الگوریتم های زیادی جهت جستجوی توالی پروتئین ها ایجاد شده است که از متدولوژی و پروتکل های مختلفی جهت محاسبه تشابه توالی ها استفاده می کنند. در این پایان نامه، تبدیل موجک گسسته هار که از سرعت و کارایی بالا در انجام محاسبات برخوردار است به کار گرفته شده و الگوریتم جستجوی الفبایی با استفاده از برنامه نویسی پویا، جهت محاسبه تشابه پروتئین ها طراحی و ارائه شده است. بی شباهت به blast، که یک ابزار جستجو...

یافتن ژن ها در میان توالی های ژنومی و تحلیل و مقایسه ی آن ها جهت پیش بینی ساختار پروتئین یکی از مهمترین مباحث علم بیوانفورماتیک است. در این پایان نامه به تحلیل و مقایسه ی توالی های ژنومی و تشابه آمینواسیدها پرداخته شده است. برای این منظور فضای پلی نوکلئوتید فازی و برخی از ویژگی های ان معرفی شده است و سپس توای های ژنومی جهت پیدا کردن درجه تشابه و تفاوتشان تحلیل و مقایسه شده اند. سپس با استفاده ا...

استفاده از نشانگرهای مولکولی به ویژه ریزماهواره ها به دلیل دقت بالای آنها در مطالعة ژنوم درختان میوه از اهمیت زیادی برخوردار است. در این پژوهش برای ارزیابی روابط ژنتیکی 68 رقم و ژنوتیپ بادام داخلی و خارجی از 22 مکان ریزماهواره استفاده شد. dna ژنومی از بافت های برگی جوان استخراج و واکنش های pcr با استفاده از 22 مکان انتخاب شده (از بین100عدد مکان) ریزماهواره روی آن انجام شد. از مکان های بررسی شده...

زمینه و هدف: در سال های اخیر مطالعات متعددی بر روی سموم حیوانات و حشرات برای یافتن مولکول هایی با خواص دارویی انجام شده است. سموم عقرب دارای مولکول های کوچکی با خواص زیستی و دارویی مختلف می باشند. یکی از این توکسین ها پپتید آنتی تومور- ضددرد (AGAP) است که در درمان سرطان و تسکین درد موثر می باشد. در این مطالعه تحقیقی به تعیین توالی و بررسی های بیوانفورماتیکی ژن کدکننده ی پپتید شبه AGAP از عقرب ز...

سابقه و هدف: سیستم های SOS مهم ترین نقش را در تحمل شوری گیاه دارد. این سیستم در آرابیدوپسیس تالیانا به عنوان یک سیستم پیام رسانی سلول در مسیرهای تحمل به تنش شوری عمل می‌کند. مواد و روش ها: در این تحقیق با بررسی توالی ژن sos1 در آرابیدوبسیس از پایگاه Tair، EBI، NCBI، plantcare وEXPASY و هم چنین جهت بررسی روابط این ژن در سیزده گونه گیاهی مختلف، میزان همولوژی آن ها از لحاظ میزان تشابه با نرم افز...

نمونه هایی از سه گونه دنبلان کوهی از مناطق مختلف جغرافیایی ایران جمع آوری شد. منطقه its شامل ژنs 8/5 از rdna با استفاده از آغازگرهای عمومی its4 وits1  تکثیر و توالی یابی شد. توالی های به دست آمده با سایر آرایه های معتبرِ مستخرج از بانک ژن مقایسه شد. در میان 12 نمونه مطالعه شده، هفت جدایه با نمونه های terfezia claveryi گزارش شده توسط سایر محققان، مطابقت داشت. نمونه های t. claveryi ایرانی به طور م...

زمینه و هدف: در سال های اخیر نوروتوکسین های عقرب از لحاظ خواص دارویی و اثرات فیزیولوژیک مورد مطالعات زیادی قرار گرفته اند. یکی از این توکسین ها که توجه زیادی را به خود جلب کرده است، کلروتوکسین می باشد که هم اکنون در درمان سرطان های مغز مورد استفاده قرار می گیرد. این مطالعه با هدف تعیین توالی و بررسی مقایسه یی بیوانفورماتیکی cDNA کد کننده پپتید شبه کلروتوکسین از عقرب زرد ایرانی انجام شد. روش برر...

سابقه و هدف: سیستم های sos مهم ترین نقش را در تحمل شوری گیاه دارد. این سیستم در آرابیدوپسیس تالیانا به عنوان یک سیستم پیام رسانی سلول در مسیرهای تحمل به تنش شوری عمل می کند. مواد و روش ها: در این تحقیق با بررسی توالی ژن sos1 در آرابیدوبسیس از پایگاه tair، ebi، ncbi، plantcare وexpasy و هم چنین جهت بررسی روابط این ژن در سیزده گونه گیاهی مختلف، میزان همولوژی آن ها از لحاظ میزان تشابه با نرم افزار...

cdna نمیوپسین ( فتوپروتئین وابسته به کلسیم ) از یک شانه دار تولید کننده نور بنام نمیوپسیس لیدی کلون، بیان، تخلیص، تعیین توالی و تعیین هویت شد. این cdna از 621 جفت باز تشکیل شده است که یک پروتئین 206 اسید آمینه ای را کد می نماید. cdnaی کد کننده نمیوپسین از نمیوپسیس لیدی در e. coli بیان وسپس تخلیص شد که یک باند منفرد را با وزن مولکولی 27 کیلو دالتون روی ژل sds-page نشان داد. بعد از آماده سازی نمی...