نام پژوهشگر: المیرا نظرشده

پیش بینی فعالیت برخی از بازدارنده های کیناز با استفاده از روش های مدل سازی مولکولی: روش های فارماکوفوری و کیوسار سه بعدی
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه صنعتی خواجه نصیرالدین طوسی - دانشکده شیمی 1393
  المیرا نظرشده   جهانبخش قاسمی

در این پایان نامه، مطالعات ارتباط کمی ساختار و فعالیت سه بعدی، الحاق مولکولی و غربالگری مجازی دو سری از بازدارنده های کیناز در راستای یافتن رابطه ای میان خواص مولکولی و فعالیت های زیستی و همچنین پیشنهاد ترکیبات جدید با خاصیت بازدارندگی بیشتر انجام شد. در مطالعه اول، مدل کیوسار سه بعدی جدید autogpa براساس انطباق فارماکوفوری برای مقایسه با دو مدل کومفا و کومسیا بر مبنای برخط کردن بر روی بیشترین زیر مجموعه ساختاری مشترک، تولید شد. غربالگری مجازی براساس مدل فارماکوفوری autogpa و الحاق مولکولی انجام گرفت و همچنین مطالعات admet روی ترکیبات پیشنهاد شده جدید انجام و با محدوده ها ی استاندارد مقایسه شدند. در مطالعه دوم، روش های انتخاب متغیر (روش جایگزینی پیشرفته و الگوریتم ژنتیک) به منظور مقایسه مدل کومفا با مدل های erm-pls و ga-plsبه کار گرفته شدند. اعتبارسنجی داخلی و خارجی برای ارزیابی پایداری و قدرت پیشگویی مدل ها نیز انجام گرفت. پارامترهای آماری برتری قدرت پیشگویی مدل autogpa و نیز برتری قابل توجه مدل ga-pls را به ترتیب در مطالعه اول و دوم نشان دادند. مطالعات الحاق مولکولی برای بررسی مکانیسم بازدارندگی ترکیبات نیز به کار گرفته شد.