mohammad mehdi Ranjbar

Department of Viral Animal Diseases, Razi Vaccine and Serum Research Institute, Agricultural Research, Education and Extension Organization, Karaj, Iran

[ 1 ] - Analysis of variations, structures, and phylogenic characteristics of bovine leukocyte antigen DRB3 exon2

Bovine leukocyte antigen (BoLA) DRB3 is a highly polymorphic gene in major histocompatibility complex(MHC) class II that plays a central role in immune responses and production factors. As of yet, molecular andevolutionary characteristics of BoLA-DRB3.2* have not been as fully understood as human and mouse.Therefore, we attempted to analyze variability and phylogeny of BoLA-DRB3.2* and illustra...

[ 2 ] - First report of Gallibacterium isolation from layer chickens in Iran

Gallibacterium, a gram-negative coccobacillus, is a genus of the Pasteurellaceae family with capability of infecting a wide range of avian host species. In 2003, Gallibacterium was selected instead of different previous names. Four different species has been recognized in Gallibacterium genus so far. Members of the genus can cause a wide range of pathological lesions, from upper respiratory tra...

[ 3 ] - Molecular evaluation of M2 protein of Iranian avian influenza viruses of H9N2 subtype in order to find mutations of adamantane drug resistance

Background: The H9N2 subtype of influenza A viruses is considered to be widespread in poultry industry. Adamantane is a group of antiviral agents which is effective both in prevention and treatment of influenza A virus infections. These drugs inhibit M2 protein ion channel which has role on viral replication. OBJECTIVES: The main objective of this study is to evaluate M gene of avian influenza ...

[ 4 ] - Phylogenetic analysis of HSP70 gene of Aspergillus fumigatus reveals conservation intra-species and divergence inter-species

Aspergillus fumigatus is a saprophyte fungus, widely spread in a variety of ecologicalniches and the most prevalent aspergilli responsible for human and animal invasiveaspergillosis. The first step to develop novel and efficient therapies is the identificationand understanding of the key tolerance and virulence factors of pathogens. The mainfocus of the present study is to perform the similarit...

[ 5 ] - مطالعه تنوع ژن BuLA-DRB3 در گاومیش رودخانه ای خوزستان

زمینه مطالعه: مجتمع اصلی سازگاری نسجی (MHC) شامل گروهی از ژن‌ها است که نقش مهمی در پاسخ‌های ایمنی دارند. اگزون 2 از ژن BuLA-DRB3 بخشی از MHC کلاس 2 در گاومیش است که تنوع بسیار بالایی داشته و آلل‌های آن با مقاومت/حساسیت به بیماریها و همچنین با خصوصیات تولیدی مرتبط هستند. هدف: شناسایی تنوع ژن BuLA-DRB3 در گاومیش‌های خوزستان و مقایسه آن با سایر جمعیت‌های گاومیش ایران و جهان. روش کار: نمونه‌های ...

[ 6 ] - بررسی ایمونوانفورماتیکی پروتئین تروپومیوزین کنه بوافیلوس

زمینه مطالعه: کنه بوافیلوس‌ ‌سبب انتقال برخی از اجرام پاتوژن و کاهش تولید در گاو می‌شود. پروتئین تروپومیوزین، تنظیم گر فعالیت اکتین بـوده و نقـش مهمـی در واکنش‌های ایمنی، آلرژی و تهیه واکسن دارد. هدف: روش‌های مرسوم شناسایی دقیق شاخص‌های آنتی ژنتیک (اپی توپ‌ها)، طاقت فرسا، زمان بر و پرهزینه است، لذا توجه ما در این مطالعه به سمت توسعه روش‌های سریع تر نظیر پیشگویی اپی توپ‌های احتمالی مورد شناسایی...

[ 7 ] - کاربرد دینامیک مولکولی در طراحی پیشرفته فرآورده‌های بیولوژیک و مطالعه پروتئین اجرام عفونی

شبیه‌سازی دینامیک مولکولی (MD) دانشی است که از ترکیب علوم زیستی، شیمی و روش‌ها و الگوریتم‌های متنوع رایانه‌ای-ریاضیاتی استفاده می‌کند. این تکنیک جهت طراحی پیشرفته دارو، واکسن، آنتی‌بادی، پروتئین یا پپتید و سایر ماکرو و میکرو مولکول‌های اجرام عفونی یا غیر عفونی و مواد بکار برده می‌شود. شکوفایی و تحول روزافزون این زمینه‌ از علم بیوانفورماتیک در طراحی و ساخت فوق پیشرفته فرآورده‌های بیولوژیک و دارو...

[ 8 ] - دانش نوین بیوانفورماتیک آنتی‌بادی‌ها جهت اکتشافات دارو - درمانی و تشخیصی

چکید‌ه از زمان پیدایش آنتی‌بادی‌های مونوکلونال (mAbs) انقلابی در پزشکی در زمینه کیت‌های تشخیصی و داروهای درمانی رخ داده است. یکی از زمینه‌های پیشرفته و رو به ترقی روزافزون در حوزه علم ایمونوانفورماتیک، بیوانفورماتیک آنتی‌بادی‌ها می‌باشد. این زمینه شامل: طراحی آنتی‌بادی، مدلینگ به روش‌های مختلف، بهینه‌سازی و بلوغ افینیتی، داکینگ(Docking)، انسانی‌سازی و کاهش ایمنی‌زایی، پایداری، رفع عیوب مخرب ساخ...

[ 9 ] - لیز سلول‌های سرطانی با روش ویروس‌های درمانی انکولتیک (Oncolytic Virotherapy)

سرطان همچنان مهم‌ترین عامل مرگ انسان به شمار می‌آید. بسیاری از درمان‌های شیمیایی و پرتودرمانی فاقد اختصاصیت کافی بر روی سلول‌های سرطانی بوده و در مواردی دارای اثرات جانبی بر روی سایر سلول‌ها نیز می‌باشند. پیشرفت‌های شگرف علم امروز در درمان سرطان باعث افزایش امید به درمان سرطان‌های مقاوم و لاعلاج انسانی شده است. هدف از این مقاله ارائه کاربردها و پیشرفت‌های نوین در استفاده از ویروس‌های انکولیتیک ...

[ 10 ] - بررسی تغییرات ساختاری و فیلوژنتیک ناحیه DQA ازMHC کلاس II گاو

پروتئین BoLA-DQA، ناحیه‌ای با چندشکلی بسیار بالا در کلاس MHC-II است که نقش مهمی در پاسخ‌های ایمنی، حساسیت و مقاومت به بیماری‌ها، واکسیناسیون و فاکتورهای تولیدی ایفا می‌کند. در این مقاله جنبه‌های تغییرپذیری ساختاری و فیلوژنتیک لوکوسBoLA-DQA شناسایی شد. توالی پروتئینی آلل‌های BoLA-DQA از پایگاه داده‌ها استخراج گردید. پلات تغییرپذیری برای 60 آلل با استفاده از روش آنتروپی پلات شانون از روی همردیفی ...

[ 11 ] - مطالعه اثرات سرکوب‌گری باکتری پاستورلا مولتی سیدا (B:۲ (Pasteurella multocida بر روی لنفوسیت‌های گوساله

سپتی سمی هموراژیک، بیماری حاد گاو و گاومیش در کشورهای گرمسیری است که به وسیله کوکوباسیل گرم منفی به نام پاستورلا مولتی‌سیدا سروتایپ B:2 ایجاد می‌شود. شواهد آزمایش پیشین بر روی گاو، دال بر سرکوب پاسخ ایمنی پس از چالش بوده و در مطالعه حاضر جهت بررسی مقدماتی یافته مذکور، آزمایش‌های in-vitro با استفاده از عصاره پاستورلا و سلول‌ها ی تک هسته‌ای خون محیطی (PBMC) گاوی طراحی گردید تا آثار احتمالی سرکوب‌...

[ 12 ] - Production of a Human Recombinant Polyclonal Fab Antivenom against Iranian Viper Echis carinatus

Venomous snakebite is a life-threatening injury in many tropical and subtropical areas including Iran. The gold standard treatment option for human envenomation is the use of antivenoms. Despite the unique effects of horse-derived antivenoms on the treatment of snakebite, they are not fully perfect and need improvements. In this study, human recombinant Fab fragment antivenom was produced in Ro...

[ 13 ] - چشم انداز امید بخش درمان سرطان با تکیه بر خواص منحصر به فرد پروتئین آپوپتین از ویروس کم خونی ماکیان(Chicken anemia virus (CAV)

سرطان از مهمترین عوامل مرگ انسان به شمار می آید. بسیاری از درمان های شیمیایی و پرتودرمانی فاقد اختصاصیت کافی برروی سلول های سرطانی بوده و دارای اثرات جانبی بر روی سایر سلولها نیز می باشند. پیشرفت های شگرف علم امروز در درمان سرطان باعث افزایش امید به درمان سرطان های مقاوم و ناعلاج انسان شده است. با تکیه بر درک تازه انسان از نحوه پاتوژنز ملکولی سرطان ها می توان دارهای جدید نظیر نانوبادی ها و آنتی...

[ 14 ] - Designing a polytopic complex vaccine candidate against Gallibacterium anatis: an In-silico study

The haemolytic biovar of Gallibacterium anatis (G. anatis) is responsible for urogenital, gastrointestinal, and respiratory diseases in chickens. There are numerous reports on the resistance of G. anatis to antibiotics and recurrence of the disease, which raise concerns about antimicrobial treatment efficiency. Vaccination has been considered as the most feasibl...

[ 15 ] - Novel Applications of Immuno-bioinformatics in Vaccine and Bio-product Developments at Research Institutes

There are many challenges in the field of public health sciences. Rational decisions are required in order to treat different diseases, gain knowledge and wealth regarding research, and produce biological or synthetic products. Various advances in the basic laboratory science, computer science, and the engineering of biological production processes can help solve the occurring problems. Bioinfo...

[ 16 ] - Phylogenetic Analysis of bor Gene in an Escherichia coli Strain 1378 (O78:K80) Isolated from an Avian Colibacillosis Case in Tehran, Iran

Colibacillosis is known as a fatal bacterial disease resulting in a high level of commercial loss worldwide. This study amid to elucidate the sequence, genetic characteristics, and phylogeny of the bor gene in Escherichia coli (E. coli) strain c1378 (O78:K80) isolated from avian colibacillosis in Iran and develop a rapid and optimal polymerase chain reaction (PCR) mol...

[ 17 ] - Analysis and Professional Designing of COBRA (Computationally Optimized Broadly Reactive Antigen) Vaccine for Bm86 midgut Protein of R. microplus and R. annulatus Ticks

Introduction: The cattle tick Rhipicephalus spp. causes significant economic losses due to diseases in animals and human. Bm86 is a midgut protein and vaccine candidate, which its sequences among the isolates of Ripsephalus spp are geographically separated, variable, and are the main reason for reducing effectiveness, and subsequently, the failure of the recombinant vaccines. Method: In this bi...

[ 18 ] - Analysis and Professional Designing of COBRA (Computationally Optimized Broadly Reactive Antigen) Vaccine for Bm86 midgut Protein of R. microplus and R. annulatus Ticks

[ 19 ] - FDA approved drugs repurposing of Toll-like receptor4 (TLR4) candidate for neuropathy

Accumulating evidence indicates that toll-like receptor 4 (TLR4) plays a critical role in promoting adaptive immune responses and are definitively involved in the expansion and maintenance of the neuropathic pain. However, the application of docking in virtual-screening in silico methods to drug discovery has some challenge but it allows us to make the directed and meaningful design of drugs fo...

[ 20 ] - FDA approved drugs repurposing of Toll-like receptor4 (TLR4) candidate for neuropathy

[ 21 ] - شناسایی پروتئین GPR15 به عنوان کورسپتور پیشنهادی جدید جهت اتصال پذیرنده IZUMO (پروتئین الحاق اسپرم به تخمک) به JUNO با یکپارچه سازی سیستم بیولوژی، مدل سازی و داکینگ مولکولی

مقدمه: جهت لقاح، پروتئین سطحی اسپرم به نام "IZUMO” به عنوان لیگاند برای میانکنش با JUNO (یا رسپتور ایزومو(IZUMO1R)) ضروری است. میانکنش:IZUMO1R/JUNOIZOMO1 یک مرحله حیاتی چسبندگی بین اسپرم و اووسیت در اتصال و فیوژن غشای پلاسمائی است البته جهت فیوژن سلولی کافی نمی‌باشد و پذیرنده‌های دیگری نیز در این اتصال نقش دارند. در این تحقیق G protein-coupled receptor 15 (GPR15) به عنوان شریک دیگر میانکنش اسپر...

نویسندگان همکار

Karimi, Gholamreza 7

S. Ataei 6

G. Nikbakht Brujeni 4

Yazdansetad, Sajjad 2

Ali Dabbagh 2

Ali Golchin 2