امروزه بررسی پارامترهای شیمی فیزیکی برهم کنش ماکرومولکول های زیستی با برخی از مولکول های کوچک در بدن، مانند عوامل دارویی و عوامل تشخیصی، می تواند نقش بسیار مهمی در طراحی و سنتز داروهای جدید داشته باشد.سرم آلبومین ها یکی از فراوانترین پروتئین ها در سیستم گردش خون در بدن می باشند که تاکنون مطالعات بسیار زیادی در مورد برهم کنش این پروتئین ها با مواد مختلف صورت گرفته است. در این رساله سعی بر آن ش...

پارامترهای پیوندی در برهمکنش سرم آلبومین انسانی با سریم سولفات، سولفات آهن،سولفات مس، آسپرین و تئوفیلین با استفاده ازتئوریهای شبیه سازی و داکینگ مولکولی به دست آمده است. با تحلیل نتایج به دست آمده از این اتصالات، پارامترهایی مانند انرژی اتصال، ثابت بازدارندگی، انرژی بین مولکولیو پارامترهای پیوندی دیگر به دست آمد.مقایسه نتایج شبیه سازی با داده های تجربی گزارش شده، تطابق خوبی را بین نتایج تجربی و...

در این پایان نامه طراحی چند نانو سوئیچ بر پایه ترکیبات متاهتروفان ارائه شده است. متاهتروفان ها ترکیباتی هستند که از دو حلقه ی هتروآروماتیک تشکیل شده اند و دو موقعیت متا از این حلقه ها توسط زنجیرهای آلیفاتیک به یکدیگر متصل شده اند. این ترکیبات شیمی فضایی جالبی داشته و در برخی موارد شاخه های جانبی متصل کننده ی حلقه های آروماتیک در جهت های مختلفی نسبت به هم دیگر قرار می گیرند و در اثر کشش حلقه ی م...

در این پروژه ساختار تمامی هم صورت های مدل ملکولی c4h4o2w در روش های hf، b3lyp و mp2 و با تابع پایه 6-311++g(d,p) بهینه شده اند، نتایج محاسبات نظری نشان داد که مدل ملکولی (w=s,se) c4h4o2wدارای12هم صورت حاوی پیوند هیدروژنی درون ملکولی می باشد که این هم صورتها به دو خانوادهc4h4o2s c4h4o2se) ) تقسیم شده اند. در بین تمامی هم صورت های موجود هم صورتهای bt و bc به عنوان پایدارترین،در هر خانواده به د...

در این پروژه یک پلیمر قالب مولکولی برای پیش تغلیظ وتعیین مقدار داروی کلوزاپین سنتز گردید.در این روش ابتدا یک پلیمر آنیلین-فرمالدئیدخطی سنتز می شود سپس با استفاده از آنیلین به عنوان اتصال دهنده عرضی وآمونیوم پراکسی دی سولفات به عنوان آغازگروکلوزاپین به عنوان مولکول هدف در محلول اسید کلریدریک ?سنتز پلیمر قالب مولکولی انجام می شود.سنتز فوق به روشهای آنالیز عنصری(chn) –طیف سنج تبدیل فوریه مادون قرم...

در حال حاضر روش‌های in silico یکی از کم هزینه‌ترین و سریعترین روش‌های موجود جهت طراحی و کشف دارو در زمینه درمان محسوب می گردد. در این مطالعه ما علاقه‌مند شدیم تا با انجام طراحی محاسباتی دارو به روش داکینگ مولکولی ترکیباتی را معرفی کنیم که نقش موثری در مهار پلی‌مریزاسیون توبولین‌ها به عنوان عوامل اصلی تقسیم سلولی در تومورهای سرطانی دارند. بدین منظور ترکیبات کرومنی که توسط محققین مختلف خواص ضد سر...

تشکیل ساختارهای آمیلوئیدی به دلیل ایجاد بیماری‌هایی مانند آلزایمر، پارکینسون، و دیابت نوع 2، مورد توجه محققان است. از جمله مهارکننده‌های مهم، حلقه‌های ایندولی می‌باشند. مطالعات تجربی بر روی دو نوع ترکیب بیس ایندولی نشان داده است که ترکیب بیس ایندولیل 2-متیل فنیل متان (BI2MPM) مهارکننده‌ی فیبریلاسیون آمیلوئیدی پروتئین لیزوزیم است. اما ترکیب بیس ایندولیل 3-نیترو فنیل متان (BI3NPM) قدرت مهاری چندا...

جهت بررسی مکانیسم دفاعی کلزا در مقابل سرب غلظت های متفاوت سرب (صفر ، 100 ، 200 و 400 میکرومول) از فاکتورهای سلولی همچون پروتئین و پرولین در ریشه و اندام هوایی کلزا مورد اندازگیری قرار گرفت. این طرح در شرایط آزمایشگاهی و کشت به روش هیدروپونیک با استفاده از هوگلند انجام شد. طول ریشه بر حسب میلی متر و محتوای پروتئین و پرولین در ریشه و اندام هوایی توسط دستگاه اسپکتوفتومتر (u.v) مدل 200 هیتاچی انداز...

یکی از شایع ترین بیماری های آسیب عصبی در جهان می باشد با وجود گذشت 100 سال از شناسایی بیماری آلزایمر هنوز از علت و سبب دقیق چگونگی ایجاد این بیماری کامل مشخص نیست از اصلی ترین نشانه های پاتولوژیکی این بیماری وجود تعداد زیادی پروتین تاو هایپر فسفوریله و پلاک های امیلوئیدی خارج سلولی است که از پروتئین امیلوئیدی 43 اسید امینه تشکیل شده طی پروسه اندوپروتئولیک توسط انزیم بتا سکرتاز بروی پروتین پیش س...

در نظر گرفتن نفوذ ملکولی همزمان با گرادیان فشاری در محیط متخلخل معمولاً به صورت جریان چند مکانیزمی خوانده می‌شود. نفوذ ملکولی پدیده‌ای است که خواه ناخواه به همراه گرادیان فشاری در مخزن اتفاق می‌افتد و در بیشتر مواقع اثر آن در شبیه‌سازی مخازن منظور نمی‌شود که دلیل آن به غالب بودن مکانیزم گرادیان فشاری برمی‌گردد. اما در بعضی از مخازن صرف نظر کردن از نفوذ مولکولی در شبیه‌سازی، منجر به پیش‌بینی رفتا...