سابقه و هدف: در این مطالعه به اثر اتصال یون فلزی روی بر تغییرات ساختاری و پایداری پروتئین آمیلوئید بتا، موثر در بروز بیماری آلزایمر در سطوح مولکولی پرداختیم. روش بررسی: این بررسی با کمک محاسبات شبیه سازی دینامیکی مولکولی و با استفاده از نرم افزار گرومکس نسخه 4.6.5 و میدان نیروی 03 amber و مدل حلال آب spc216 انجام گرفت. یافته ها: به کمک انحراف جذر مربع میانگین، صحت انجام شبیه سازی بررسی و با کمک...

چکیده در این پایان نامه، خواص پیوندهای هیدروژنی در جفت بازهای dna (گوانین- سیتوزین و آدنین- تیمین) در حلال های آب، متانول و کلروفرم، با استفاده از شبیه سازی دینامیک مولکولی مطالعه شدند و نتایج به دست آمده مقایسه شده و مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند. شبیه سازی های دینامیک مولکولی انجام شده نشان دادند که حلال های آب و متانول بر پیوندهای هیدروژنی جفت باز گوانین- سیتوزین، نسبت به جفت باز آدنین- تی...

اخیراً توجه زیادی به سنتز و مطالعه لیگاندهای بازشیف چهاردندانه diimino و کمپلکس های آن ها معطوف شده است. جذابیت سنتز و مطالعه کمپلکس های فلزات واسطه با لیگاندهای بازشیف نامتقارن از آنجا ناشی می شود که یون فلز مرکزی در سیستم های طبیعی به صورت نامتقارن قرار دارد. این کمپلکس ها در تعداد زیادی از فرایند های شیمیایی به عنوان کاتالیست استفاده می شوند و هم چنین به عنوان مدل های بیولوژیکی برای درک ساختا...

مولکول 1و1و1-تری فلورو-5و5-دی متیل-2و4- هگزان دی اُن (tfmhd) ، بدلیل داشتن دو گروه مختلف در موقعیتهای بتا، که از نظر الکترونی خواص متفاوتی دارند، مورد جالبی برای تحقیق می باشد. بررسی تأثیر هر یک از این دو گروه با توجه به خصلت و طبیعت متفاوت آنها بر روی پایداری و ساختار هندسی صورتبندی های مختلف مولکول، و همچنین تأثیر آنها بر قدرت پیوند هیدروژنی درون مولکولی می تواند در پیش بینی خواص مولکولهای مشا...

پهنا و موقعیت نوارهای ارتعاشی مربوط به حلقه کی لیت در شکل انولی تعدادی از بتا دی کتونها و مشتقات دوتره آنها مورد بررسی قرار گرفته است . با توجه گزارشات منتشره ظاهرا با افزایش قدرت پیوند هیدورژنی شدت نوارهای v (oh) کاهش می یابد. از طرفی تناقضاتی نیز در تعیین بعضی از این نوارها نظیر ارتعاش داخل صفحه oh گزارش شده است . به نظر می رسد این شیوه ارتعاشی در زیر سایر شیوه ها نظیر v (co) یا v (cc) مخفی ش...

پیوند بریلیومی نوعی از پیوندهای غیرکوالانسی است که میان بریلیوم و یک گروه الکترون دهنده ایجاد می گردد. پژوهش های پیشین نشان می دهد این پیوندها بسیار شبیه پیوندهای هیدروژنی، بویژه پیوندهای هیدروژنی بسیار قوی (vshb) می باشند. در این پایان نامه، برای اولین بار امکان وجود نوعی خاص از پیوندهای بریلیومی که دارای انرژی برهمکنش زیاد می باشند با دو متد dft و mp2 بررسی شده است. برای این کار، ابتدا سیستم ...

چکیده : در این پروژه تشکیل پیوند هیدروژنی بین تیواترهای حلقوی با hx (x=f, cl, br, cn) مورد بررسی قرار گرفته است. بررسی ها نشان می دهد که به ازای x=f کمپلکس تشکیل شده از بقیه x ها پایدارتر است و همچنین حلقه 5 ضلعی از دیگر حلقه های 3، 4 و 6 ضلعی پایدارتر می باشد و پارامترهای دراگو-ویلند هم مورد بررسی قرار گرفت. و بین آنها رابطه ی خطی وجود نداشت. همچنین در این پروژه برای کمپلکس های پیوند هیدروژنی...

مایعات یونی به عنوان حلال های آلی بی ضرر برای محیط زیست، دسته جالبی از حلال های قابل کنترل در زمینه زیست فناوری می باشند. اثر دو مایع یونی، 1-آلیل 3-متیل ایمیدازولیوم کلراید و 1-اکتیل 3-متیل ایمیدازولیوم کلراید روی ساختار و فعالیت آنزیم آدنوزین دآمیناز توسط طیف سنجی فلورسانس و uv-vis دربافر فسفات50میکرو مولار با 7 ph=و دمای 37 درجه سانتیگراد بررسی شد و با نتایج مطالعات دینامیک مولکولی و اتصال م...

ما یافته های خود را در ارتباط با انرژی های نسبی، خواص هندسی و قدرت پیوند هیدروژنی درون-مولکولی بیست صورت بندی مولکول 3-هیدروکسی پروپ-2- اِن سلنال (hps) را توسط روش های شیمی کوانتومی (dft, iefpcm, scipcm) گزارش کردیم. اثرات حلال توسط مدل های پیوستار قطبش پذیر (pcm, iefpcm, scipcm) در سطح b3lyp تخمین زده شده است. پارامترهای هندسی محاسبه شده و تجزیه و تحلیل صورت بندی در فاز گاز بیان کننده ی این است...

هنگامی که نقاط جوش هیدرورهای عناصر گروه 5-ب ، 6-ب و 7-ب از جدول تناوبی را مقایسه کنیم ترقی نقطه جوش آنها به موازات افزایش وزن مولکولی تائید می گردد مگر برای هیدرور نخستین عنصر هر گروه که بین مولکولهای آنها چسبندگی بیش از انتظار می باشد . در این سه مورد در مولکول هیدرور یک اتم هیدروژن متصل به اتم بسیار الکترونگاتیف موجود است ازاین رو الکترونهای سازنده اتصال به سوی اتمهای فلوئور ، اکسیژن یا ازت...