورت نسخه خطی باقی مانده است، ما در این تحقیق و در قالب رساله دکتری، برآنیم که بخش مربوط به ملوک عجم تا ابتدای حکومت صفویان این کتاب را تصحیح نماییم.

بعد از وفات پیامبر و ماجرای ثقفیه بنی ساعده و انتخاب ابوبکر به عنوان جانشین آن حضرت , جامعه اسلامی دچار دوگانگی شد که در این میان عده ای بر جانشینی علی تاکید داشتند . وفات ابوبکر و انتخاب عمر از طرف خلیفه اول و نیز گسترش فتوحات اسلامی در این دوره جامعه اسلامی را وارد مرحله ای کرد که اعراب قبل از آن به این مساله برخورد نکرده بودند در دوران عثمان , نشانه های نارضایتی از وضع موجود که بنی امیه مصدر امور قرار داده شده بود باعث شورش علیه عثمان شد که به قتل خلیفه سوم انجامید انتخاب علی از سوی مردم که عدالت را را در همه امور در نظر داشت , موجب جنگ های داخلی در جامعه اسلامی شدکه علی بیشترین وقت خود را صرف مبارزه با سه گروه ناکثین , قاسطین, مارقین نمود. که در نهایت باعث شهادت علی به دست گروه خوارج شد . امام حسن به دلیل سستی اراده مردم مجبور به مصالحه با معاویه شد . از این زمان به بعدسادگی خلافت جای خود را به سلطنت معاویه داد با مرگ معاویه و به قدرت رسیدن یزید که در دوران کوتاه خلافت خود مرتکب جنایت هایی شد که در تاریخ اسلامی سابقه نداشته بود شهادت امام حسین (ع )یکی از این جنایت ها بود مردم کوفه به دلیل کوتاهی در یاری رساندن به امام حسین با سلیمان بن صرد همدانی در ماجرای قیام توابین شرکت کردند که این قیام در عین الورده به شکست انجامید . قیام مختار که در سال 66 ه . ق که در کوفه با هدف از بین بردن قاتلان امام حسین شروع شد و توانست تعدادی از کسانی را که در شهادت مام حسین نقش داشتند به قتل برساند از دیگر قیام های بود که به خون خواهی امام حسین شکل گرفت . موضوع : نسخه خطی کحال العیون که با روش (( کتابخانه )) تصحیح شده است عبارت است از : آغاز و انجام قیام مختار

منابع پروتئینی در تغذیه انسان نقش مهمی دارند. شیر شتر یکی از منابع پروتئینی غنی به شمار می آید. لاکتوفورین یکی از پروتئین های مهم آب پنیر شیر شتر می باشد . نواحی غیر کد کننده ، نواحی هستند که در بیان ژن اهمیت ویژه ای دارند . به این دلیل هدف از این تحقیق بررسی ساختار ناحیه تنظیمی ژن لاکتوفورین به طول حدود 790 نوکلئوتید می باشد که احتمالاً در 2 گونه شتر تک کوهانه و دو کوهانه ایران می باشد. 10 نمونه خون از شتر تک کوهانه و 5 نمونه خون از شتر دو کوهانه جمع آوری شد. ناحیه مورد نظر با استفاده از آغازگر های اختصاصی تکثیر و توالی یابی شد. پس از تجزیه و تحلیل به دست آمده ، 4 هاپلوتایپ در نژاد های تک کوهانه و3 هاپلوتایپ در نژاد های 2 کوهانه مشاهده گردید. همچنین 12و 10 موتیف به ترتیب در شتر های تک کوهانه و دو کوهانه مشاهده شد .

تکوین پیش از لانه گزینی در پستانداران با فیوژن هسته اسپرم و تخمک آغاز می گردد و در ادامه منجر به پدید آمدن ساختار پیچیده ای همچون بلاستوسیست می شود. در روند تکوین اولیه جنین دو رخداد تمایزی مهم حادث می شود که در اولین رخداد تمایزی جنین اولیه به تروفواکتودرم و توده سلولی داخلی تفکیک می شود. دومین مرحله تمایز که در حدود مرحله بلاستوسییستی رخ می دهد توده سلولی داخلی به اپی بلاست و اندودرم اولیه تمایز می یابد. دوفاز تمایزی از اینرو دارای اهمیت است که دو تیپ سلول های بنیادی پایدار و پرتوان بکر موشی و اولیه انسانی به ترتیب از توده سلولی داخلی و اپی بلاست بدست آمده. در تمایز یا تفکیک لایه های جنینی مسیر های تمایزی و نیز فاکتور های رونویسی مهمی نقش بازی می کنند که بیان یا عدم بیان هر یک در سرنوشت لایه ها دارای نقش تنظیمی کلیدی بازی می کند و در تعیین پرتوانی یا تمایز دخیل است. تاکنون به دلیل عدم شناخت دقیق از مارکر های پرتوانی قابل اعتماد و نیز الگو ی بیان آنها در مراحل مختلف تکوین، سلول های بنیادی قابل اعتمادی از گونه هایی همچون بز و گاو و گوسفند بدست نیامده است. بیان مارکر های پرتوانی و اختصاصی لایه ها و همچنین ژن های مسیر های پیام رسانی دخیل در مراحل تکوین نشان داد که، بیان ژنهای پرتوانی در مرحله 16-8 سلولی دارای بیشترین بیان بودند و این فرض را تقویت نمود که اولین مرحله اساسی تکوین در این مرحله رخ می دهد. با بررسی بیان ژن هایی oct4, cdx2 و gata4 این احتمال مطرح گردید که بر خلاف گونه موشی و انسانی دومین فاز تکوین در این گونه احتمالا در مرحله بلاستوسیست روز 14 رخ می دهد. در پی آیند برای برآورد تاثیر هر یک از مسیر های تکوینی بر پرتوانی سلول های جنینی هر یک از مسیر های پیام رسانی به واسطه ریزمولکول هایی مهار شدند که نتایج بدست آمده نشان داد که نتایج آزمایشات نشان داد که به کار بردن مهار کننده های pd0325901 برای مسیر mapk/erk و chir99021 برای مهار gsk3 از مسیر wnt سبب تغییر بیان مارکر-های پرتوانی و اختصاصی لایه ها می گردد. از منظر سلول های بنیادی و پرتوانی جنین های بزی بخواهیم بنگریم باید خاطر نشان کرد که مهار مسیر tgf-? هیچ کمکی به افزایش پرتوانی سلول یا تکثر سلول-های پرتوان نکرده و تا حدودی منجر به افزایش بیان مارکر های تمایزی چون cdx2 و gata4 نیز گردیده است. به دیگر سخن چنین می توان گفت که مهار مسیر وابسته به smad2,3 تا حدودی باعث ازدیاد میل به تمایز در سلول های جنینی گردیده است, و احتمالا در گونه بزی smad2,3 در سرکوب تمایز نقش دارند.

آلفا کازئین1s یکی از چهار پروتئین کازئین موجود در شیر شتر است. بخش عمده ای از پروتئین شیر شتر توسط کازئین های¬ sکه از ترکیب آلفا کازئین¬1s و آلفا کازئین¬2s می باشد تشکیل شده است. کازئین ها در رسوب و اسیدی شدن شیر نقش دارند، در نتیجه جزء پروتئین های نامحلول شیر به حساب می آیند. تحقیقات نشان می دهد که سطوح پایین آلفا کازئین¬1s در شیر، با کاهش حساسیت به شیر برای برخی افراد در ارتباط است. هدف از انجام این مطالعه تعیین توالی و آنالیزهای بیوانفورماتیکی بخشی از ناحیه کد کننده و غیر کد کننده ژن آلفا کازئین1¬s و همچنین بررسی تفاوت های تک نوکلئوتیدی (snps) ممکن این توالی ژن در دوگونه شتر تک کوهانه و دو کوهانه ایران بود. تعداد 10 عدد نمونه خون شتر نر و ماده تک کوهانه از کشتارگاهی در شهر مشهد واقع در جاده فریمان روستای تپه سلام مشهد و همچنین تعداد 5 عدد نمونه خون شتر های نر و ماده دو کوهانه از ایستگاه تحقیقات منابع طبیعی و امور دام استان اردبیل واقع در روستای جهاد آباد مشکین شهر تهیه گردید. پس از عمل استخراج dna واکنش¬ pcr برای هریک از نمونه ها توسط پرایمرهای اختصاصی انجام شد و عمل توالی یابی با استفاده از محصولات pcr انجام شد. توالی های مورد توافق با استفاده از نرم افزار clc main workbench 5برای هریک از شترهای تک کوهانه و دوکوهانه بدست آمد. با استفاده از همین توالی های مورد توافق، بررسی ترکیب نوکلئوتیدی، بررسی های فیلوژنتیکی و سایر آنالیز های بیو انفورماتیکی انجام شد. بر اساس مقایسه توالی های بدست آمده در این مطالعه با توالی ثبت شده در پایگاه اطلاعاتی ncbi که طول قطعه ی اولیه ی بررسی شده در این مطالعه شامل ناحیه ی ژنی ( اگزون3 - اگزون 7) ژن آلفا کازئین1 sمی باشد، مشخص شد که بیشترین شباهت، مربوط به شتر تک کوهانه بود. از توالی یابی نمونه های گرفته شده تعدادی تفاوت تک نوکلئوتیدی در این ژن شناسایی شد. بررسی ها در این مطالعه نشان داد که در مجموع 4 هاپلوتایپ حاصله از شتر های تک کوهان ناشی از وجود 4 جایگاه چند شکلی بوده است. و با بررسی توالی شترهای دوکوهانه یک چندشکلی را در این مطالعه نشان داد، که 2 هاپلوتیپ حاصله از شتر های دو کوهانه ناشی از جهش g / t در موقعیت 500 این قطعه می باشد. همچنین مقایسه توالی های مورد توافق شتر تک کوهانه و دو کوهانه 7 اختلاف تک نوکلئوتیدی را بین این دو گونه مشخص کرد.

با نگاهی به دوره های مختلف تاریخی در ایران می توان به اهمیت و نقش اساسی مالیات در حیات اقتصادی و اجتماعی جامعه ی ایران پی برد. با تشکیل سلسله ی قاجار و ورود ایران به دایره ی نظام بین الملل و تشکیل وزارتخانه های مختلف به پیروی از غرب، وزارت مالیه نقش مهمی یافت. با بروز تغییرات که در نتیجه ی فرایند اصلاحات در دوره ی قاجار به وجود آمد، باید انتظار داشت که آثار این تغییرات در کارکردهای اقتصادی و به ویژه مباحث مالیاتی که جایگاه مهمی در نظام اقتصادی جامعه ی ایران عصرِ قاجار داشت، بازتاب یابد. از جمله مناطقی که دولتهای قاجار و پهلوی حساب ویژه ای بر روی عایدات حاصل از آن باز نموده بودند، ایالت فارس بود. با توجه به گستردگی این ایالت مالیاتهایی که از آنجا دریافت می گردید، اهمیت زیادی در حیات اقتصادی این دو سلسله و حاکمان آنها داشت. در رساله ی حاضر، تحولات نظام مالیاتی ایالت فارس در عصر پهلوی اول با تأکید بر این مسأله مورد پژوهش قرار می گیرد که آیا: با تغییر رژیم سیاسی و متعاقب آن با تغییر شرایط سیاسی، اجتماعی، اقتصادی جامعه ی ایران در عصر پهلوی تغییری در کارکردهای اقتصادی و به ویژه مسائل مالیاتی ایجاد شد؟ هدف این پژوهش، تدارک زمینه های لازم برای مطالعات مربوط به نقش و جایگاه نظام مالیاتی در فارس عصر پهلوی اول، جمع آوری اطلاعات لازم برای تدوین تاریخ اقتصادی فارس، در عصر قاجار و پهلوی اول و نیز بازشناسی کارکردهای مالیات در ایالت فارس می باشد. روش تحقیق در این پژوهش توصیفی، تحلیلی و روش گردآوری داده ها کتابخانه ای و اسنادی است.

بررسی ژنتیکی فلور میکروبی خمیرترش سبب شناخت اکولوژیکی و خصوصیات کارکردی می گردد و رقابت، تطابق، متابولیسم و پاسخ تنشی میکروارگانیسم ها را تحت تاثیر قرار می دهد. یکی از روش های سنتی در شناسایی فلور میکروبی، آزمون های بیوشیمیایی وتست تخمیر قند می باشد. روش های مستقل از کشت، همچون واکنش زنجیره ای پلیمراز نیز به منظور تعیین تنوّع میکروارگانیسم ها در اکوسیستم های طبیعی و نمایه نمودن آنها جهت بررسی سیر تکامل جمعیت های میکروبی، توسعه یافته اند. با این هدف، شناسایی مولکولی لاکتوباسیل جدا شده از نمونه خمیر ترش محلی تربت جام، خواف، قوچان، مشهد و دو نمونه صنعتی آلمان و بنگلادش با استفاده از روش کشت و روش مولکولی انجام شد. بدین منظور خمیر ترش براساس خصوصیات ارگانولپتیکی (عطر و طعم) جمع آوری گردید و جدایه های میکروبی بر روی محیط کشت های mrs و m17 از آن تکثیر شد. آزمون تخمیر قندها برای شناسایی زیرگونه هر جدایه انجام شد. پس از استخراج dna از خمیر ترش، واکنش زنجیره ای پلی مراز به منظور شناسایی هر گونه و زیرگونه صورت گرفت. نتایج نشان داد که محیط کشت mrs محیط بسیار مناسب تری جهت رشد لاکتوباسیل ها می باشد. آنالیز نتایج آزمون قندها سه زیر گونه لاکتوباسیلوس فرمنتوم، لاکتوباسیلوس پلانتورم و لاکتوباسیلوس سانفرانسیس را مشخص کرد. همچنین نتایج واکنش زنجیره ای پلی مراز با تکثیر قطعه253، 333 و 156 جفت بازی از ژن 16s rna ریبوزومی توسط آغازگرهای اختصاصی آزمون بیوشیمیایی را تایید نمود. نتایج این تحقیق نشان که واکنش زنجیره ای پلیمراز می تواند به خوبی جایگزین آزمون های بیوشیمیایی در شناسایی زیر سویه های موجود در فلور میکروبی خمیر ترش شود.

تحولاتی که در زمینههای سیاسی،مذهبی،اجتماعی و دیوانی در دوران پادشاهی نسبتاً طولانی شاهعباس اول (996-1038 ه. ق) رخ داد،مسیر حرکت تاریخنویسی را به سوی نوعی تمرکز وتثبیت در سبک و روش فراهم آورد. در این برهه زمانی،تواریخ سلسله ای مانند خلاصهالتواریخ،نقاوهالآثار،روضه الصفویه،تاریخ عالم آرای عباسی،تاریخ عباسی،تاریخ قزلباشان،فتوحات همایون وتواریخ محلی همچونتاریخ گیلان،احیاءالملوکوشرفنامهدر تداوم سنت تاریخنویسی،نوشته شد. برخی از این تواریخ، با استناد به اسناد و نامه های دیوانی، توسط وقایع نگارانی از رده منشیان،دیوانسالاران ویا منجمان درباری که خود نزدیک به کانون قدرت سیاسی و شاهد عینی رویدادها و جریان های زمان خود بوده اند، به رشته تحریر درآمدند. پژوهش حاضر با هدف تعیین میزان تغییرات حاصله درسنت تاریخ نویسی دوره شاه عباس اول،متون مذکور را بااستفاده از برخی جنبه های نقدتاریخی، شامل زندگی نامه مولفان،شکل شناسی و تحلیل محتوایی،دیدگاه های هریک درباره مضامین مختلف،امتیازات هرکدام به لحاظ موضوعی وشیوه تاریخ نویسی و... مورد بررسی قرار داده است. از سوی دیگرسعی براین بوده که با مقایسه تطبیقی سبک وروش تاریخ نگاری این آثاروتوضیح شباهت هاوتفاوت ها،میزانتأثیر و تأثراتآن هابریکدیگرمشخص شود و نهایتاً به این پرسش پاسخ دهدکه تواریخ عصر صفوی در زمان شاه عباس تا چه حد توانست از پوسته ی گرته برداری وسبک سنتی خارج شده، به شیوه ای نوین دراین مقوله دست بیابد. این پژوهش با روش مقایسه تطبیقی منابع مورد نظر و تحلیل اطلاعات و گزارش ها، بر آن است که برخلاف دیدگاه محققان امروزی مبنی بر تداوم تاریخ نگاری عصر شاه عباس اول بر روال سنت پیش از خود که بدون هیچ توجهی به مناسبات علی ومعلولی رویدادها و محدود به شیوه ی روایی نگارش یافته اند،به این نتیجه دست یافته استکه تاریخ نگاری عصر شاه عباس اول، ضمن حفظ بخشی از میراث سنت تاریخ نویسی گذشته، در برخی از زمینه های تاریخ نگاری به طور نسبی گام هایی به سوی نوآوری داشته است.

کاپا کازئین یک پروتئین گلیکوزیله متعلق به خانواده فسفولیپیدها ) (αs1 ,αs2 ,β ,κ می باشد که نقش اصلی در ترکیب پروتئین های شیر را بازی می کند. کاپاکازئین همچنین در پایداری میسیلهای کازئین، اندازه و عملکرد اختصاصی آنها دارای اصلی ترین نقش در بین پروتئین های شیر می باشد. این تحقیق به منظور بررسی ژنتیکی و فیلوژنتیکی توالی نوکلئوتیدی ناحیه غیر کد کننده ژن کاپا کازئین به طول حدود 1200 نوکلئوتید قبل از شروع کدون آغاز در دو گونه شتر تک کوهانه و دو کوهانه ایران انجام گرفت. نمونه خون از 10 نفر شتر تک کوهانه از کشتارگاه مشهد و تعداد 5 نمونه خون شتر دو کوهانه از مرکز اصلاح نژاد شهر مشکین شهر استان اردبیل جمع آوری شد. ناحیه ی مورد نظر با استفاده از آغازگرهای اختصاصی تکثیر و توالی یابی شد. پس از تجزیه و تحلیل های بدست آمده، 3 هاپلوتایپ در نژادهای تک کوهانه و 4 هاپلوتایپ در نژادهای دو کوهانه مشاهده گردید. درخت فیلوژنتیکی با استفاده از روش neighbor-joining به روش هم ترازی توالی تعیین توالی شده با توالی های مشابه ثبت شده در بانک ژنی ترسیم شد. نتایج فیلوژنی مشخص کرد که گونه شتر در میانه گونه هایی که توالی آنها در بانک ژنی ثبت شده بودند بیشترین شباهت را با نژاد bos taurus از خانواده bovidae دارا می باشد.

سالمونلا یک باکتری گرم منفی، بی هوازی اختیاری و تاژکدار است که در جنس سالمونلا و در خانواده انتروباکتریاسه قرار دارد که یکی از بیماریهای مهم عفونی و به عنوان یک بیماری مشترک در انسان و حیوانات شناخته شده است. در سالهای اخیر، انواع مختلفی از آنتی بیوتیک ها برای مقابله با سالمونلا استفاده شده است که با افزایش تعداد باکترهای مقاوم به آنتی بیوتیک، استفاده از روش های جایگزین ضروری به نظر می رسد. هدف از انجام این مطالعه تولید پروتئین نوترکیب invg به منظور استفاده از آن در ایجاد ایمنی بر علیه باکتری سالمونلا بود، این پروتئین یکی از عوامل آنتی ژنیک اصلی برای ایجاد بیماری سالمونلازیس است. این ویژگی invg ثابت می کند که استفاده از این ژن به عنوان یک زیر واحد برای تولید پروتئین نوترکیب جهت تحریک سیستم ایمنی مناسب می باشد. ژن invg از سالمونلا انتریکا با استفاده از واکنش زنجیره پلیمراز و آغازگرهای اختصاصی حاوی مکان های برشی bamhi و xhoi تکثیر و جداسازی شد. به منظور بررسی خصوصیات نوکلئوتیدی، ژن تکثیر شده به ناقل کلونینگ ptz57r/t انتقال و حضور ژن هدف در این ناقل با استفاده از روش های کلونی pcr، هضم آنزیمی و توالی یابی تایید شد. به منظور تولید آنتی ژن نوترکیب، ژن هدف به ناقل بیانی (+)pet32a وارد و سپس به باکتری اشریشیاکلی سویه (bl21(de3 به عنوان میزبان بیان منتقل شد. باکتری حاوی ناقل نوترکیب با استفاده از iptg در غلظت نهایی5/1 میلی مولار القاء شد. تولید پروتئین نوترکیب با وزن تقریبی 81 کیلو دالتون به روش آنالیز sds-page و وسترن بلاتینگ تایید شد. نتایج الایزا نشان داد که مرغ های ایمن شده با آنتی ژن invg واکنش ایمنی قابل توجهی به آن نشان دادن و سطح بالایی از igy اختصاصی علیه آن تولید کردند. در نهایت، نتایج نشان دهنده موفقیت تولید آنتی ژن نوترکیب و ایجاد مقدار مناسب آنتی بادی اختصاصی علیه این آنتی ژن در تخم مرغ مرغ های تخمگذار بود. کلید واژه ها: ایمونوگلوبینy، ایمنی زایی، پروتئین نوترکیب، ژن invg ، سالمونلا

مدل سازی متابولیسم تولید شیر مبتنی بر بازسازی شبکه متابولیکی بافت غده پستانی گاو، می تواند منجر به دیدگاه سیستمی به این فرآیند پیچیده و درک بهتر آن گردد. این بازسازی با استفاده از اطلاعات ژنومی قابل دسترس گاو امکان پذیر است. در این پژوهش، اطلاعات مورد نیاز، از پایگاه های داده ncbi ، uniprot، kegg و brenda جمع آوری و مورد استفاده قرار گرفتند. . نتایج آنالیزهای انجام شده در این تحقیق می تواند برای مدلینگ و شبیه سازی سیستم بیولوژیکی بافت غده پستانی گاو برای طراحی فنوتیپ مطلوب برای افزایش کمیت و کیفیت شیر در گاو بکار رود. در نهایت، این پژوهش به بهبود درک تولید شیر با نگاه شبکه ای کمک کرده و تلفیق آن با نتایج آنالیز داده های اومیکس در سایر سطوح برای این بافت، یک دیدگاه جامع و سیستمیک از عمکرد این بافت برای تولید شیر ارائه می دهد که می تواند قدم مفیدی در ارائه استراتژی پرورش واصلاح نژاد گاو داشته باشد.

در آزمایش اول خصوصیات فیزیکی و شیمیایی 8 منبع فیبری غیر علوفه ای (nffs) شامل: پوسته سویا (بدون دانه و حاوی دانه)، پوسته آفتابگردان، پوسته پسته، پوسته بادام زمینی، پوسته تخم پنبه، سبوس گندم و تفاله چغندر قند؛ 3 ماده خوراکی علوفه ای شامل: علف یونجه، سیلاژ جو و سیلاژ ذرت بررسی شدند. nffs دارای جرم حجمی توده ای (bd) بالا (0/578-0/243 گرم در میلی لیتر)، لیگنین بالا و ظرفیت نگهداری آب (whc) اندک بودند. ماده خشک و ماده آلی محلول (som، گرم در لیتر) در پوسته آفتابگردان اندک (0/7 و 0/62) و در پوسته پسته زیاد بود (به ترتیب 6/25 و 4/16). در میان تمام مواد خوراکی whc بیشترین همبستگی را با adf و خاکستر داشت، اما بیشترین همبستگی بین whc با bd و ظرفیت بافری (bc) در nffs مشاهده شد. در میان تمام مواد خوراکی bd دارای بیشترین همبستگی با ndf و nfc بود. در nffs، bd دارای بیشترین همبستگی با adf و som بود. در تمام مواد خوراکی bc دارای بیشترین همبستگی با خاکستر و خاکستر محلول، و ph دارای همبستگی زیادی با بخش های محلول بود. در nffs همبستگی بین bc با خاکستر، ترکیبات دیواره سلولی، بخش های محلول و ph زیاد بود. هنگامی که تنها از nffs برای تهیه بهترین مدل پیش بینی کننده استفاده شد، ضریب تبین برای اکثر مدل های پیشنهادی در مقایسه با زمانی که از تمام مواد خوراکی استفاده شد، افزایش یافت. بهترین مدل مربوط به تخمین som و bc در nffs مشاهده شد (0/995=r2). در آزمایش دوم از 8 گاو شیرده هلشتاین در یک طرح مربع لاتین در 4 دوره 19 روزه و به صورت آزمایش فاکتوریل استفاده شد. تیمارهای آزمایشی از دو اندازه قطعات علف یونجه (5 و 20 میلی متر) همراه با دو سطح پوسته سویا (صفر و یا 50 درصد جایگزین علف یونجه) بود. جیره های آزمایشی از 60 درصد کنسانتره و 40 درصد علوفه تشکیل شده بود و دارای 57/1 انرژی خالص شیرواری، 1/17 درصد پروتئین خام، 5/31 درصد ndf تشکیل شده بود. گاوهایی که از جیره حاوی پوسته مصرف کردند شیر بیشتری تولید کردند ( p<0/05) اما چربی ( p<0/01) و ph مدفوع کمتری ( p<0/01) داشتند. اندازه قطعات و پوسته سویا منجر به افزایش pef و pendf جیره شدند ( p<0/01). اندازه قطعات بلند یونجه منجر به افزایش تولید چربی شیر ( p=0/09)، افزایش زمان نشخوار به ازای ndf مصرفی ( p=00/07) و قابلیت هضم ظاهری ndf (05/0p=) شد. در حالی که پوسته سویا باعث کاهش زمان نشخوار به ازای مصرف pendf (08/0p=) و کاهش قابلیت هضم ظاهری ndf (06/0p=) شد. اندازه قطعات بلند یونجه منجر به افزایش ماده خشک مدفوع بر روی الک های 4≥، 0/425≥و 0/3≥ میلی متری گردید. در آزمایش سوم تأثیر اندازه قطعات علف یونجه و پوسته سویا بر جمعیت باکتری های سلولیتیک در شکمبه گاوهای شیری در آزمایش قبل و همچنین سنتز پروتئین میکروبی در جیره های حاوی پوسته سویا در آزمایش تولید گاز بررسی شد. استفاده از اوره دو با نشاندار با نیتروژن-15 نشان داد که سنتز پروتئین میکروبی در جیره های حاوی پوسته سویا بطور معنی داری کاهش یافت ( p<0/01). تولید گاز، ماده خشک ناپدید شده و راندمان سنتز پروتئین میکروبی در انکوباسیون به مدت 17 ساعت در جیره های آزمایشی تفاوتی نداشت. در آزمایش چهارم اثر اندازه قطعات علف یونجه و پوسته سویا بر تخمیر شکمبه، تجزیه پذیری ماده خشک و قابلیت هضم ظاهری در 4 گوساله که در سطح نگهداری تغذیه می شدند در قالب طرح مربع لاتین بررسی شد. پوسته سویا ph شکمبه را در زمان های 2، 3 ، 5 و 6 ساعت پس از تغذیه و مدفوع را کاهش داد ( p<0/01). پوسته سویا تجزیه پذیری شکمبه ای ماده خشک را در زمان های ابتدایی افزایش و با افزایش زمان انکوباسیون کاهش داد. پوسته سویا قابلیت هضم ظاهری چربی خام و ndf را به ترتیب افزایش ( p<0/01) و کاهش ( p<0/11) داد.