ارزیابی بیوانفورماتیکی پلی مورفیسم های تک نوکلئوتیدی غیر مترادف (nssnps) بیماری زا در ناحیه کد کننده ژن پروتئین پریون انسانی (prnp)

کورش بامداد; kourosh bamdad department of biology, faculty of science, payame noor university (pnu), iranگروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه پیام نور، ایران فاطمه رحیمی قره میرشاملو; fatemeh rahimi gharemirshamlu department of genetic, colleague of science, kazerun branch, islamic azad university, kazerun, iranگروه ژنتیک دانشکده علوم پایه، واحد کازرون، دانشگاه آزاد اسلامی، کازرون، ایران سیروس نعیمی; sirous naeimi department of genetic, colleague of science, kazerun branch, islamic azad university, kazerun, iranگروه ژنتیک دانشکده علوم پایه، واحد کازرون، دانشگاه آزاد اسلامی، کازرون، ایران

مقاله

ارزیابی بیوانفورماتیکی پلی مورفیسم های تک نوکلئوتیدی غیر مترادف (nssnps) بیماری زا در ناحیه کد کننده ژن پروتئین پریون انسانی (prnp)

کورش بامداد، kourosh bamdad department of biology, faculty of science, payame noor university (pnu), iranگروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه پیام نور، ایران فاطمه رحیمی قره میرشاملو، fatemeh rahimi gharemirshamlu department of genetic, colleague of science, kazerun branch, islamic azad university, kazerun, iranگروه ژنتیک دانشکده علوم پایه، واحد کازرون، دانشگاه آزاد اسلامی، کازرون، ایران سیروس نعیمی، sirous naeimi department of genetic, colleague of science, kazerun branch, islamic azad university, kazerun, iranگروه ژنتیک دانشکده علوم پایه، واحد کازرون، دانشگاه آزاد اسلامی، کازرون، ایران

چکیده

زمینه و هدف: پلیمورفیسم های تک نوکلئوتیدی عامل ایجاد تنوع ژنتیکی در جانداران میباشند و در این میان، پلیمورفیسم های تک نوکلئوتیدی غیر مترادف (nssnps) باعث تغییر در باقیمانده های اسیدآمینه میشوند. تحقیق اخیر با هدف بررسی احتمال ارتباط بین تمامی چندشکلی های گزارش شده از ژن پریون انسانی و بروز بیماری انجام شده است. مواد و روش ها: در این مطالعه توالی اسیدآمینه ایزوفرم اصلی ژن پروتئین پریون انسانی از پایگاه داده uniprot استخراج و توسط سرورهای foldamyloid و amylpred موردبررسی قرار گرفت. همچنین تمامی پلیمورفیسم های تک نوکلئوتیدی غیر مترادف این پروتئین از پایگاه داده dbsnp استخراج و توسط سرورهای بیوانفورماتیکی sift،polyphen-2، i-mutant-3.0،panther،snps&go; ،phd-snp،meta-snp و mutpred برای تعیین زیان بارترین snp مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج: بررسی توالی پروتئین توسط سرورهای foldamyloid و amylperd، نواحی 15-5، 178-174، 184-180، 217-211 و 252-240 را به عنوان حساس ترین بخش های پروتئین در روند آمیلوئیدی شدن معرفی کردند. همچنین از غربالگری تمام nssnpهای ایزوفرم اصلی پروتئین توسط سرورهای استفاده شده، 105 مورد جایگزینی والین به جای آسپارتیک اسید در جایگاه 178 با شناسه ی rs11538766 را به عنوان زیان بارترین nssnp در ساختار پروتئین پیشبینی کردند. نتیجه گیری: بر اساس نتایج، جایگزینی والین به جای آسپارتیکاسید در موقعیت 178 (d178v) به عنوان زیان بارترین جهش در ساختمان پروتئین پریون انسانی پیش بینی شد. همچنین مکانیسم مولکولی ارائه شده توسط سرور mutpred نیز دلالت بر افزایش ساختار بتا (gain of sheet) در فرم فضایی پروتئین دارد که مسبب افزایش احتمال تولید و تجمع تشکیلات فیبریلی خواهد بود.

دانلود متن کامل

از سایت نشریه

برای دانلود رایگان وارد شوید یا ثبت نام کنید

نشریه: مجله دانشگاه علوم پزشکی فسا

ذخیره در کتابخانه

استناد

کورش بامداد, kourosh bamdad department of biology, faculty of science, payame noor university (pnu), iranگروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه پیام نور، ایران فاطمه رحیمی قره میرشاملو, fatemeh rahimi gharemirshamlu department of genetic, colleague of science, kazerun branch, islamic azad university, kazerun, iranگروه ژنتیک دانشکده علوم پایه، واحد کازرون، دانشگاه آزاد اسلامی، کازرون، ایران سیروس نعیمی, sirous naeimi department of genetic, colleague of science, kazerun branch, islamic azad university, kazerun, iranگروه ژنتیک دانشکده علوم پایه، واحد کازرون، دانشگاه آزاد اسلامی، کازرون، ایران (n.d.). ارزیابی بیوانفورماتیکی پلی مورفیسم های تک نوکلئوتیدی غیر مترادف (nssnps) بیماری زا در ناحیه کد کننده ژن پروتئین پریون انسانی (prnp). مجله دانشگاه علوم پزشکی فسا. https://www.virascience.com/article/264704/

@article{بامدادnd,
  title = {ارزیابی بیوانفورماتیکی پلی مورفیسم های تک نوکلئوتیدی غیر مترادف (nssnps) بیماری زا در ناحیه کد کننده ژن پروتئین پریون انسانی (prnp)},
  author = {کورش بامداد and kourosh bamdad department of biology, faculty of science, payame noor university (pnu), iranگروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه پیام نور، ایران فاطمه رحیمی قره میرشاملو and fatemeh rahimi gharemirshamlu department of genetic, colleague of science, kazerun branch, islamic azad university, kazerun, iranگروه ژنتیک دانشکده علوم پایه، واحد کازرون، دانشگاه آزاد اسلامی، کازرون، ایران سیروس نعیمی and sirous naeimi department of genetic, colleague of science, kazerun branch, islamic azad university, kazerun, iranگروه ژنتیک دانشکده علوم پایه، واحد کازرون، دانشگاه آزاد اسلامی، کازرون، ایران},
  journal = {مجله دانشگاه علوم پزشکی فسا},
  url = {https://www.virascience.com/article/264704/}
}

TY  - JOUR
TI  - ارزیابی بیوانفورماتیکی پلی مورفیسم های تک نوکلئوتیدی غیر مترادف (nssnps) بیماری زا در ناحیه کد کننده ژن پروتئین پریون انسانی (prnp)
AU  - کورش بامداد
AU  - kourosh bamdad department of biology, faculty of science, payame noor university (pnu), iranگروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه پیام نور، ایران فاطمه رحیمی قره میرشاملو
AU  - fatemeh rahimi gharemirshamlu department of genetic, colleague of science, kazerun branch, islamic azad university, kazerun, iranگروه ژنتیک دانشکده علوم پایه، واحد کازرون، دانشگاه آزاد اسلامی، کازرون، ایران سیروس نعیمی
AU  - sirous naeimi department of genetic, colleague of science, kazerun branch, islamic azad university, kazerun, iranگروه ژنتیک دانشکده علوم پایه، واحد کازرون، دانشگاه آزاد اسلامی، کازرون، ایران
JO  - مجله دانشگاه علوم پزشکی فسا
UR  - https://www.virascience.com/article/264704/
ER  -

[
  {
    "id": "article:264704",
    "type": "article-journal",
    "title": "ارزیابی بیوانفورماتیکی پلی مورفیسم های تک نوکلئوتیدی غیر مترادف (nssnps) بیماری زا در ناحیه کد کننده ژن پروتئین پریون انسانی (prnp)",
    "author": [
      {
        "literal": "کورش بامداد"
      },
      {
        "literal": "kourosh bamdad department of biology, faculty of science, payame noor university (pnu), iranگروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه پیام نور، ایران فاطمه رحیمی قره میرشاملو"
      },
      {
        "literal": "fatemeh rahimi gharemirshamlu department of genetic, colleague of science, kazerun branch, islamic azad university, kazerun, iranگروه ژنتیک دانشکده علوم پایه، واحد کازرون، دانشگاه آزاد اسلامی، کازرون، ایران سیروس نعیمی"
      },
      {
        "literal": "sirous naeimi department of genetic, colleague of science, kazerun branch, islamic azad university, kazerun, iranگروه ژنتیک دانشکده علوم پایه، واحد کازرون، دانشگاه آزاد اسلامی، کازرون، ایران"
      }
    ],
    "URL": "https://www.virascience.com/article/264704/",
    "language": "fa",
    "container-title": "مجله دانشگاه علوم پزشکی فسا"
  }
]

BibTeX · RIS · CSL-JSON

کلیدواژه‌ها

اسناد مشابه

ارزیابی بیوانفورماتیکی پلی‌مورفیسم‌های تک نوکلئوتیدی غیر مترادف (nsSNPs) بیماری‌زا در ناحیه کد‌کننده ژن پروتئین پریون انسانی (PRNP)
مقاله۲۰۱۶مجله دانشگاه علوم پزشکی فسابامداد, کورش، رحیمی قره میرشاملو, فاطمه، نعیمی, سیروس
زمینه و هدف: پلیمورفیسم‌های تک نوکلئوتیدی عامل ایجاد تنوع ژنتیکی در جانداران میباشند و در این میان، پلیمورفیسم‌های تک نوکلئوتیدی غیر مترادف (nsSNPs) باعث تغییر در باقیمانده‌های اسیدآمینه میشوند. تحقیق اخیر با هدف بررسی احتمال ارتباط بین تمامی چندشکلی‌های گزارش‌شده از ژن پریون
ارزیابی پلی مورفیسم نوکلئوتیدی ژن آپولیپوپروتئین a۵ در مبتلایان به بیماری قلبی- عروقی
مقالهمجله دانشگاه علوم پزشکی فساسمیه حق پرست، somayeh haqparast پیمان ایزدپناه، peyman izadpanah عباس عبداللهی، abbas abdollahi سهراب نجفی پور
زمینه و هدف: ژن آپولیپوپروتئین (a5 (apoa5 نقش مهمی در تنظیم و کنترل میزان تری گلیسرید پلاسما به عنوان یک عامل خطر مهم در ابتلا به بیماری قلبی عروقی دارد. جهش در این ژن می تواند بر روی سطح تری گلیسرید پلاسما اثر بگذارد. ما در این مطالعه به بررسی نقش پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی s19w
تأثیر پلی مورفیسم ناحیه غیر کد کننده ژن زیر واحد p۴۰ پروتئین اینترلوکین ۱۲ در عفونت مزمن هپاتیت c
مقالهمجله دانشگاه علوم پزشکی کردستانپدرام عظیم زاده، pedram azimzadeh master of cell and molecular biology, research center for gastroenterology and liver diseases, shahid beheshti university of medical sciences, tehran,iran.کارشناس ارشد علوم سلولی و مولکولی، مرکز تحقیقات بیماریهای گوارش و کبد، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، تهران، ایران سید رضا محبی، seyed reza mohebbi phd of medical virology, research center for gastroenterology and liver diseases, shahid beheshti university of medical sciences, tehran, iran.دکتری تخصصی ویروس شناسی پزشکی، مرکزتحقیقات بیماریهای گوارش و کبد، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، تهران، ایران سارا رومانی، sara romani master of microbiology, research center for gastroenterology and liver diseases, shahid beheshti university of medical sciences, tehran, iran.کارشناس ارشد میکروبیولوژی، مرکز تحقیقات بیماریهای گوارش و کبد، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی ، تهران، ایران حامد ناقوسی
چکیده زمینه و هدف: اینگونه به نظر می رسد که تولید مقادیر غیر معمول انواع سایتوکاین طی عفونت هپاتیت c با پیشرفت بیماری، حضور ویروس در بدن میزبان و ایجاد بیماری مزمن همبستگی دارد. اینترلوکین 12 بعنوان یک هترودایمر که نقش تنظیم پاسخ سیستم ایمنی را دارد، در پیشرفت پاسخ ایمنی به سوی t
تأثیر پلی مورفیسم ناحیه غیر کد کننده ژن زیر واحد P40 پروتئین اینترلوکین 12 در عفونت مزمن هپاتیت C
مقاله۲۰۱۱مجله دانشگاه علوم پزشکی کردستانپدرام عظیم زاده، سید رضا محبی، سارا رومانی، حامد ناقوسی
ABSTRACT Background and Aim: Production of unusual cytokine levels in hepatitis C infection appears to be associated with progression of the disease, persistence of the virus in host, and establishment of chronic disease. Interleukin-12 as a heterodimeric immunoregulating cytokin

ارزیابی بیوانفورماتیکی پلی مورفیسم های تک نوکلئوتیدی غیر مترادف (nssnps) بیماری زا در ناحیه کد کننده ژن پروتئین پریون انسانی (prnp)

چکیده

اسناد مشابه

ارزیابی بیوانفورماتیکی پلی‌مورفیسم‌های تک نوکلئوتیدی غیر مترادف (nsSNPs) بیماری‌زا در ناحیه کد‌کننده ژن پروتئین پریون انسانی (PRNP)

ارزیابی پلی مورفیسم نوکلئوتیدی ژن آپولیپوپروتئین a۵ در مبتلایان به بیماری قلبی- عروقی

تأثیر پلی مورفیسم ناحیه غیر کد کننده ژن زیر واحد p۴۰ پروتئین اینترلوکین ۱۲ در عفونت مزمن هپاتیت c

تأثیر پلی مورفیسم ناحیه غیر کد کننده ژن زیر واحد P40 پروتئین اینترلوکین 12 در عفونت مزمن هپاتیت C