شناسایی miRNAها و ژنهای هدف مرتبط با آنها در گیاه شبدر قرمز (Trifolium pratense)
نویسندگان
چکیده مقاله:
میکروآرناها (miRNA) یک رده از RNAهای تنظیمکننده کوچک درونی و غیرکدکننده پروتئینی که متشکل از حدود 18-22 نوکلئوتید بوده و تنظیم بیان ژن را در سطح رونویسی و پس از رونویسی ژن بر عهده دارند و طبق تحقیقات انجام شده نقشهای اساسی در فرایندهای نموی، زمان گلدهی و پاسخ به تنشهای زیستی و غیرزیستی ایفا میکنند. تاکنون روشهای متفاوتی برای شناسایی miRNAها، معرفی شده است که عبارتند از: روش نورترن بلات، ریزآرایه، qRT-PCR و روشهای بیوانفورماتیکی. در این میان ساده‌ترین و کمهزینهترین روش شناسایی miRNAها، روش بیوانفورماتیکی میباشد. در این مطالعه با یک رویکرد بیوانفورماتیکی با هدف شناسایی miRNA متمایز در گیاه شبدر قرمز مبتنی بر جستجوی همولوژی بین ESTهای گیاه شبدر قرمز و miRNAها انجام شد. بهطوریکه ابتدا در آن همه توالیهای ESTهای گیاه شبدر قرمز از بانک اطلاعاتی NCBI در برابر miRNAهای شناخته شده BLASTn شدند که در نهایت یک miRNA کاندید متمایز در گیاه شبدر قرمزشناسایی شد. در مجموع شش ژن هدف پیشبینی شده برای این miRNA نیز شناسایی شد و این ژنهای هدف عمدتا کدکننده مونود هیدرو اسکوربات ردوکتاز1 ) برقراری تعادل گونههای فعال اکسیژن در چرخه اسکوربات-گلوتاتیون(، پروتئین FES1 )یک پروتئین حاوی دومین انگشت روی چسبنده به DNA)، پروتئین RHF2A )یوبی کوئیتین لیگاز E3 دخیل در پیشبرد گامتوژنز(، RNA هلیکاز وابسته به ATP )تعمیر و متابولیسم RNA)، پروتئینهای انتقالی MFS )تسهیلکننده حرکت املاح کوچک از عرض غشای سلولی در پاسخ به گرادیانت شیمواسمزی( و در نهایت پروتئین AT-hook )یک موتیف متصل شونده به (DNA نیز بودند.
منابع مشابه
بررسی اثرات ضدافسردگی عصاره شبدر قرمز (Trifolium pratense L) در موش سوری
مقدمه: افسردگی یک بیماری رایج و ناتوان‌کننده است که عواقب فردی، اجتماعی و اقتصادی متعددی برای جامعه به همراه دارد. هدف از مطالعه حاضر بررسی اثر عصاره هیدروالکلی شبدر قرمز بر علایم افسردگی القا شده توسط رزرپین در موش‌های سوری بود. روشها: 60 موش سوری به صورت تصادفی به 6 گروه 10 تایی تقسیم شدند. موش‌های گروه شاهد نرمال‌سالین (1 میلی‌گرم بر کیلوگرم)، موش‌های گروه شاهد منفی رزرپین (5 میلی‌گرم بر کی...
متن کاملفصل و روش مناسب استقرار گونه شبدر قرمز ( Trifolium pratense L.) در مراتع استپی مازندران
در برنامه افزایش تولید علوفه در مراتع کشور، گردآوری و ژرفنگری دانش استقرار گیاهان علوفهای، ضروری است. بدین منظور، بذر گونهTrifoliumpratense، از بازار شهر ساری تهیه و کشت شد. هدف از این بررسی تعیین فصل بهینه و روش کارآمد استقرار این گونه برای اصلاح مراتع در عرصه مراتع استپی بود. محل کشت این گونه در ایستگاه آبخوانداری پشتکوه ساری با متوسط بارندگی سالانه 350 میلیمتر و اقلیم نی...
متن کاملارزیابی کیفیت علوفه تولیدی ارقام شبدر قرمز Trifolium pratense L.)) کشت شده در مراتع البرز شمالی
با هدف بررسی کیفیت علوفه 7 رقم شبدر قرمز، طرحی در قالب بلوک‌های کامل تصادفی با 3 تکرار در مراتع ییلاقی استان مازندران به مدت سه سال (4-1382) اجرا شد. صفات دیرزیستی، تیپ رشد و عملکرد خشک علوفه ارقام به انضمام هفت صفت کیفی علوفه تولیدی آنها شامل درصدهای: ماده خشک قابل هضم، کربوهیدرات‌های محلول در آب، پروتئین خام، دیواره سلولی (NDF)، دیواره سلولی بدون همی‌سلولز (ADF)، فیبر خام و خاکستر با استفا...
متن کاملRed Clover (Trifolium pratense)
Brief Background: Red clover is a legume, which like soy contains "phytoestrogens" (plant-based compounds structurally similar to estradiol, capable of binding to estrogen receptors as an agonist or antagonist). Red clover was traditionally used to treat asthma, pertussis, cancer, and gout. In modern times, isoflavone extracts of red clover are most often used to treat menopausal symptoms, as a...
متن کاملRed clover (Trifolium pratense).
Genetic modification of plants by the insertion of transgenes can be a powerful experimental approach to answer basic questions about gene product function. This technology can also be used to make improved crop varieties for use in the field. To apply this powerful tool to red clover, an important forage legume, a population of red clover with a high potential for regeneration in tissue cultur...
متن کاملبررسی اثرات ضدافسردگی عصاره شبدر قرمز (trifolium pratense l) در موش سوری
مقدمه: افسردگی یک بیماری رایج و ناتوان کننده است که عواقب فردی، اجتماعی و اقتصادی متعددی برای جامعه به همراه دارد. هدف از مطالعه حاضر بررسی اثر عصاره هیدروالکلی شبدر قرمز بر علایم افسردگی القا شده توسط رزرپین در موش های سوری بود. روشها: 60 موش سوری به صورت تصادفی به 6 گروه 10 تایی تقسیم شدند. موش های گروه شاهد نرمال سالین (1 میلی گرم بر کیلوگرم)، موش های گروه شاهد منفی رزرپین (5 میلی گرم بر کی...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
عنوان ژورنال
دوره 26 شماره 2
صفحات 156- 164
تاریخ انتشار 2018-12-22
با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023