امروزه باتوجه به گسترش روزافزون اطلاعات و پیشرفت¬هایی که در زمینه¬های پزشکی صورت گرفته است، استفاده از روش¬هایی که بتوان سرعت انجام کار و دقت را افزایش و هزینه آزمایش¬ها را کاهش داد؛ امری غیرقابل اجتناب است. با استفاده از تکنولوژی ریزآرایه¬ها می¬توان میزان بیان چندین هزار ژن را اندازه گرفت. از چالش¬هایی که برای تجزیه و تحلیل داده¬های ریزآرایه با آن روبرو هستیم، تعداد زیاد ژن¬ها در این مجموعه دا...

پس از آن که در سال 1996 سشنا تکنولوژی ریزآرایه را کشف کرد، به یک باره حجم انبوهی از داده های مربوط به ژن انسان در اختیار محققین قرار گرفت. همین امر سرآغاز ایجاد شاخه ی جدیدی در علم بیوانفورماتیک برای تشخیص بیماری ها بویژه سرطان گشت. محققین توانستند با تحلیل داده های ریزآرایه و کلاس بندی ژن ها به نتایج مقبولی در زمینه ی تشخیص انواع مختلف سرطان برسند اما همچنان با چالش تعداد بسیار زیاد ویژگی های ...

استفاده از روش های مهندسی ژنتیک و ژنتیک مولکولی برای افزایش کمی و کیفی محصولات از یک سو و کاهش هزینه ها و زمان تولید از سوی دیگر، در شاخه های گوناگون کشاورزی بسیار ارزشمند گردیده است. وارد کردن ژن های گوناگون مربوط به صفات مختلف به ده ها گونه جهت اصلاح یا بهبود فرآورده های کشاورزی و کنترل آفات زیستی، تنها نمونه های کوچکی از کاربردهای گسترده گیاهان تراریخته را شامل می شوند. از مشکلات تولید گیاها...

وجود داده‌های گمشده در داده‌های ریزآرایه، سبب کاهش دقت رسم شبکه‌های تنظیمی ژن، ایجاد اشتباه در خوشه بندی و تقسیم‌بندی تخصصی ژن‌ها و سایر تحلیل‌ها می‌شود. بنابراین تخمین داده-های گمشده مرحله مهمی در پیش پردازش داده‌های ریزآرایه، محسوب می‌شود. عملکرد الگوریتم-های تخمین در مجموعه داده‌های مختلف و با درصدهای متفاوت گمشدگی، متغیر است. همواره انتخاب مناسب‌ترین الگوریتم به منظور دستیابی به بیشترین دقت...

چکیده بیماری سپتوریوز یکی از مخرب ترین بیماری های برگی گندم در سراسر جهان است که سالانه خسارت های زیادی به بار می آورد. در حال حاضر استفاده از ارقام مقاوم و سموم شیمیایی دو روش اصلی کنترل این بیماری هستند. روش هایی زیادی جهت شناسایی ژن های مقاوم در منابع ژنتیکی وجود دارد اما اخیرا تکنیک ریزآرایه به عنوان یک روش قدرتمند جهت ارزیابی بیان ژن ها به طور هم زمان مورد توجه قرار گرفته است. جهت شناسایی...

واکاوی موازنه شار یک روش ریاضی با رویکرد مدل‏سازی بر پایه محدودیت به‏منظور تجزیه و تحلیل شارهای سوخت‏و‏سازی از طریق شبکه‏های سوخت‏و‏سازی مقیاس ژنوم است. یکی از ضعف‏های fba این است که محدودیت‏های تنظیمی در آن لحاظ نشده است و بسیاری از اشتباهات در پیش‏بینی‏های انجام شده توسط این روش به دلیل فقدان محدودیت‏های تنظیمی است. بنابراین، طی سال های اخیر به منظور بهبود قابلیت پیش بینی روش واکاوی موازنه شا...

بیان ژن، پدیدهای حیاتی در سایر موجودات زنده میباشد. ارزیابی این پدیده میتواند در سه سطح کلی ترنسکریپتومیکس، پروتئومیکس و متابولومیکس انجام گیرد. از ارزشمندترین روشها در سطح ترنسکریتومیکس، تکنولوژی ریزآرایهها بوده که قادرند بیان دهها هزار ژن را بطور همزمان اندازهگیری کنند. اما آزمایشات ریزآرایه، از ابتدا تا انتها، در معرض تغییرات ناخواسته ای بوده که ناشی از بایاسها یا ناهماهنگیهای آزمایشگاهی و ت...

  سابقه و هدف: تحلیل خانواده ژنی داده‌های ریزآرایه، مسیرهای بیولوژیکی یا خانواده‌های ژنی که بین فنوتیپ‌های مورد نظر بیان متفاوتی دارند، را شناسایی می‌کند. بر خلاف تحلیل مبتنی بر ژن‌های منفرد، تحلیل خانواده‌های ژنی دانش بیولوژیکی موجود روی ژن‌ها را برای بررسی تفاوت بیان ژنی بین فنوتیپ‌ها به کار می‌گیرد. در این مطالعه به مقایسه دو روش تحلیل خانواده‌های ژنی پرداخته می‌شود. مواد و روش‌ها: از ...

ریزآرایه تکنولوژی پیچیده و مرکبی است که در زیست شناسی و طب کاربرد دارد. این تکنولوژی برای بررسی سطح بیان هزاران ژن بصورت همزمان کاربرد دارد. یک تراشه ی ریزآرایه شامل هزاران نقطه ی بسیار ریز از الیگونوکلئوتیدها به نام ویژگی ها می باشد. الیگونوکلئوتیدها توسط روبات در سطرها وستون ها آرایش یافته نصب می شوند. انتخاب تعداد کمتری از ویژگی ها یا ژن ها برای تشخیص و پیش بینی نتیجه ی یک بیماری در این راست...

امروزه استفاده از اطلاعات ژنتیکی افراد در تشخیص و رده بندی انواع بیماری ها از جمله سرطان ها، مورد توجه قرار گرفته است. یکی از بهترین و دقیق ترین روش ها در این زمینه، بررسی مقادیر بیان ژنی در افراد مختلف توسط فناوری ریزآرایه می باشد. یکی از مشکلات داده های ریزآرایه کم بودن تعداد نمونه ها در مقایسه با تعداد ژن ها است. این مسیله سبب کاهش دقت رده بندی و افزایش هزینه های محاسباتی و آزمایشگاهی می شود...